More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3035 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_3035  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 
224 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.738115  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  57.6 
 
 
226 aa  231  6e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.15 
 
 
228 aa  222  4e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  53.21 
 
 
226 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1005  cyclic nucleotide-binding  52.29 
 
 
226 aa  218  7e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  50.46 
 
 
225 aa  217  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4596  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  53.92 
 
 
230 aa  214  8e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  50.46 
 
 
224 aa  211  7.999999999999999e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  40.38 
 
 
243 aa  161  7e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1951  Crp/FNR family transcriptional regulator  43.16 
 
 
222 aa  154  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.861655  normal  0.0267012 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4520  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.79 
 
 
236 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0894  cyclic nucleotide-binding  35.68 
 
 
226 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0027  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.56 
 
 
237 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3367  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.87 
 
 
230 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7045  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.61 
 
 
237 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601598  normal  0.0108856 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4353  CRP/FNR family transcriptional regulator  36.04 
 
 
227 aa  126  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3511  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.53 
 
 
233 aa  125  7e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.78 
 
 
228 aa  123  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2706  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.94 
 
 
228 aa  122  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154877  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  34.29 
 
 
226 aa  122  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2102  CRP/FNR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
227 aa  122  5e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.94 
 
 
236 aa  121  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.8 
 
 
225 aa  119  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.65 
 
 
228 aa  119  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.26 
 
 
225 aa  119  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2918  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.89 
 
 
226 aa  119  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172063  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  33.33 
 
 
225 aa  118  6e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4483  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.86 
 
 
243 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.1 
 
 
242 aa  117  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4617  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.86 
 
 
243 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.652735  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  33.33 
 
 
225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.6 
 
 
224 aa  116  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  32.7 
 
 
224 aa  116  3e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01902  putative transcription regulator protein  35.91 
 
 
239 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980965  normal  0.145891 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2565  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.21 
 
 
235 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0695171  normal  0.0307054 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1929  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.68 
 
 
235 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.589711  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2541  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.68 
 
 
235 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000812643  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  33.33 
 
 
228 aa  115  6e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.77 
 
 
223 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.56 
 
 
220 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.86 
 
 
226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1169  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
227 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0303416  normal  0.0506186 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  33.33 
 
 
225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0199  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
227 aa  112  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5872  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.62 
 
 
235 aa  113  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.142608  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.67 
 
 
225 aa  113  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4881  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.87 
 
 
278 aa  112  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.484233  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03580  putative transcriptional regulator  36.06 
 
 
228 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000980911  hitchhiker  0.0000000000977836 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0351  putative transcriptional regulator  36.06 
 
 
228 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2459  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.74 
 
 
235 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000341213 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2665  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.24 
 
 
239 aa  112  6e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0675619  normal  0.290328 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3062  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.69 
 
 
232 aa  111  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.83 
 
 
227 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2589  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.27 
 
 
235 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0679634  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.37 
 
 
219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0775  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.53 
 
 
237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.15 
 
 
235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.027549  normal  0.149867 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.64 
 
 
224 aa  108  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.25 
 
 
225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3408  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.85 
 
 
243 aa  108  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.258046 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.33 
 
 
248 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  32.24 
 
 
226 aa  108  8.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2016  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.84 
 
 
229 aa  107  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776172  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4045  GntR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
260 aa  105  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.385107  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.85 
 
 
251 aa  105  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1092  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.48 
 
 
234 aa  105  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3427  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.55 
 
 
223 aa  105  6e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0598833  hitchhiker  0.00496827 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  31.43 
 
 
225 aa  104  9e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.44 
 
 
225 aa  104  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.46 
 
 
226 aa  104  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0098  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.55 
 
 
234 aa  104  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.2435  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.89 
 
 
225 aa  103  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13707  Cpr/FNR family transcriptional regulator  29.72 
 
 
224 aa  103  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0333343 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2630  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.52 
 
 
239 aa  102  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00642792  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3287  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.11 
 
 
239 aa  102  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.370075  normal  0.683237 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01198  cyclic nucleotide-binding protein  29.05 
 
 
229 aa  102  6e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36130  cAMP-binding protein  31.02 
 
 
224 aa  101  8e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.758224 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5205  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.77 
 
 
224 aa  101  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  hitchhiker  0.000819508 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4818  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.77 
 
 
224 aa  101  8e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4904  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.77 
 
 
224 aa  101  8e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5435  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.77 
 
 
224 aa  101  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2266  transcriptional regulator, putative  33.8 
 
 
251 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2143  putative transcriptional regulator  33.8 
 
 
251 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1089  cyclic nucleotide-binding protein  33.8 
 
 
251 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.30583  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0747  transcriptional regulator, putative  33.33 
 
 
266 aa  101  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.59923  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0934  cyclic nucleotide-binding  33.8 
 
 
251 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.059861  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0938  cyclic nucleotide-binding protein  33.8 
 
 
251 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.914927  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.55 
 
 
224 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3445  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.27 
 
 
228 aa  99.4  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  unclonable  0.00000836213 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  28.3 
 
 
224 aa  98.6  7e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1371  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.3 
 
 
224 aa  98.6  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0955358 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1943  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.64 
 
 
239 aa  98.2  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.02 
 
 
225 aa  97.8  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.59 
 
 
227 aa  97.8  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123359  normal  0.583782 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.48 
 
 
224 aa  97.1  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.84 
 
 
226 aa  97.1  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4762  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
225 aa  97.4  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  hitchhiker  0.0000929699 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4322  cyclic nucleotide-binding  30.99 
 
 
225 aa  96.7  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0230513 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1779  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.64 
 
 
239 aa  97.4  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.72161  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>