More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1211 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1211  inner-membrane translocator  100 
 
 		 306 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50053  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3642  inner-membrane translocator  88.56 
 
 		 306 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0689323 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3999  inner-membrane translocator  77.05 
 
 		 308 aa  444  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3269  inner-membrane translocator  72.04 
 
 		 305 aa  393  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2121  inner-membrane translocator  58.61 
 
 		 306 aa  322  7e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.459721 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5128  inner-membrane translocator  55.74 
 
 		 305 aa  320  1.9999999999999998e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0570101 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0987  inner-membrane translocator  58.94 
 
 		 305 aa  315  5e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226194 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0793  inner-membrane translocator  59.45 
 
 		 306 aa  308  9e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.901447 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1991  inner-membrane translocator  54.73 
 
 		 306 aa  304  1.0000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3173  inner-membrane translocator  55.63 
 
 		 306 aa  295  5e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0071568  normal  0.950113 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2459  inner-membrane translocator  56.48 
 
 		 308 aa  286  4e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5096  inner-membrane translocator  59.06 
 
 		 303 aa  283  3.0000000000000004e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.681438  normal  0.989251 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4487  inner-membrane translocator  54.79 
 
 		 306 aa  282  4.0000000000000003e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4745  inner-membrane translocator  52.35 
 
 		 287 aa  281  9e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3829  inner-membrane translocator  55.37 
 
 		 306 aa  281  1e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1906  inner-membrane translocator  53.02 
 
 		 287 aa  278  9e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.768984 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4210  inner-membrane translocator  55.67 
 
 		 304 aa  278  1e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0596533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2236  inner-membrane translocator  59.47 
 
 		 306 aa  277  2e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1621  inner-membrane translocator  52.01 
 
 		 287 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2986  inner-membrane translocator  52.01 
 
 		 287 aa  273  3e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0359468  normal  0.478138 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0176  inner-membrane translocator  52.81 
 
 		 306 aa  270  2e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.535047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0734  inner-membrane translocator  50 
 
 		 286 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0733  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  57.91 
 
 		 305 aa  266  4e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4821  inner-membrane translocator  53.2 
 
 		 313 aa  259  4e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4609  inner-membrane translocator  56.46 
 
 		 329 aa  259  4e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4044  inner-membrane translocator  57.24 
 
 		 304 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4400  inner-membrane translocator  53.49 
 
 		 304 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1018  inner-membrane translocator  48.66 
 
 		 286 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0861  inner-membrane translocator  58.39 
 
 		 305 aa  252  7e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.220727  normal  0.159133 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1227  inner-membrane translocator  49.5 
 
 		 288 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0358415  normal  0.0652986 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4370  inner-membrane translocator  47 
 
 		 290 aa  248  8e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2771  inner-membrane translocator  48.49 
 
 		 288 aa  247  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0497861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0365  inner-membrane translocator  54.15 
 
 		 306 aa  247  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2951  inner-membrane translocator  46.58 
 
 		 315 aa  246  4e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.59787 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3134  inner-membrane translocator  51.85 
 
 		 288 aa  244  9.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4661  inner-membrane translocator  46.33 
 
 		 290 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3652  inner-membrane translocator  46.25 
 
 		 293 aa  241  2e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0078  inner-membrane translocator  48.17 
 
 		 290 aa  240  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0213  inner-membrane translocator  47.88 
 
 		 293 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1330  inner-membrane translocator  49.5 
 
 		 288 aa  238  8e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0086  inner-membrane translocator  49.5 
 
 		 290 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0635  inner-membrane translocator  50 
 
 		 306 aa  236  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3088  inner-membrane translocator  52.9 
 
 		 288 aa  232  7.000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2303  inner-membrane translocator  39.46 
 
 		 286 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0499  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  38.78 
 
 		 286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0809896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2713  inner-membrane translocator  42.14 
 
 		 283 aa  195  6e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000181558  normal  0.385193 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4182  inner-membrane translocator  41.53 
 
 		 289 aa  195  9e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0228  inner-membrane translocator  39.93 
 
 		 297 aa  194  1e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0160417  normal  0.113525 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  41.97 
 
 		 290 aa  193  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6212  inner-membrane translocator  40.33 
 
 		 286 aa  186  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  41.81 
 
 		 299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3211  inner-membrane translocator  39.33 
 
 		 285 aa  182  7e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.64226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  36.96 
 
 		 652 aa  179  4e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1174  inner-membrane translocator  41.33 
 
 		 286 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1580  inner-membrane translocator  37.25 
 
 		 288 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.647042 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1587  inner-membrane translocator  37.25 
 
 		 288 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0664  inner-membrane translocator  39.87 
 
 		 286 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2810  inner-membrane translocator  41.23 
 
 		 291 aa  175  8e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.144743  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1753  inner-membrane translocator  40 
 
 		 291 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2705  inner-membrane translocator  37.79 
 
 		 289 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.787107 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3426  inner-membrane translocator  41.98 
 
 		 300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0852  inner-membrane translocator  41.55 
 
 		 288 aa  172  6.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147102  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4558  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 288 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.815893  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1901  inner-membrane translocator  40 
 
 		 311 aa  171  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.214126 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0618  inner-membrane translocator  39.87 
 
 		 286 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0658  inner-membrane translocator  39.87 
 
 		 286 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal  0.0364428 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6024  inner-membrane translocator  38.49 
 
 		 286 aa  170  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1752  branched-chain amino acid ABC transporter, permease  39.31 
 
 		 286 aa  169  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.495502  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6329  inner-membrane translocator  37.55 
 
 		 289 aa  169  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1453  inner-membrane translocator  37.68 
 
 		 330 aa  169  5e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0626411  hitchhiker  0.000392486 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1204  inner-membrane translocator  39.13 
 
 		 282 aa  169  5e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3459  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 286 aa  169  7e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4476  branched-chain amino acid ABC transporter permease  37.79 
 
 		 285 aa  169  7e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.903087  normal  0.0213123 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6488  inner-membrane translocator  42.76 
 
 		 292 aa  169  8e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.115929  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1861  inner-membrane translocator  37.9 
 
 		 323 aa  169  8e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.221374 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1751  putative amino acid transmembrane protein  37.18 
 
 		 315 aa  168  9e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207162  normal  0.717101 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1494  inner-membrane translocator  37.68 
 
 		 330 aa  168  9e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.904999  normal  0.525314 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2653  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.83 
 
 		 311 aa  168  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0548  inner-membrane translocator  40.79 
 
 		 296 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1287  inner-membrane translocator  38.82 
 
 		 296 aa  166  5e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1449  inner-membrane translocator  38.82 
 
 		 296 aa  166  5e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.268141  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1242  inner-membrane translocator  40 
 
 		 628 aa  165  8e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3168  inner-membrane translocator  35.69 
 
 		 317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.256759 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0225  inner-membrane translocator  36.91 
 
 		 317 aa  163  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1795  branched-chain amino acid ABC transporter permease  39.69 
 
 		 286 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.363639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1935  branched chain amino acid ABC transporter permease  39.69 
 
 		 286 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1970  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.69 
 
 		 286 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000947675 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1769  branched-chain amino acid ABC transporter, permease  39.69 
 
 		 286 aa  162  6e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.53458  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1579  inner-membrane translocator  35.22 
 
 		 315 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.687848 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4819  putative ABC transporter, permease protein  36.08 
 
 		 336 aa  161  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2390  inner-membrane translocator  36.31 
 
 		 315 aa  160  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0318684  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1582  inner-membrane translocator  37.83 
 
 		 286 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0431  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  40.77 
 
 		 291 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00135798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0429  inner-membrane translocator  41.31 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.220728 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4565  inner-membrane translocator  35.24 
 
 		 315 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0477928  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1573  inner-membrane translocator  35.56 
 
 		 315 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0146  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 291 aa  159  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000678204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1294  inner-membrane translocator  39.42 
 
 		 313 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.62042  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1804  inner-membrane translocator  41.22 
 
 		 286 aa  159  6e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391263  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3557  inner-membrane translocator  39.14 
 
 		 296 aa  157  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.212819  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>