More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4003 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4003  CBS domain-containing protein  100 
 
 
140 aa  291  3e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.360398 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1312  signal transduction protein  41.91 
 
 
142 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000000202163  decreased coverage  0.000166712 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0805  CBS domain-containing protein  36.5 
 
 
172 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0413  putative signal transduction protein with CBS domains  40.44 
 
 
142 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0401079 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3313  CBS domain-containing protein  35.77 
 
 
141 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0640  CBS domain-containing protein  35.77 
 
 
141 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3483  CBS domain-containing protein  35.77 
 
 
141 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2078  CBS  40.29 
 
 
142 aa  105  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000050024  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3185  CBS domain-containing protein  35.71 
 
 
142 aa  104  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1126  putative signal transduction protein with CBS domains  39.71 
 
 
143 aa  101  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3655  CBS domain-containing protein  34.31 
 
 
141 aa  101  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3778  CBS domain-containing protein  34.31 
 
 
141 aa  101  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3588  CBS domain containing membrane protein  34.31 
 
 
141 aa  101  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0650  CBS domain-containing protein  34.31 
 
 
141 aa  101  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  37.41 
 
 
166 aa  101  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3135  CBS domain-containing protein  34.53 
 
 
141 aa  99  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0694667  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3288  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
142 aa  97.1  7e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0997819  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1330  signal transduction protein  36.69 
 
 
146 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2529  CBS domain containing protein  38.35 
 
 
146 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.48063  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0831  CBS domain-containing protein  31.39 
 
 
139 aa  96.7  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2625  CBS domain containing protein  38.35 
 
 
146 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2437  hypothetical protein  38.97 
 
 
147 aa  94.4  5e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1923  CBS domain containing protein  33.82 
 
 
154 aa  92  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0958  CBS domain-containing protein  32.59 
 
 
140 aa  91.7  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2925  CBS domain-containing protein  32.85 
 
 
139 aa  91.3  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00660702  normal  0.275882 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0909  CBS domain-containing protein  30.37 
 
 
139 aa  85.9  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000468924 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0990  acetoin utilization protein AcuB, putative  28.91 
 
 
140 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004370  putative acetoin utilization protein AcuB  34.56 
 
 
149 aa  77  0.00000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4458  CBS domain containing membrane protein  35.04 
 
 
640 aa  77  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  31.29 
 
 
148 aa  76.6  0.00000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  33.07 
 
 
210 aa  76.6  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  39.13 
 
 
162 aa  76.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0268  hypothetical protein  33.57 
 
 
169 aa  76.6  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00882605  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1915  CBS domain-containing protein  27.34 
 
 
223 aa  75.1  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.451224  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0462  acetoin utilization protein AcuB  35.54 
 
 
214 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000917116 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4777  acetoin utilization protein AcuB  35.54 
 
 
214 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4562  acetoin utilization protein AcuB  33.06 
 
 
214 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4917  acetoin utilization protein AcuB  33.06 
 
 
214 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  37.39 
 
 
162 aa  72.8  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2731  CBS domain containing membrane protein  33.33 
 
 
214 aa  73.2  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  30.08 
 
 
216 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01043  hypothetical protein  33.33 
 
 
154 aa  72.8  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  30.53 
 
 
214 aa  73.2  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3209  CBS domain-containing protein  30 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1158  CBS domain containing protein  30 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3348  CBS domain-containing protein  30 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3209  CBS domain-containing protein  30 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.549448  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1585  CBS domain containing protein  28.79 
 
 
217 aa  72  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1237  acetoin utilization protein AcuB, putative  30.28 
 
 
143 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  29.32 
 
 
216 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2811  CBS domain-containing protein  30 
 
 
143 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4803  acetoin utilization protein AcuB  33.88 
 
 
214 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2648  CBS domain containing membrane protein  36.07 
 
 
154 aa  70.5  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4495  CBS domain-containing protein  33.88 
 
 
214 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4396  acetoin utilization protein  33.88 
 
 
214 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4413  acetoin utilization protein  33.88 
 
 
214 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4799  acetoin utilization protein AcuB  33.88 
 
 
214 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  25.52 
 
 
151 aa  70.5  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4782  acetoin utilization protein AcuB  33.88 
 
 
214 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1234  CBS domain containing membrane protein  30.83 
 
 
380 aa  69.7  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1059  CBS domain-containing protein  29.58 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6852  putative signal transduction protein with CBS domains  29.85 
 
 
141 aa  69.3  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1055  CBS domain-containing protein  29.58 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.53863  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1120  CBS domain-containing protein  29.58 
 
 
143 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  30 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  29.66 
 
 
152 aa  67.8  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  27.21 
 
 
246 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  31.16 
 
 
225 aa  67.8  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  30.77 
 
 
216 aa  67.4  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2551  signal transduction protein  33.07 
 
 
220 aa  67.4  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  27.14 
 
 
152 aa  66.6  0.00000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  33.07 
 
 
216 aa  67  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  25.17 
 
 
230 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0692  CBS domain-containing protein  26.67 
 
 
636 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  28.47 
 
 
282 aa  66.2  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  27.86 
 
 
150 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  28.12 
 
 
219 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1386  CBS domain-containing protein  27.34 
 
 
211 aa  65.9  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2794  CBS domain-containing protein  25.98 
 
 
142 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.349051 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1256  signal-transduction protein  32 
 
 
210 aa  65.5  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0833  CBS domain-containing protein  32.54 
 
 
211 aa  65.5  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3337  CBS domain-containing protein  32.23 
 
 
214 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.126622  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  23.81 
 
 
246 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2268  signal transduction protein  28.68 
 
 
152 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.220391  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  23.45 
 
 
150 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1289  signal transduction protein  33.33 
 
 
153 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0768  CBS domain containing membrane protein  31.25 
 
 
138 aa  64.7  0.0000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.838909  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  29.6 
 
 
208 aa  64.3  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2076  signal-transduction protein  28.57 
 
 
202 aa  64.3  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.250965  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3228  XRE family transcriptional regulator  32.21 
 
 
158 aa  63.9  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  31.54 
 
 
232 aa  63.9  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0303  signal transduction protein  29.23 
 
 
320 aa  63.9  0.0000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123815  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  26.03 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0947  CBS domain-containing protein  31.78 
 
 
689 aa  63.9  0.0000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  22.45 
 
 
247 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1887  CBS domain containing membrane protein  27.7 
 
 
153 aa  63.5  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  28.26 
 
 
150 aa  63.9  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3355  CBS domain-containing protein  25.98 
 
 
134 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  29.69 
 
 
141 aa  62.8  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  25.68 
 
 
154 aa  63.2  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>