More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3697 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_0659  cystathionine gamma-synthase  79.95 
 
 
423 aa  644    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182054  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0693  cystathionine gamma-synthase  79.95 
 
 
423 aa  643    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0520598 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3697  cystathionine gamma-synthase  100 
 
 
405 aa  838    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3333  Cystathionine gamma-synthase  61.42 
 
 
393 aa  459  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1615  cystathionine gamma-synthase  57.36 
 
 
393 aa  459  9.999999999999999e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1401  cystathionine gamma-synthase  41.67 
 
 
392 aa  317  3e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  39.95 
 
 
394 aa  302  9e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  40 
 
 
392 aa  295  8e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  46.09 
 
 
378 aa  293  4e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  39.59 
 
 
386 aa  290  2e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  44.77 
 
 
377 aa  290  3e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  44.77 
 
 
377 aa  290  3e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  44.48 
 
 
377 aa  288  2e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  44.48 
 
 
377 aa  287  2e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  44.48 
 
 
377 aa  287  2e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  44.48 
 
 
377 aa  287  2e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  39.84 
 
 
399 aa  288  2e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  44.48 
 
 
377 aa  287  2e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  44.19 
 
 
377 aa  286  5e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  42.23 
 
 
377 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33390  cystathione gamma synthase  36.57 
 
 
433 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0131523  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  44.19 
 
 
377 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0011  methionine gamma-lyase  42.82 
 
 
401 aa  282  6.000000000000001e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4219  cystathionine beta-lyase  44.19 
 
 
377 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  43.6 
 
 
377 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  36.5 
 
 
401 aa  281  1e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  39.27 
 
 
390 aa  281  2e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0409  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.56 
 
 
396 aa  280  3e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.384656  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3411  Cystathionine gamma-synthase  41.03 
 
 
395 aa  280  3e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306787  normal  0.0474144 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2499  cystathionine gamma-lyase  37.69 
 
 
385 aa  280  4e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.722744  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2670  cystathionine gamma-synthase  38.82 
 
 
400 aa  280  4e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  39.53 
 
 
378 aa  278  1e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1383  Cystathionine gamma-synthase  41.82 
 
 
376 aa  278  2e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000104291  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2799  cystathionine gamma-synthase  40.76 
 
 
386 aa  277  2e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000029873  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0450  methionine gamma-lyase  37.09 
 
 
399 aa  276  3e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  38.87 
 
 
390 aa  276  3e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  39.29 
 
 
393 aa  275  1.0000000000000001e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  39.95 
 
 
386 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0180  Cystathionine gamma-synthase  40.71 
 
 
376 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0100206  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0293  cystathionine gamma-lyase  39.48 
 
 
380 aa  273  4.0000000000000004e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000375953  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2737  Cystathionine gamma-synthase  39.18 
 
 
391 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00149474  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  38.86 
 
 
400 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1860  cystathionine gamma-synthase  36.86 
 
 
393 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  40.47 
 
 
398 aa  272  8.000000000000001e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1288  cystathionine gamma-lyase  42.94 
 
 
379 aa  272  9e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.076956  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1668  cystathionine beta-lyase  42.09 
 
 
392 aa  272  1e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0802  cystathionine beta-lyase  42.29 
 
 
394 aa  271  1e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  38.38 
 
 
383 aa  271  2e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  35.37 
 
 
392 aa  270  4e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0673  hypothetical protein  39.89 
 
 
374 aa  270  4e-71  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000849749 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  37.98 
 
 
398 aa  269  5e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3986  Cystathionine gamma-lyase  40.97 
 
 
390 aa  269  5e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.891529 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  37.73 
 
 
398 aa  269  7e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  36.06 
 
 
390 aa  268  8.999999999999999e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  36.06 
 
 
390 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27220  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  41.01 
 
 
407 aa  268  1e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19570  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  36.93 
 
 
397 aa  268  1e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  37.66 
 
 
397 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  38.22 
 
 
383 aa  267  2e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1991  cystathionine gamma-lyase  39.77 
 
 
386 aa  267  2e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  35.81 
 
 
390 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1626  cystathionine gamma-synthase  42.49 
 
 
381 aa  268  2e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09046  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzyme  36.9 
 
 
390 aa  266  4e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.312528  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1562  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.06 
 
 
403 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.272758 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0611  Cystathionine gamma-synthase  38.1 
 
 
382 aa  265  7e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  37.41 
 
 
397 aa  265  7e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0317  Methionine gamma-lyase  39.67 
 
 
386 aa  265  7e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  35.49 
 
 
394 aa  265  8e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0312  methionine gamma-lyase  39.67 
 
 
386 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3810  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.44 
 
 
403 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1948  Cystathionine gamma-synthase  37.11 
 
 
398 aa  265  1e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00285374 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  37.41 
 
 
397 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0316  methionine gamma-lyase  39.67 
 
 
386 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2488  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.16 
 
 
383 aa  264  2e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  38.38 
 
 
402 aa  264  2e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1669  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.44 
 
 
403 aa  264  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813893  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1151  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.34 
 
 
399 aa  265  2e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1897  cystathionine gamma-synthase  36.6 
 
 
393 aa  264  2e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.769233  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2521  methionine gamma-lyase  38.21 
 
 
390 aa  264  3e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.979889  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0842  cystathionine gamma-synthase  39.14 
 
 
398 aa  263  4e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.905806  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1963  Cystathionine gamma-lyase  39.54 
 
 
392 aa  263  4e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.86057  normal  0.364371 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  36.29 
 
 
398 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3760  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.76 
 
 
403 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.192892  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2001  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.76 
 
 
403 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1535  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.76 
 
 
403 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.47488 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  39.95 
 
 
401 aa  262  6e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1903  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.8 
 
 
403 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4139  methionine gamma-lyase  40.26 
 
 
390 aa  262  8.999999999999999e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2587  Cystathionine gamma-synthase  39.43 
 
 
390 aa  262  8.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0857878 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  38.38 
 
 
378 aa  262  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2710  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.18 
 
 
403 aa  261  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2491  methionine gamma-lyase  38.56 
 
 
391 aa  261  1e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1243  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.43 
 
 
406 aa  261  1e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2049  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.09 
 
 
391 aa  261  2e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0163  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  38.05 
 
 
387 aa  261  2e-68  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.574145  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  37.94 
 
 
397 aa  260  3e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  39.3 
 
 
397 aa  260  3e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1907  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39 
 
 
389 aa  260  3e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1496  cystathionine gamma-lyase  34.95 
 
 
390 aa  260  3e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1425  Methionine gamma-lyase  33.42 
 
 
388 aa  260  3e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>