129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3480 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3480  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 318 aa  655    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2221  hypothetical protein  45.08 
 
 		 329 aa  300  2e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1591  hypothetical protein  46.77 
 
 		 344 aa  290  3e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1069  radical SAM domain-containing protein  46.45 
 
 		 321 aa  282  5.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.872388  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0073  Radical SAM domain protein  47.12 
 
 		 352 aa  282  5.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.127824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0283  Radical SAM domain protein  44.86 
 
 		 364 aa  281  7.000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.716398  normal  0.948397 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3861  Radical SAM domain protein  45.97 
 
 		 327 aa  278  8e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0750  radical SAM domain-containing protein  45.66 
 
 		 319 aa  278  1e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1763  Radical SAM domain protein  46.41 
 
 		 319 aa  277  2e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0915  Radical SAM domain protein  45.77 
 
 		 351 aa  277  2e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0305  radical SAM domain-containing protein  49.16 
 
 		 314 aa  275  8e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30480  predicted protein  44.34 
 
 		 358 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1611  radical SAM family protein  46.79 
 
 		 320 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07041  Fe-S oxidoreductase  39.67 
 
 		 310 aa  271  1e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.156574  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0638  hypothetical protein  39.8 
 
 		 310 aa  271  2e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0829  radical SAM domain-containing protein  45.14 
 
 		 351 aa  270  2e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07011  Fe-S oxidoreductases  41.04 
 
 		 314 aa  269  5e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0350076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0590  radical SAM domain-containing protein  44.63 
 
 		 317 aa  269  5.9999999999999995e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1628  putative radical SAM superfamily protein  41.25 
 
 		 320 aa  268  5.9999999999999995e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00346391  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1988  radical SAM family protein  41.9 
 
 		 328 aa  268  1e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.252976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3799  radical SAM family protein  42.86 
 
 		 335 aa  267  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06651  Fe-S oxidoreductase  39.14 
 
 		 310 aa  267  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0078  hypothetical protein  41.33 
 
 		 314 aa  265  7e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2228  Radical SAM domain protein  40.63 
 
 		 332 aa  265  7e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.419306 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1335  Radical SAM domain protein  42.11 
 
 		 337 aa  263  4e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2614  Radical SAM domain protein  37.85 
 
 		 316 aa  261  8e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1160  hypothetical protein  42.77 
 
 		 322 aa  261  1e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3751  radical SAM domain-containing protein  44.15 
 
 		 337 aa  261  1e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1925  Radical SAM domain protein  42.62 
 
 		 338 aa  261  1e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3555  Radical SAM domain protein  43.77 
 
 		 337 aa  260  2e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2457  radical SAM family protein  43.96 
 
 		 318 aa  259  3e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00277932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13125  predicted protein  43.59 
 
 		 308 aa  259  3e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.005765  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07461  Fe-S oxidoreductase  42.47 
 
 		 311 aa  259  5.0000000000000005e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.390345  normal  0.116185 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06941  Fe-S oxidoreductases  39.47 
 
 		 310 aa  256  2e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.426586  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0866  L-asparaginase II  44.16 
 
 		 314 aa  256  3e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0945  hypothetical protein  43.35 
 
 		 324 aa  256  3e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1779  L-asparaginase II  45.45 
 
 		 317 aa  256  4e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.251936  normal  0.0342174 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13341  Fe-S oxidoreductase  43.79 
 
 		 332 aa  251  9.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.761988 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05035  hypothetical protein  40.79 
 
 		 351 aa  251  2e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4113  Radical SAM domain protein  38.46 
 
 		 329 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00130178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4074  Radical SAM domain protein  38.46 
 
 		 329 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1566  radical SAM domain-containing protein  39.93 
 
 		 341 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1312  radical SAM domain-containing protein  42.28 
 
 		 335 aa  230  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1091  Radical SAM domain protein  40.13 
 
 		 319 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3171  Radical SAM domain protein  40 
 
 		 319 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0011  Radical SAM domain protein  27.08 
 
 		 338 aa  59.3  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  24.85 
 
 		 365 aa  58.5  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  28.76 
 
 		 800 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1674  Radical SAM domain protein  22.82 
 
 		 326 aa  55.1  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  29.33 
 
 		 319 aa  54.3  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1695  radical SAM family protein  27.92 
 
 		 491 aa  53.1  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.192909  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1968  Radical SAM domain protein  25.48 
 
 		 458 aa  52.8  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  27.78 
 
 		 380 aa  52.4  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  27.69 
 
 		 347 aa  52.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2319  radical SAM domain-containing protein  30.2 
 
 		 360 aa  51.2  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.111929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  29.5 
 
 		 399 aa  51.2  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  30.14 
 
 		 377 aa  50.4  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  19.29 
 
 		 565 aa  50.4  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  29.2 
 
 		 380 aa  49.7  0.00007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  22.7 
 
 		 366 aa  49.3  0.00008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  22.92 
 
 		 317 aa  49.3  0.00009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2768  molybdopterin biosynthesis, protein A  32.74 
 
 		 333 aa  49.3  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149516  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2181  radical SAM domain-containing protein  26.57 
 
 		 491 aa  48.5  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161056  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1519  radical SAM domain-containing protein  25.34 
 
 		 422 aa  48.5  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0763  radical SAM family protein  24.16 
 
 		 354 aa  48.1  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.959991  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  25.78 
 
 		 367 aa  48.5  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04410  Radical SAM domain protein  25.95 
 
 		 450 aa  48.5  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  24.31 
 
 		 378 aa  47.8  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  22.07 
 
 		 323 aa  47.4  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0424  YfkB-like domain protein  27.88 
 
 		 374 aa  47  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  26.71 
 
 		 347 aa  47.4  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  23.13 
 
 		 316 aa  47  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1725  radical SAM domain-containing protein  28.67 
 
 		 460 aa  47  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  24.64 
 
 		 496 aa  46.6  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3378  hypothetical protein  23.18 
 
 		 595 aa  46.6  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1269  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.21 
 
 		 344 aa  46.6  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00918784  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3415  Radical SAM domain protein  23.49 
 
 		 423 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1047  radical SAM domain-containing protein  19.71 
 
 		 468 aa  46.6  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2688  Radical SAM domain protein  23.49 
 
 		 423 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1862  radical SAM domain-containing protein  26.57 
 
 		 491 aa  46.2  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.27199  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1743  heme biosynthesis protein  26.57 
 
 		 491 aa  46.2  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0870  radical SAM domain-containing protein  26.57 
 
 		 491 aa  46.2  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1157  radical SAM domain-containing protein  26.57 
 
 		 491 aa  46.2  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.43485  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0390  radical SAM domain-containing protein  26.57 
 
 		 491 aa  46.2  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0298  radical SAM domain-containing protein  26.57 
 
 		 491 aa  46.2  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2134  radical SAM domain-containing protein  26.57 
 
 		 491 aa  46.2  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0254  hypothetical protein  33 
 
 		 471 aa  46.2  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0356803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  31.94 
 
 		 209 aa  45.8  0.0009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  22.99 
 
 		 397 aa  45.8  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0231  radical SAM family protein  22.86 
 
 		 445 aa  45.8  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0106929  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  26.24 
 
 		 330 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  21.9 
 
 		 323 aa  45.8  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1685  hypothetical protein  24.52 
 
 		 314 aa  45.4  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0732068  normal  0.0666172 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  24.5 
 
 		 394 aa  45.4  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  27.21 
 
 		 399 aa  45.4  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1728  hypothetical protein  25.17 
 
 		 491 aa  44.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  28.47 
 
 		 407 aa  44.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  28.99 
 
 		 389 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0516  radical SAM domain-containing protein  24.26 
 
 		 343 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  23.65 
 
 		 384 aa  44.7  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>