59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0424 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1304  YfkB-like domain protein  82.89 
 
 		 387 aa  664    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0424  YfkB-like domain protein  100 
 
 		 374 aa  778    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0407  YfkB-like domain-containing protein  76.49 
 
 		 375 aa  616  1e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0537  hypothetical protein  77.03 
 
 		 375 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0399  moaA/nifB/pqqE family protein  76.76 
 
 		 375 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0395  moaA/nifB/pqqE family protein  76.76 
 
 		 375 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0467  hypothetical protein  76.76 
 
 		 375 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4837  hypothetical protein  76.76 
 
 		 375 aa  611  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.768593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0486  hypothetical protein  76.49 
 
 		 375 aa  610  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0537  hypothetical protein  77.03 
 
 		 375 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0401  YfkB-like domain-containing protein  76.49 
 
 		 375 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0408  hypothetical protein  76.49 
 
 		 375 aa  608  1e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0421  hypothetical protein  76.49 
 
 		 375 aa  608  1e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.351837  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1415  radical SAM domain-containing protein  63.36 
 
 		 380 aa  499  1e-140  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.332495  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1965  YfkB-like domain-containing protein  59.31 
 
 		 383 aa  487  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.388917  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1931  YfkB-like domain-containing protein  59.31 
 
 		 383 aa  487  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0899  Radical SAM domain protein  27.85 
 
 		 345 aa  58.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.467857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  23.74 
 
 		 397 aa  54.3  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  23.15 
 
 		 399 aa  53.1  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0379  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  26.79 
 
 		 239 aa  51.6  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.346145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1064  radical SAM domain-containing protein  24.41 
 
 		 365 aa  51.2  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.468822  normal  0.968223 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0506  pyruvate formate-lyase activating enzyme  26.98 
 
 		 238 aa  50.1  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0339577  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0225  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  26.32 
 
 		 239 aa  50.1  0.00007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0603054  normal  0.555602 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1805  radical SAM domain-containing protein  27.91 
 
 		 273 aa  49.3  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.644596  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  25.81 
 
 		 349 aa  47.8  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  24.69 
 
 		 496 aa  47.8  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0737  Radical SAM domain protein  35.09 
 
 		 312 aa  47.4  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  29.91 
 
 		 366 aa  47.4  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1392  Radical SAM domain protein  22.55 
 
 		 377 aa  47.8  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.358724 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3480  radical SAM domain-containing protein  27.88 
 
 		 318 aa  47  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1688  radical SAM family protein  25.81 
 
 		 326 aa  47  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.52361  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1901  radical SAM domain-containing protein  22.42 
 
 		 368 aa  46.6  0.0007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.13165 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2577  radical SAM domain-containing protein  27.43 
 
 		 371 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.014973  unclonable  0.0000162693 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  24.89 
 
 		 323 aa  45.8  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  31.11 
 
 		 394 aa  45.4  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  24 
 
 		 316 aa  45.1  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0231  radical SAM family protein  38.71 
 
 		 445 aa  44.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0106929  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  28.72 
 
 		 209 aa  45.4  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  27.97 
 
 		 202 aa  45.1  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  23.25 
 
 		 405 aa  45.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  24.02 
 
 		 323 aa  45.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  24.21 
 
 		 422 aa  45.4  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0194  radical SAM domain-containing protein  32.61 
 
 		 579 aa  45.1  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.369341  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3033  radical SAM domain-containing protein  28.24 
 
 		 322 aa  44.7  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.706026 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  32.63 
 
 		 317 aa  44.7  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  21.75 
 
 		 407 aa  44.3  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0796  Radical SAM domain protein  30.68 
 
 		 341 aa  44.3  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.151454 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4124  radical SAM domain-containing protein  33.77 
 
 		 230 aa  44.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1785  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.1 
 
 		 351 aa  44.3  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23160  pyruvate formate-lyase activating enzyme  29.13 
 
 		 247 aa  43.9  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1335  Radical SAM domain protein  28.12 
 
 		 337 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0037  radical SAM domain-containing protein  25.41 
 
 		 237 aa  43.9  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3341  radical SAM domain-containing protein  36.11 
 
 		 423 aa  43.9  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0794  radical SAM domain-containing protein  36.59 
 
 		 446 aa  43.9  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1601  heme biosynthesis protein, putative  31.5 
 
 		 354 aa  43.9  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.196015  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5373  Radical SAM domain protein  26.7 
 
 		 327 aa  43.5  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  22.09 
 
 		 377 aa  43.5  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0862  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 231 aa  43.1  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.13 
 
 		 394 aa  43.1  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>