60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1304 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1304  YfkB-like domain protein  100 
 
 		 387 aa  805    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0424  YfkB-like domain protein  82.89 
 
 		 374 aa  664    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0401  YfkB-like domain-containing protein  73.24 
 
 		 375 aa  594  1e-169  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4837  hypothetical protein  73.78 
 
 		 375 aa  596  1e-169  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.768593  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0537  hypothetical protein  72.97 
 
 		 375 aa  592  1e-168  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0399  moaA/nifB/pqqE family protein  73.24 
 
 		 375 aa  594  1e-168  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0395  moaA/nifB/pqqE family protein  73.24 
 
 		 375 aa  593  1e-168  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0537  hypothetical protein  72.97 
 
 		 375 aa  592  1e-168  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0467  hypothetical protein  73.24 
 
 		 375 aa  594  1e-168  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0486  hypothetical protein  72.97 
 
 		 375 aa  592  1e-168  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0407  YfkB-like domain-containing protein  72.7 
 
 		 375 aa  593  1e-168  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0408  hypothetical protein  72.7 
 
 		 375 aa  589  1e-167  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0421  hypothetical protein  72.7 
 
 		 375 aa  589  1e-167  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.351837  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1415  radical SAM domain-containing protein  60.7 
 
 		 380 aa  479  1e-134  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.332495  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1931  YfkB-like domain-containing protein  59.77 
 
 		 383 aa  465  9.999999999999999e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1965  YfkB-like domain-containing protein  59.77 
 
 		 383 aa  465  9.999999999999999e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.388917  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0899  Radical SAM domain protein  27.85 
 
 		 345 aa  58.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.467857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  23.48 
 
 		 399 aa  56.6  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  22.84 
 
 		 349 aa  51.6  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  22.54 
 
 		 397 aa  50.4  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  30.83 
 
 		 202 aa  48.5  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  24.86 
 
 		 317 aa  48.1  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0506  pyruvate formate-lyase activating enzyme  28.57 
 
 		 238 aa  48.9  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0339577  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  20.25 
 
 		 405 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1064  radical SAM domain-containing protein  23 
 
 		 365 aa  48.1  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.468822  normal  0.968223 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  23.42 
 
 		 333 aa  48.5  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  22.06 
 
 		 422 aa  47.8  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  25.55 
 
 		 323 aa  47.8  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  23.43 
 
 		 316 aa  47  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1688  radical SAM family protein  25.93 
 
 		 326 aa  46.2  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.52361  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  21.5 
 
 		 414 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  30.16 
 
 		 366 aa  46.2  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  31.68 
 
 		 209 aa  46.2  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  32.22 
 
 		 394 aa  46.2  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1392  Radical SAM domain protein  21.89 
 
 		 377 aa  45.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.358724 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0703  S-adenosylmethionine synthetase  24.89 
 
 		 399 aa  44.7  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  21.52 
 
 		 399 aa  45.1  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4533  radical activating enzyme  30.11 
 
 		 215 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 323 aa  45.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1894  pyruvate formate-lyase activating enzyme  27.03 
 
 		 334 aa  44.7  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.703525  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0901  radical SAM superfamily protein  30.53 
 
 		 358 aa  43.9  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0885  pyruvate formate-lyase 1-activating enzyme  24.16 
 
 		 293 aa  43.9  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1859  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.76 
 
 		 334 aa  44.3  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.155054 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0354  radical SAM domain-containing protein  26.89 
 
 		 377 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.880417 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  23.53 
 
 		 334 aa  43.9  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3341  radical SAM domain-containing protein  36.11 
 
 		 423 aa  44.3  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  23.5 
 
 		 347 aa  43.9  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1959  radical SAM family protein  31.13 
 
 		 235 aa  43.9  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4124  radical SAM domain-containing protein  32.47 
 
 		 230 aa  43.9  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  19.71 
 
 		 378 aa  43.9  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  22.7 
 
 		 377 aa  43.9  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51680  radical activating enzyme  24.2 
 
 		 264 aa  43.5  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000920323  hitchhiker  0.00150868 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1755  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.03 
 
 		 349 aa  43.5  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.334737  hitchhiker  0.00806614 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0796  Radical SAM domain protein  27.87 
 
 		 341 aa  43.5  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.151454 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0433  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 365 aa  43.1  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.293902  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0862  radical SAM domain-containing protein  29.63 
 
 		 231 aa  43.5  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0194  radical SAM domain-containing protein  32.61 
 
 		 579 aa  43.1  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.369341  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0737  Radical SAM domain protein  31.82 
 
 		 312 aa  43.1  0.008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  20.87 
 
 		 397 aa  43.1  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1114  radical SAM domain-containing protein  31.62 
 
 		 322 aa  43.1  0.008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>