More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4124 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4124  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
230 aa  473  1e-132  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  36.61 
 
 
208 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  35.5 
 
 
209 aa  134  9.999999999999999e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  38.77 
 
 
210 aa  130  2.0000000000000002e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  34.15 
 
 
258 aa  122  7e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2658  Radical SAM domain protein  33.48 
 
 
210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0802797  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2467  radical SAM domain-containing protein  34.06 
 
 
210 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1298  radical SAM family protein  33.91 
 
 
210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2562  Radical SAM domain protein  33.91 
 
 
210 aa  112  5e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00464069  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0862  radical SAM domain-containing protein  34.98 
 
 
231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1943  Radical SAM domain protein  48.44 
 
 
260 aa  109  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  33.2 
 
 
274 aa  109  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2226  putative radical activating enzyme  34.33 
 
 
227 aa  108  6e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4643  radical SAM family Fe-S protein  32.05 
 
 
226 aa  108  9.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726839  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1091  radical SAM domain-containing protein  31.9 
 
 
216 aa  107  1e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.598204 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0034  radical SAM domain-containing protein  33.91 
 
 
216 aa  107  1e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  32.41 
 
 
258 aa  106  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0949  radical SAM domain-containing protein  33.91 
 
 
216 aa  105  6e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00254529  hitchhiker  0.000124279 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  33.86 
 
 
202 aa  104  1e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3107  radical SAM family protein  31.33 
 
 
210 aa  103  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2045  radical SAM family protein  33.47 
 
 
235 aa  103  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  29.21 
 
 
280 aa  101  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0779  Radical SAM domain protein  31.76 
 
 
223 aa  101  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0642  radical SAM domain-containing protein  32.77 
 
 
216 aa  100  2e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2711  radical SAM family protein  32.16 
 
 
234 aa  100  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3116  Radical SAM domain protein  31.03 
 
 
233 aa  97.4  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.353505  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0707  Radical SAM domain protein  31.44 
 
 
227 aa  97.4  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.654115  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  28.82 
 
 
225 aa  95.5  6e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0070  Radical SAM domain protein  31.38 
 
 
214 aa  95.1  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.457092  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0069  radical SAM domain protein  31.38 
 
 
214 aa  95.1  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0659  Radical SAM domain protein  29.2 
 
 
212 aa  94.7  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.815067  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  40.78 
 
 
220 aa  94.4  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4051  radical SAM family protein  30.24 
 
 
246 aa  94.7  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1772  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  29.96 
 
 
244 aa  93.6  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2847  radical SAM family protein  32.02 
 
 
247 aa  93.2  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.512992  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2837  radical SAM domain-containing protein  30.53 
 
 
243 aa  92.4  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01567  radical activating enzyme  32.95 
 
 
213 aa  91.3  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0497  radical SAM domain-containing protein  28.51 
 
 
212 aa  91.3  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3632  Radical SAM domain protein  27.68 
 
 
211 aa  90.9  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.597891 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1499  radical SAM domain protein  26.47 
 
 
238 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000307521  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3790  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  29.6 
 
 
242 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3716  radical activating protein  30.56 
 
 
255 aa  90.5  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.235387  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1098  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 
246 aa  90.9  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1232  radical SAM domain-containing protein  25.32 
 
 
238 aa  90.1  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  34.38 
 
 
202 aa  90.1  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1432  radical SAM domain protein  25.32 
 
 
238 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000180517 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1259  radical SAM domain-containing protein  25.32 
 
 
238 aa  89.4  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1234  radical SAM domain-containing protein  25.32 
 
 
238 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1361  radical sam domain-containing protein  25.32 
 
 
238 aa  89.4  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.297058  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1232  radical activating enzyme family protein  31.9 
 
 
215 aa  89  5e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.248382  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  31.15 
 
 
234 aa  89  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4050  radical SAM family protein  28.57 
 
 
212 aa  89  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2336  radical SAM family protein  27.04 
 
 
212 aa  87.8  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650219  normal  0.0607632 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0896  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  27.92 
 
 
245 aa  87  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2049  radical activating enzyme  36.69 
 
 
222 aa  87  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.341171  normal  0.258883 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2024  hypothetical protein  27.83 
 
 
217 aa  86.3  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1950  Radical SAM domain protein  30.5 
 
 
253 aa  86.3  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3495  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  28.63 
 
 
242 aa  86.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0952  radical SAM domain-containing protein  28.45 
 
 
217 aa  86.7  3e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0717091  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4183  radical SAM domain-containing protein  28.81 
 
 
235 aa  86.7  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.0000810213  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2348  radical SAM domain-containing protein  40 
 
 
222 aa  85.9  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0536039  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1899  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  28.34 
 
 
247 aa  85.9  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1974  radical activating enzyme, putative  28.74 
 
 
251 aa  85.9  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4937  radical SAM domain-containing protein  31.17 
 
 
245 aa  85.9  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0465202  normal  0.450648 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1460  radical SAM domain-containing protein  24.89 
 
 
238 aa  85.1  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.387588  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1071  radical activating enzyme  31.21 
 
 
217 aa  85.1  8e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0749004  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1877  radical activating enzyme  38.13 
 
 
222 aa  85.1  8e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.460246  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1753  radical SAM family protein  30.99 
 
 
251 aa  84.3  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.55771 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2016  queuosine biosynthesis protein  26.72 
 
 
213 aa  84.3  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.708443  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1878  Radical SAM domain protein  29.55 
 
 
192 aa  84.7  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.315788  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0178  radical SAM domain-containing protein  26.72 
 
 
213 aa  84.3  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.866793  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0734  radical SAM domain-containing protein  27.87 
 
 
237 aa  84  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2203  radical activating enzyme  30.6 
 
 
216 aa  84  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000727675 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0172  hypothetical protein  40.88 
 
 
210 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.196863  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0978  hypothetical protein  32.66 
 
 
245 aa  84  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0750  radical SAM domain-containing protein  27.87 
 
 
237 aa  84  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1985  radical SAM domain-containing protein  29.91 
 
 
215 aa  83.6  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1846  Radical SAM domain protein  32.92 
 
 
254 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.260546  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1418  radical SAM family protein  32.72 
 
 
215 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0148  radical SAM domain-containing protein  38.1 
 
 
213 aa  83.2  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1855  radical activating enzyme  37.41 
 
 
222 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.328449  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4533  radical activating enzyme  26.16 
 
 
215 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1396  radical SAM domain protein  26.67 
 
 
238 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0288655  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2058  radical activating enzyme  36.69 
 
 
222 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00725057  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51680  radical activating enzyme  29.27 
 
 
264 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000920323  hitchhiker  0.00150868 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2163  radical activating enzyme  36.69 
 
 
222 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224373  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3947  radical SAM domain protein  24.37 
 
 
238 aa  82  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0197707  normal  0.0210663 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0153  hypothetical protein  40.15 
 
 
210 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2285  hypothetical protein  40.15 
 
 
210 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0357  GntS  40.15 
 
 
210 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386025  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2364  hypothetical protein  40.15 
 
 
210 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2061  radical SAM domain-containing protein  37.68 
 
 
222 aa  82  0.000000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0162  organic radical activating protein  40.15 
 
 
210 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.495618  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2794  hypothetical protein  40.15 
 
 
210 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1008  radical SAM domain-containing protein  26.61 
 
 
246 aa  82  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2116  radical activating enzyme  35.25 
 
 
222 aa  82  0.000000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.054229  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3149  hypothetical protein  38.85 
 
 
210 aa  82  0.000000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105264  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0538  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 
227 aa  81.6  0.000000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128544  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2947  hypothetical protein  34.17 
 
 
226 aa  81.3  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.500667  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2019  hypothetical protein  27.19 
 
 
217 aa  81.3  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>