46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1415 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1415  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 380 aa  795    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.332495  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1965  YfkB-like domain-containing protein  81.89 
 
 		 383 aa  657    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.388917  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1931  YfkB-like domain-containing protein  81.89 
 
 		 383 aa  657    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0424  YfkB-like domain protein  63.36 
 
 		 374 aa  499  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0395  moaA/nifB/pqqE family protein  60 
 
 		 375 aa  484  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0537  hypothetical protein  60 
 
 		 375 aa  484  1e-135  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0537  hypothetical protein  60 
 
 		 375 aa  484  1e-135  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0486  hypothetical protein  59.73 
 
 		 375 aa  481  1e-135  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4837  hypothetical protein  59.73 
 
 		 375 aa  482  1e-135  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.768593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0467  hypothetical protein  59.73 
 
 		 375 aa  483  1e-135  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0421  hypothetical protein  59.73 
 
 		 375 aa  481  1e-135  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.351837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0399  moaA/nifB/pqqE family protein  59.73 
 
 		 375 aa  483  1e-135  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0408  hypothetical protein  59.73 
 
 		 375 aa  481  1e-135  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1304  YfkB-like domain protein  60.7 
 
 		 387 aa  479  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0407  YfkB-like domain-containing protein  59.23 
 
 		 375 aa  477  1e-133  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0401  YfkB-like domain-containing protein  58.84 
 
 		 375 aa  477  1e-133  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1392  Radical SAM domain protein  33.96 
 
 		 377 aa  50.8  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.358724 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  21.98 
 
 		 496 aa  50.8  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0737  Radical SAM domain protein  31.58 
 
 		 312 aa  50.8  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2577  radical SAM domain-containing protein  26.89 
 
 		 371 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.014973  unclonable  0.0000162693 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  29.91 
 
 		 464 aa  48.1  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4124  radical SAM domain-containing protein  22.51 
 
 		 230 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1335  Radical SAM domain protein  32.99 
 
 		 337 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0899  Radical SAM domain protein  23.74 
 
 		 345 aa  47  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.467857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  30.43 
 
 		 394 aa  46.6  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  22.51 
 
 		 347 aa  46.2  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0862  radical SAM domain-containing protein  34.48 
 
 		 231 aa  46.2  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0967  radical SAM domain-containing protein  32.94 
 
 		 355 aa  45.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  32.94 
 
 		 351 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  27.52 
 
 		 366 aa  45.1  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  28.26 
 
 		 316 aa  45.1  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1385  Radical SAM domain protein  25.93 
 
 		 417 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0362532  unclonable  0.0000106904 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4900  radical SAM domain-containing protein  31.13 
 
 		 351 aa  45.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  decreased coverage  0.000796621 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1453  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  25 
 
 		 236 aa  44.7  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0238832  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  22.41 
 
 		 319 aa  44.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1114  radical SAM domain-containing protein  28.7 
 
 		 322 aa  43.9  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5373  Radical SAM domain protein  21.03 
 
 		 327 aa  43.9  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1959  radical SAM family protein  32.97 
 
 		 235 aa  44.3  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0901  radical SAM superfamily protein  28.7 
 
 		 358 aa  43.9  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0194  radical SAM domain-containing protein  25.64 
 
 		 579 aa  43.5  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.369341  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  22.52 
 
 		 410 aa  43.5  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2228  Radical SAM domain protein  27.21 
 
 		 332 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.419306 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3158  radical SAM domain-containing protein  30.3 
 
 		 428 aa  42.7  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.271249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0182  radical SAM domain-containing protein  32.22 
 
 		 334 aa  43.1  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.505974  normal  0.796487 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  30.43 
 
 		 317 aa  42.7  0.01  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  21.34 
 
 		 379 aa  42.7  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>