46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_1965 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1415  radical SAM domain-containing protein  81.89 
 
 		 380 aa  657    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.332495  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1965  YfkB-like domain-containing protein  100 
 
 		 383 aa  805    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.388917  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1931  YfkB-like domain-containing protein  100 
 
 		 383 aa  805    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0424  YfkB-like domain protein  59.31 
 
 		 374 aa  487  1e-136  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0537  hypothetical protein  58.89 
 
 		 375 aa  475  1e-133  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0408  hypothetical protein  58.89 
 
 		 375 aa  474  1e-133  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0399  moaA/nifB/pqqE family protein  59.17 
 
 		 375 aa  477  1e-133  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0395  moaA/nifB/pqqE family protein  59.17 
 
 		 375 aa  477  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0421  hypothetical protein  58.89 
 
 		 375 aa  474  1e-133  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.351837  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0537  hypothetical protein  58.89 
 
 		 375 aa  475  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0407  YfkB-like domain-containing protein  58.89 
 
 		 375 aa  475  1e-133  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0486  hypothetical protein  58.89 
 
 		 375 aa  475  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4837  hypothetical protein  59.17 
 
 		 375 aa  477  1e-133  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.768593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0467  hypothetical protein  59.17 
 
 		 375 aa  477  1e-133  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0401  YfkB-like domain-containing protein  57.49 
 
 		 375 aa  473  1e-132  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1304  YfkB-like domain protein  59.77 
 
 		 387 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0737  Radical SAM domain protein  33.93 
 
 		 312 aa  52  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4124  radical SAM domain-containing protein  24.34 
 
 		 230 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1392  Radical SAM domain protein  33.96 
 
 		 377 aa  50.8  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.358724 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  22.35 
 
 		 496 aa  48.9  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0862  radical SAM domain-containing protein  31.58 
 
 		 231 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  35.63 
 
 		 351 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4900  radical SAM domain-containing protein  33.64 
 
 		 351 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  decreased coverage  0.000796621 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0899  Radical SAM domain protein  24.88 
 
 		 345 aa  47.4  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.467857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4272  Radical SAM domain protein  25.93 
 
 		 337 aa  46.6  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2577  radical SAM domain-containing protein  26.05 
 
 		 371 aa  46.6  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.014973  unclonable  0.0000162693 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  30 
 
 		 394 aa  46.2  0.0009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  28.04 
 
 		 464 aa  46.2  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1114  radical SAM domain-containing protein  30.16 
 
 		 322 aa  45.8  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1519  radical SAM domain-containing protein  23.5 
 
 		 422 aa  45.4  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0901  radical SAM superfamily protein  30.16 
 
 		 358 aa  45.4  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  26.61 
 
 		 366 aa  45.4  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0379  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  28.44 
 
 		 239 aa  44.7  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.346145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3033  radical SAM domain-containing protein  26.6 
 
 		 322 aa  44.7  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.706026 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1302  radical SAM domain-containing protein  32.5 
 
 		 321 aa  44.7  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  22.71 
 
 		 405 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0796  Radical SAM domain protein  30.68 
 
 		 341 aa  44.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.151454 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  22.75 
 
 		 414 aa  43.5  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1335  Radical SAM domain protein  31.96 
 
 		 337 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0225  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  26.42 
 
 		 239 aa  43.5  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0603054  normal  0.555602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0205  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 340 aa  43.1  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0667932  normal  0.157312 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1688  radical SAM family protein  20.35 
 
 		 326 aa  43.1  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.52361  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  27.17 
 
 		 316 aa  43.1  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  25.91 
 
 		 377 aa  43.1  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1959  radical SAM family protein  25.9 
 
 		 235 aa  43.1  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  28.04 
 
 		 258 aa  42.7  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>