More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0037 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0037  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 237 aa  482  1e-135  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1642  organic radical activating enzymes  28.57 
 
 		 253 aa  90.9  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000324047  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0834  radical SAM domain-containing protein  29.72 
 
 		 248 aa  90.5  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0123743  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1757  radical SAM domain-containing protein  26.1 
 
 		 247 aa  88.2  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1721  radical SAM domain-containing protein  25.29 
 
 		 250 aa  85.1  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0587139  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1658  radical SAM family protein  25.97 
 
 		 250 aa  85.1  9e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000021  normal  0.87771 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2122  radical SAM domain-containing protein  24.9 
 
 		 250 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1318  Radical SAM domain protein  27.55 
 
 		 251 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.11039  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  29.55 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5205  Radical SAM domain protein  24.12 
 
 		 268 aa  81.6  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2519  radical SAM domain-containing protein  23.19 
 
 		 265 aa  80.9  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0593  Radical SAM domain protein  27.78 
 
 		 251 aa  80.5  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2965  Radical SAM domain protein  26.82 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267207 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1270  radical SAM family Fe-S protein  28.68 
 
 		 238 aa  79  0.00000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.53239  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1090  radical SAM domain-containing protein  30.31 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1846  Radical SAM domain protein  24.71 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.260546  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1234  radical SAM domain-containing protein  24 
 
 		 246 aa  75.5  0.0000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1076  radical SAM domain-containing protein  29.84 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  27.35 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0871  radical SAM domain-containing protein  28.51 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.142358  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  27.66 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0034  radical SAM domain-containing protein  45.68 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1091  radical SAM domain-containing protein  42.17 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.598204 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0538  Radical SAM domain protein  27.35 
 
 		 227 aa  72  0.000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128544  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4050  radical SAM family protein  26.92 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1600  radical SAM domain-containing protein  29.44 
 
 		 242 aa  71.6  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0949  radical SAM domain-containing protein  43.21 
 
 		 216 aa  71.2  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00254529  hitchhiker  0.000124279 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1332  hypothetical protein  36.63 
 
 		 206 aa  71.6  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3116  Radical SAM domain protein  40 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.353505  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0743  radical SAM family protein  22.73 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000550724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2336  radical SAM family protein  25.75 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650219  normal  0.0607632 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0724  radical SAM family protein  32.14 
 
 		 244 aa  69.7  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0642  radical SAM domain-containing protein  41.46 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  32.84 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0736  radical activating enzyme  31.43 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.114676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0135  hypothetical protein  26.74 
 
 		 258 aa  68.9  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2226  putative radical activating enzyme  25.64 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0506  pyruvate formate-lyase activating enzyme  27.54 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0339577  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2024  hypothetical protein  32.84 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1418  radical SAM family protein  34.75 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  37.89 
 
 		 225 aa  67  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0896  radical SAM domain-containing protein  36.56 
 
 		 245 aa  67.4  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116029 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29591  putative organic radical activating protein  25.63 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2019  hypothetical protein  31.76 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3969  radical SAM domain protein  34.04 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0978763  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4533  radical activating enzyme  32.14 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51680  radical activating enzyme  32.87 
 
 		 264 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000920323  hitchhiker  0.00150868 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2016  queuosine biosynthesis protein  41.11 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.708443  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4399  radical SAM family protein  33.33 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0178  radical SAM domain-containing protein  41.11 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.866793  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1280  radical SAM domain-containing protein  32.86 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.281332  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0148  radical SAM domain-containing protein  36.67 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01567  radical activating enzyme  29.93 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1943  Radical SAM domain protein  37.36 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0779  Radical SAM domain protein  30.28 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2236  organic radical activating protein  33.64 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2203  radical activating enzyme  30.71 
 
 		 216 aa  62  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000727675 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1116  hypothetical protein  37.66 
 
 		 205 aa  62  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  29.44 
 
 		 209 aa  62  0.000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2526  putative radical activating enzyme  29.29 
 
 		 216 aa  62  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1785  radical SAM domain-containing protein  23.53 
 
 		 249 aa  62  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0659  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 212 aa  61.6  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.815067  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1145  radical activating enzyme  37.66 
 
 		 205 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.723359 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2711  radical SAM family protein  37.93 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0707  Radical SAM domain protein  40.51 
 
 		 227 aa  61.6  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.654115  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1232  radical activating enzyme family protein  39.08 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.248382  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1879  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00268762 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  31.67 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0952  radical SAM domain-containing protein  31.47 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0717091  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1071  radical activating enzyme  31.47 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0749004  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2067  Radical SAM domain protein  27.67 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0974345  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4124  radical SAM domain-containing protein  34.78 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1766  Radical SAM domain protein  25.73 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.988544  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  33.72 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2820  pyruvate formate-lyase activating enzyme  29.63 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000272816  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1985  radical SAM domain-containing protein  24.79 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2599  organic radical activating protein  29.25 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.836809  normal  0.140596 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2581  pyruvate formate-lyase activating enzyme  27.54 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2163  radical activating enzyme  33.67 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3632  Radical SAM domain protein  42.68 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.597891 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0487  radical SAM domain-containing protein  31.68 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1702  Radical SAM domain protein  25.43 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.86531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1008  radical SAM domain-containing protein  32.94 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1259  radical SAM domain-containing protein  30.56 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1232  radical SAM domain-containing protein  30.56 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1234  radical SAM domain-containing protein  30.56 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0862  radical SAM domain-containing protein  35.29 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1432  radical SAM domain protein  30.56 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000180517 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1361  radical sam domain-containing protein  30.56 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.297058  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1499  radical SAM domain protein  30.56 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000307521  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0871  putative coenzyme PQQ synthesis protein  25.2 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.398462  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1460  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 		 238 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.387588  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1066  radical SAM domain-containing protein  30.91 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  36.14 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0569  Radical SAM domain protein  25.63 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.241409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3990  radical SAM domain-containing protein  35.96 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2058  radical activating enzyme  32.65 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00725057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  30.3 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0896  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  27.53 
 
 		 245 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1254  radical SAM domain-containing protein  34.83 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.04187  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>