71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3265 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3265  DNA repair ATPase-like protein  100 
 
 		 757 aa  1543    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1626  SMC domain protein  24.65 
 
 		 978 aa  71.6  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  28.7 
 
 		 994 aa  66.6  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1574  SMC domain-containing protein  26.13 
 
 		 840 aa  65.9  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0162335  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  28.57 
 
 		 924 aa  64.7  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1709  exonuclease SbcC  30.67 
 
 		 1008 aa  59.7  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1245  SMC domain-containing protein  26.52 
 
 		 693 aa  60.1  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  29.41 
 
 		 895 aa  59.7  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  23.79 
 
 		 789 aa  58.9  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0696  SMC domain protein  27.59 
 
 		 618 aa  58.2  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  24.58 
 
 		 906 aa  57.8  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  29.86 
 
 		 891 aa  57.4  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4561  exonuclease SbcC  24.54 
 
 		 1007 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  33.33 
 
 		 891 aa  56.2  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0696  exonuclease SbcC  31.34 
 
 		 1007 aa  56.2  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3009  exonuclease SbcC  29.79 
 
 		 1008 aa  55.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.291694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3111  exonuclease SbcC  29.79 
 
 		 1008 aa  55.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6131  SMC domain protein  28.66 
 
 		 851 aa  55.1  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.983245 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1882  SMC domain protein  27.55 
 
 		 904 aa  54.7  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.600097  normal  0.549876 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0448  SMC protein-like protein  31.54 
 
 		 955 aa  54.7  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.507994  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  22.52 
 
 		 961 aa  54.7  0.000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  26.6 
 
 		 1019 aa  54.3  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  26.43 
 
 		 890 aa  53.5  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3541  exonuclease SbcC  30.37 
 
 		 1003 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.757761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2412  SMC protein-like protein  22.65 
 
 		 883 aa  52  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00784167  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2415  hypothetical protein  25.21 
 
 		 922 aa  51.6  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0103  hypothetical protein  29.92 
 
 		 711 aa  50.8  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  24.62 
 
 		 935 aa  50.8  0.00009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0568  SMC domain-containing protein  26.62 
 
 		 1091 aa  50.4  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.564542  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1488  SMC domain protein  27.43 
 
 		 1114 aa  50.8  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2080  exonuclease SbcC  24.77 
 
 		 1219 aa  50.4  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0207  exonuclease SbcC  26.28 
 
 		 1172 aa  50.4  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2570  SMC domain-containing protein  26.09 
 
 		 1230 aa  50.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2126  hypothetical protein  25.42 
 
 		 922 aa  49.7  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593099  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0205  exonuclease SbcC  26.28 
 
 		 1172 aa  50.1  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.305096  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3217  exonuclease SbcC  29.17 
 
 		 1213 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  22.06 
 
 		 864 aa  48.9  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2384  exonuclease SbcC  24.57 
 
 		 1099 aa  48.9  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00297099  hitchhiker  0.00111486 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0480  hypothetical protein  30.43 
 
 		 1194 aa  48.9  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1980  SMC domain-containing protein  26.09 
 
 		 1227 aa  48.5  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2301  SMC domain protein  31.91 
 
 		 987 aa  48.5  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1158  SMC domain protein  24.9 
 
 		 1226 aa  48.5  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.1908  normal  0.473044 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0360  chromosome segregation protein  25.69 
 
 		 1074 aa  47.8  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0032  hypothetical protein  23.14 
 
 		 664 aa  48.1  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0204  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)-like  25.16 
 
 		 1088 aa  47.8  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18794  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1730  exonuclease  27.81 
 
 		 1223 aa  47.8  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0842079  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1063  exonuclease SbcCD, C subunit  25.97 
 
 		 1307 aa  47.4  0.0009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3877  exonuclease SbcC  26.71 
 
 		 1016 aa  47  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.371142  normal  0.0827458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3418  SMC domain protein  26.11 
 
 		 1032 aa  46.6  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  30.33 
 
 		 910 aa  46.2  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1556  SMC domain-containing protein  28.33 
 
 		 1214 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291963 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1449  DNA repair ATPase  30.08 
 
 		 812 aa  46.6  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000531143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1821  SMC domain protein  28.74 
 
 		 1280 aa  46.2  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137398  normal  0.989347 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0069  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1284 aa  45.8  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.774464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0704  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)  25.16 
 
 		 1091 aa  45.8  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.859038  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0433  exonuclease SbcC  35.19 
 
 		 1245 aa  45.8  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0782061  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1501  SMC-like protein  25.85 
 
 		 888 aa  45.8  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1399  SMC protein-like  25.41 
 
 		 1303 aa  45.8  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0467  exonuclease SbcC  35.19 
 
 		 1245 aa  45.8  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.929503  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1584  SMC domain-containing protein  30.23 
 
 		 1214 aa  45.8  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999097  hitchhiker  0.00383377 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1922  SMC domain protein  30.21 
 
 		 987 aa  45.8  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.664102 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2539  SMC domain protein  27.04 
 
 		 1085 aa  45.4  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0462  exonuclease SbcC  35.19 
 
 		 1247 aa  45.8  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.345469  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0855  SMC domain protein  23.08 
 
 		 802 aa  45.4  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.128097  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  24.14 
 
 		 1108 aa  45.4  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1315  SMC domain protein  26 
 
 		 1223 aa  44.7  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.082994  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1246  SMC domain-containing protein  24.64 
 
 		 1038 aa  44.3  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0985  SMC domain-containing protein  23.08 
 
 		 702 aa  44.3  0.009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000497741 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1915  SMC domain protein  26.15 
 
 		 815 aa  44.3  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00125008  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0181  chromosome segregation protein  28.57 
 
 		 902 aa  44.3  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1364  ATP-dependent dsDNA exonuclease  23.97 
 
 		 1059 aa  43.9  0.01  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>