250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0198 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0198  cobalamin biosynthesis protein  100 
 
 
306 aa  608  1e-173  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.797231 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1704  cobalamin biosynthesis protein  91.83 
 
 
306 aa  568  1e-161  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.574312  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0758  cobalamin biosynthesis protein  91.18 
 
 
306 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0238  cobalamin biosynthesis protein  74.34 
 
 
310 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0706  cobalamin biosynthesis protein  63.37 
 
 
311 aa  388  1e-107  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.380522  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1583  cobalamin biosynthesis protein CobD  38.46 
 
 
323 aa  195  8.000000000000001e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0654  cobalamin biosynthesis protein CobD  32.43 
 
 
308 aa  176  5e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0688  cobalamin biosynthesis protein CobD  32.43 
 
 
308 aa  176  5e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0624  adenosylcobinamide-phosphate synthase  35.45 
 
 
308 aa  176  5e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.373431  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_592  adenosylcobinamide-phosphate synthase  32.09 
 
 
308 aa  175  9e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1370  cobalamin biosynthesis protein CobD  38.89 
 
 
294 aa  171  1e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2704  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.94 
 
 
315 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0301  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.03 
 
 
313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2090  adenosylcobinamide-phosphate synthase  35.78 
 
 
331 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21170  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.11 
 
 
323 aa  162  6e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7401  adenosylcobinamide-phosphate synthase  28.97 
 
 
369 aa  162  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0859  cobalamin biosynthesis protein CobD  37.07 
 
 
278 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0252583  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0555  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.46 
 
 
311 aa  159  6e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1099  adenosylcobinamide-phosphate synthase  30.5 
 
 
320 aa  158  8e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1113  cobalamin biosynthesis protein  36.7 
 
 
315 aa  158  9e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.386524  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1931  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.66 
 
 
313 aa  158  9e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1468  cobalamin biosynthesis protein CobD  31.02 
 
 
318 aa  158  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0633  cobalamin biosynthesis protein CobD  31.14 
 
 
323 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0420011  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1057  cobalamin biosynthesis protein CobD  32.75 
 
 
309 aa  158  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0790  cobalamin biosynthesis protein CobD  30.32 
 
 
323 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0828155  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1294  cobalamin biosynthesis protein  35.96 
 
 
315 aa  156  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.392516  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0645  cobalamin biosynthesis protein CobD  31.72 
 
 
311 aa  155  8e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0008  cobalamin biosynthesis protein CobD  31.49 
 
 
306 aa  154  1e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0061  adenosylcobinamide-phosphate synthase  33.67 
 
 
305 aa  154  2e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00552046  hitchhiker  0.00179506 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2321  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.32 
 
 
306 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1545  adenosylcobinamide-phosphate synthase  30.71 
 
 
342 aa  152  7e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.215428  normal  0.112032 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3744  cobalamin biosynthesis protein CobD  31.39 
 
 
323 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00858099  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1286  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.59 
 
 
320 aa  152  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.726575  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_72  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.93 
 
 
318 aa  151  2e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0246  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.57 
 
 
318 aa  150  3e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0419  cobalamin biosynthesis protein  32.09 
 
 
324 aa  149  5e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1138  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.89 
 
 
307 aa  149  7e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.697499  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0042  cobalamin biosynthesis protein CobD  30.97 
 
 
328 aa  149  7e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0007  cobalamin biosynthesis protein CobD  32.78 
 
 
314 aa  149  8e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5371  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.78 
 
 
301 aa  149  8e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0967  adenosylcobinamide-phosphate synthase  34.72 
 
 
307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3273  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.33 
 
 
330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284027 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1305  cobalamin biosynthesis protein CobD  29.81 
 
 
321 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2616  cobalamin biosynthesis protein CobD  31.6 
 
 
320 aa  146  5e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4469  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.2 
 
 
317 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.277077  normal  0.0655318 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1847  cobalamin biosynthesis protein CobD  30.43 
 
 
319 aa  145  7.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2209  cobalamin biosynthesis protein  33.33 
 
 
323 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1458  cobalamin biosynthesis protein CobD  28.57 
 
 
300 aa  145  9e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3677  cobalamin biosynthesis protein CobD  31.95 
 
 
330 aa  145  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.544295 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0735  cobalamin biosynthesis protein CobD  31.41 
 
 
323 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0965  cobalamin biosynthesis protein CobD  33.21 
 
 
300 aa  145  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2229  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.07 
 
 
310 aa  145  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0406571 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2205  cobalamin biosynthesis protein  30.46 
 
 
313 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0351195  normal  0.625062 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3555  cobalamin biosynthesis protein  28.46 
 
 
333 aa  144  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3454  adenosylcobinamide-phosphate synthase  35.84 
 
 
328 aa  144  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.868099  normal  0.111955 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3349  cobalamin biosynthesis protein  28.62 
 
 
344 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3360  cobalamin biosynthesis protein  28.62 
 
 
344 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.406666  normal  0.480267 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3411  cobalamin biosynthesis protein  28.62 
 
 
344 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.530159 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0561  cobalamin biosynthesis protein CobD  26.8 
 
 
318 aa  143  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0295  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.64 
 
 
316 aa  143  4e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1294  cobalamin biosynthesis protein  33.6 
 
 
331 aa  143  5e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3092  cobalamin biosynthesis protein CobD  34.3 
 
 
336 aa  142  5e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.423715  hitchhiker  0.00432553 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17720  adenosylcobinamide-phosphate synthase  29.48 
 
 
332 aa  142  5e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.213248  normal  0.925164 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2621  cobalamin biosynthesis protein  30.5 
 
 
323 aa  142  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246707  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1738  cobalamin biosynthesis protein CobD  30.28 
 
 
322 aa  142  7e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0463068 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_956  cobalamin biosynthesis protein  36.73 
 
 
307 aa  142  8e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0324  adenosylcobinamide-phosphate synthase  27.59 
 
 
316 aa  141  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3929  cobalamin biosynthesis protein  28.46 
 
 
332 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.512317  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12265  cobalamin biosynthesis protein  26.42 
 
 
313 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0486  adenosylcobinamide-phosphate synthase  30.45 
 
 
318 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0870  cobalamin biosynthesis protein CobD  28.33 
 
 
323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2148  cobalamin biosynthesis protein CobD  29.27 
 
 
327 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.445636  normal  0.0604171 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1267  cobalamin biosynthesis protein  32.71 
 
 
324 aa  140  3e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1753  cobalamin biosynthesis protein  30.92 
 
 
302 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1234  cobalamin biosynthesis protein  29.33 
 
 
302 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.778235  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1256  cobalamin biosynthesis protein  33.6 
 
 
331 aa  139  4.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.252791  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2533  cobalamin biosynthesis protein CobD  30 
 
 
328 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1110  cobalamin biosynthesis protein CobD  31.64 
 
 
339 aa  139  6e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1233  cobalamin biosynthesis protein CobD  29.59 
 
 
321 aa  139  6e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0174  cobalamin biosynthesis protein CobD  30.34 
 
 
316 aa  139  7e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1287  cobalamin biosynthesis protein CobD  27.67 
 
 
325 aa  138  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0123328  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2089  cobD; cobalamin biosynthetic protein  32.12 
 
 
301 aa  138  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.284243  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1711  cobalamin biosynthesis protein CobD  28.33 
 
 
302 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1891  cobalamin biosynthesis protein  32.13 
 
 
327 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1019  cobalamin biosynthesis protein CobD  35.92 
 
 
308 aa  137  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0102  cobalamin biosynthesis protein  29.62 
 
 
317 aa  137  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3624  cobalamin biosynthesis protein  36.31 
 
 
317 aa  137  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.69655  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0140  cobalamin biosynthesis protein  29.84 
 
 
304 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1644  cobalamin biosynthesis protein  30.72 
 
 
302 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.29794  normal  0.0167016 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1721  adenosylcobinamide-phosphate synthase  32.21 
 
 
319 aa  136  3.0000000000000003e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1003  cobalamin biosynthesis protein  30.54 
 
 
311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0872  cobalamin biosynthesis protein CobD  29.8 
 
 
315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1274  cobalamin biosynthesis protein  28.28 
 
 
302 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272014  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1159  cobalamin biosynthesis protein CbiB  30.34 
 
 
336 aa  135  7.000000000000001e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2585  cobalamin biosynthesis protein  30.26 
 
 
303 aa  135  7.000000000000001e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.650377  hitchhiker  0.000040763 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0969  cobalamin biosynthesis protein CobD  36.72 
 
 
305 aa  135  8e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.380612  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0388  cobalamin biosynthesis protein CobD  31.16 
 
 
337 aa  134  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3538  cobalamin biosynthesis protein CobD  30.66 
 
 
319 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2762  adenosylcobinamide-phosphate synthase  33.08 
 
 
318 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.861061  normal  0.0751378 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3443  cobalamin biosynthesis protein CobD  27.24 
 
 
295 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10368  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>