More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0660 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0660  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 
121 aa  244  2e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.187673  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0100  nitrogen regulatory protein P-II  96.69 
 
 
121 aa  240  6e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.250689  normal  0.0316533 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1801  nitrogen regulatory protein P-II  94.21 
 
 
121 aa  231  3e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0063  nitrogen regulatory protein P-II  72.73 
 
 
121 aa  193  7e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0145  nitrogen regulatory protein P-II  50.41 
 
 
120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.550451  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1554  nitrogen regulatory protein P-II  51.2 
 
 
125 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2279  P-II family nitrogen regulatory protein  45.9 
 
 
123 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000418064  normal  0.159182 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0550  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  51.52 
 
 
114 aa  116  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0094622  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1048  nitrogen regulatory protein P-II  47.24 
 
 
127 aa  107  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0169  nitrogen regulatory protein P-II  43.8 
 
 
125 aa  103  9e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00936567  normal  0.629139 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1432  nitrogen regulatory protein P-II  42.86 
 
 
128 aa  102  2e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3092  nitrogen regulatory protein P-II  43.75 
 
 
131 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0742  nitrogen regulatory protein P-II  46.77 
 
 
125 aa  97.4  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1246  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  45.97 
 
 
125 aa  95.5  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000500613  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1156  nitrogen regulatory protein P-II  40.65 
 
 
130 aa  92  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1025  nitrogen regulatory protein P-II  40.48 
 
 
126 aa  92  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2819  nitrogen regulatory protein P-II  43.65 
 
 
126 aa  91.7  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.587201  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0683  nitrogen regulatory protein P-II  42.74 
 
 
125 aa  91.3  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1530  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  43.55 
 
 
125 aa  90.1  9e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.858615  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1951  nitrogen regulatory protein P-II  41.09 
 
 
125 aa  87.8  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0122455  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1629  nitrogen regulatory protein P-II  41.94 
 
 
125 aa  85.5  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000227966  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1017  nitrogen regulatory protein P-II  41.46 
 
 
126 aa  85.5  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301084  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0953  nitrogen regulatory protein P-II  35.77 
 
 
112 aa  84  7e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2615  nitrogen regulatory protein P-II  40.94 
 
 
124 aa  84  7e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_942  nitrogen regulatory protein P-II  35.77 
 
 
112 aa  82.4  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1124  nitrogen regulatory protein P-II  34.96 
 
 
112 aa  82  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0770383  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1753  nitrogen regulatory protein P-II  41.22 
 
 
125 aa  81.3  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.424498  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1695  nitrogen regulatory protein P-II  39.67 
 
 
112 aa  81.3  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.596367 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0064  nitrogen regulatory protein P-II  40.68 
 
 
105 aa  80.9  0.000000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0993  nitrogen regulatory protein P-II  38.84 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.469718  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  36.36 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18621  nitrogen regulatory protein P-II  38.84 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.436109  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1888  nitrogen regulatory protein P-II  39.67 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0556  nitrogen regulatory protein P-II  36.36 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1017  nitrogen regulatory protein P-II  39.34 
 
 
113 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000487669  normal  0.288979 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  38.52 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0559  nitrogen regulatory protein P-II  38.41 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000146576  normal  0.195853 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  38.52 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  38.52 
 
 
112 aa  79  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  38.52 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  36.89 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2863  nitrogen regulatory protein P-II  37.19 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00920081  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  36.89 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  36.07 
 
 
112 aa  77  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1356  nitrogen regulatory protein P-II  38.02 
 
 
124 aa  77  0.00000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.51478  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0436  nitrogen regulatory protein P-II  31.03 
 
 
146 aa  76.3  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.447184  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2861  nitrogen regulatory protein P-II  36.89 
 
 
112 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.715878  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1802  nitrogen regulatory protein P-II  39.5 
 
 
105 aa  76.3  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0144  nitrogen regulatory protein P-II  38.26 
 
 
105 aa  76.6  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.419714  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0550  nitrogen regulatory protein P-II  37.1 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4014  nitrogen regulatory protein P-II  34.68 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00726508  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0836  nitrogen regulatory protein P-II  39.84 
 
 
124 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0099  nitrogen regulatory protein P-II  38.66 
 
 
105 aa  76.3  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.477301  normal  0.031272 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0659  nitrogen regulatory protein P-II  39.5 
 
 
105 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769311  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4381  nitrogen regulatory protein P-II  36.07 
 
 
117 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4404  nitrogen regulatory protein P-II  36.07 
 
 
117 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795902  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1081  nitrogen regulatory protein P-II  36.36 
 
 
113 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.630739  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1489  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  37.19 
 
 
113 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3162  nitrogen regulatory protein P-II  34.43 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000317831  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  38.52 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1361  nitrogen regulatory protein P-II  38.98 
 
 
121 aa  75.5  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.212904  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2310  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  33.61 
 
 
112 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0255165  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1355  nitrogen regulatory protein p-II  36.89 
 
 
112 aa  74.7  0.0000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1433  nitrogen regulatory protein P-II  35.59 
 
 
106 aa  73.9  0.0000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2478  nitrogen regulatory protein P-II  36.07 
 
 
112 aa  73.9  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.464409  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2217  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  35.71 
 
 
112 aa  73.9  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1065  nitrogen regulatory protein P-II  33.88 
 
 
112 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3635  nitrogen regulatory protein P-II  38.52 
 
 
112 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.284455 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2477  nitrogen regulatory protein P-II  34.43 
 
 
112 aa  73.6  0.0000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.698113  normal  0.567778 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0435  nitrogen regulatory protein P-II  38.98 
 
 
112 aa  72.8  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.17538  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0564  nitrogen regulatory protein P-II  37.9 
 
 
112 aa  73.2  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000717962  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4445  nitrogen regulatory protein P-II, GlnB, GlnK  32.23 
 
 
112 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1879  nitrogen regulatory protein P-II  37.7 
 
 
112 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000257329  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0969  nitrogen regulatory protein P-II  33.88 
 
 
112 aa  73.6  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2480  nitrogen regulatory protein P-II  36.07 
 
 
112 aa  72.4  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.312055  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  35.25 
 
 
112 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4813  nitrogen regulatory protein P-II  32.23 
 
 
112 aa  72.4  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311514  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1359  nitrogen regulatory protein P-II  35.54 
 
 
121 aa  72.4  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.202328  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0014  nitrogen regulatory protein P-II  34.71 
 
 
112 aa  72.8  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0394648 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  36.07 
 
 
112 aa  72.4  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0158  nitrogen regulatory protein P-II  35.9 
 
 
110 aa  72.8  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.828018  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0240  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  35.25 
 
 
112 aa  72.4  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0726  nitrogen regulatory protein P-II  37.19 
 
 
112 aa  72.8  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1565  nitrogen regulatory protein P-II  32.26 
 
 
112 aa  72  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.204869  normal  0.0818079 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1752  nitrogen regulatory protein P-II  38.98 
 
 
118 aa  72  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.435778  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1188  nitrogen regulatory protein P-II  31.4 
 
 
112 aa  71.6  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671677  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3176  nitrogen regulatory protein P-II  35.54 
 
 
115 aa  72  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00223348 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12933  nitrogen regulatory protein P-II glnB  32.23 
 
 
112 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.30403e-36  normal  0.258229 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1830  nitrogen regulatory protein P-II  33.61 
 
 
115 aa  71.6  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.579927  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4574  nitrogen regulatory protein P-II  34.68 
 
 
112 aa  71.6  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0560  nitrogen regulatory protein P-II  36.97 
 
 
108 aa  71.6  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000121582  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5933  nitrogen regulatory protein P-II  33.87 
 
 
112 aa  71.2  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1730  nitrogen regulatory protein P-II  36.36 
 
 
112 aa  71.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.434906  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1657  nitrogen regulatory protein P-II  36.36 
 
 
112 aa  71.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.655901  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  34.43 
 
 
112 aa  71.2  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0429  nitrogen regulatory protein P-II 1  34.43 
 
 
112 aa  71.2  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.398049  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0085  nitrogen regulatory protein P-II  39.13 
 
 
112 aa  71.2  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0981  nitrogen regulatory protein P-II  33.06 
 
 
112 aa  71.2  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.502811  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3091  nitrogen regulatory protein P-II  35.04 
 
 
108 aa  71.6  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1937  nitrogen regulatory protein P-II  33.06 
 
 
112 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>