More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0436 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0436  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 
146 aa  293  6e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.447184  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1554  nitrogen regulatory protein P-II  37.93 
 
 
125 aa  85.9  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1025  nitrogen regulatory protein P-II  36.55 
 
 
126 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2819  nitrogen regulatory protein P-II  37.41 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.587201  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1048  nitrogen regulatory protein P-II  32.88 
 
 
127 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1432  nitrogen regulatory protein P-II  35.86 
 
 
128 aa  77.8  0.00000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0100  nitrogen regulatory protein P-II  31.72 
 
 
121 aa  77.4  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.250689  normal  0.0316533 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0953  nitrogen regulatory protein P-II  33.1 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  33.1 
 
 
112 aa  77  0.00000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1124  nitrogen regulatory protein P-II  33.1 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0770383  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1801  nitrogen regulatory protein P-II  31.72 
 
 
121 aa  76.3  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0660  nitrogen regulatory protein P-II  31.03 
 
 
121 aa  76.3  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.187673  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0145  nitrogen regulatory protein P-II  35.17 
 
 
120 aa  76.3  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.550451  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0169  nitrogen regulatory protein P-II  34.48 
 
 
125 aa  75.5  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00936567  normal  0.629139 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_942  nitrogen regulatory protein P-II  33.79 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0063  nitrogen regulatory protein P-II  31.03 
 
 
121 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1156  nitrogen regulatory protein P-II  32.19 
 
 
130 aa  72.4  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1530  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  35.86 
 
 
125 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.858615  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1246  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  36.73 
 
 
125 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000500613  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2273  nitrogen regulatory protein P-II  35.17 
 
 
112 aa  70.9  0.000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.201182  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0935  nitrogen regulatory protein P-II  30.34 
 
 
112 aa  70.1  0.000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000154174  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0559  nitrogen regulatory protein P-II  35.37 
 
 
139 aa  69.7  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000146576  normal  0.195853 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0556  nitrogen regulatory protein P-II  31.03 
 
 
112 aa  70.1  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1753  nitrogen regulatory protein P-II  36.05 
 
 
125 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.424498  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0836  nitrogen regulatory protein P-II  36.73 
 
 
124 aa  68.6  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2279  P-II family nitrogen regulatory protein  30.34 
 
 
123 aa  68.2  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000418064  normal  0.159182 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1629  nitrogen regulatory protein P-II  34.69 
 
 
125 aa  68.2  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000227966  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0865  nitrogen regulatory protein P-II  29.66 
 
 
112 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.445753 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1065  nitrogen regulatory protein P-II  30.34 
 
 
112 aa  67  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  34.25 
 
 
112 aa  67  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0683  nitrogen regulatory protein P-II  35.62 
 
 
125 aa  67  0.00000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0141  nitrogen regulatory protein P-II  31.72 
 
 
111 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457658  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1017  nitrogen regulatory protein P-II  31.72 
 
 
113 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000487669  normal  0.288979 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  33.1 
 
 
112 aa  65.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0550  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  40 
 
 
114 aa  65.9  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0094622  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1300  nitrogen regulatory protein P-II  33.1 
 
 
112 aa  65.9  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00561712  normal  0.201127 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0148  nitrogen regulatory protein P-II  31.03 
 
 
112 aa  65.9  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0104  nitrogen regulatory protein P-II  32.41 
 
 
112 aa  65.5  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1695  nitrogen regulatory protein P-II  31.72 
 
 
112 aa  65.5  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.596367 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2357  nitrogen regulatory protein P-II  31.03 
 
 
112 aa  65.1  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  31.72 
 
 
112 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0321  nitrogen regulatory protein P-II  34.48 
 
 
112 aa  65.1  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  31.03 
 
 
112 aa  65.1  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4813  nitrogen regulatory protein P-II  28.28 
 
 
112 aa  65.5  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311514  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2852  nitrogen regulatory protein P-II  29.66 
 
 
112 aa  65.1  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287324  normal  0.0455746 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2577  nitrogen regulatory protein P-II  35.97 
 
 
122 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2036  nitrogen regulatory protein P-II  32.41 
 
 
112 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.504448  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0800  nitrogen regulatory protein P-II  31.72 
 
 
112 aa  64.7  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0014  nitrogen regulatory protein P-II  31.03 
 
 
112 aa  64.7  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0394648 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3092  nitrogen regulatory protein P-II  33.1 
 
 
131 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1951  nitrogen regulatory protein P-II  34 
 
 
125 aa  64.3  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0122455  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1144  nitrogen regulatory protein P-II  33.57 
 
 
135 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.931676  normal  0.946017 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2050  nitrogen regulatory protein P-II  33.56 
 
 
112 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.885894  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  28.97 
 
 
112 aa  63.9  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  30.34 
 
 
112 aa  63.9  0.0000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  28.97 
 
 
112 aa  63.9  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  30.34 
 
 
112 aa  63.5  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  31.72 
 
 
112 aa  63.5  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1830  nitrogen regulatory protein P-II  28.97 
 
 
115 aa  63.5  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.579927  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0047  nitrogen regulatory protein P-II  31.72 
 
 
112 aa  63.9  0.0000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287221  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  30.34 
 
 
112 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5499  nitrogen regulatory protein P-II  32.88 
 
 
112 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  30.34 
 
 
112 aa  63.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2863  nitrogen regulatory protein P-II  31.03 
 
 
112 aa  62.8  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00920081  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2374  nitrogen regulatory protein P-II  32.41 
 
 
112 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.353669 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2651  nitrogen regulatory protein P-II  32.41 
 
 
112 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2274  nitrogen regulatory protein P-II  30.34 
 
 
112 aa  63.2  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.468205  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2480  nitrogen regulatory protein P-II  31.72 
 
 
112 aa  63.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.312055  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5130  nitrogen regulatory protein P-II  32.41 
 
 
112 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.179689  normal  0.884639 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2330  nitrogen regulatory protein P-II  32.41 
 
 
112 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.678822  normal  0.202545 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1879  nitrogen regulatory protein P-II  30.34 
 
 
112 aa  62.8  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000257329  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2098  nitrogen regulatory protein P-II  32.88 
 
 
112 aa  62  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.221402  hitchhiker  0.00315077 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2374  nitrogen regulatory protein P-II  32.88 
 
 
112 aa  62  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.35771 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2209  nitrogen regulatory protein P-II  32.19 
 
 
112 aa  62.4  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.448638  normal  0.538315 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2310  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  28.28 
 
 
112 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0255165  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0193  nitrogen regulatory protein P-II  31.03 
 
 
112 aa  62.4  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  31.03 
 
 
112 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2478  nitrogen regulatory protein P-II  31.03 
 
 
112 aa  62  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.464409  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2615  nitrogen regulatory protein P-II  33.1 
 
 
124 aa  62  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5933  nitrogen regulatory protein P-II  28.97 
 
 
112 aa  62.4  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1017  nitrogen regulatory protein P-II  31.51 
 
 
126 aa  62.4  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301084  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  31.03 
 
 
112 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0742  nitrogen regulatory protein P-II  33.56 
 
 
125 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  28.28 
 
 
112 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2085  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  32.41 
 
 
112 aa  61.6  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1109  nitrogen regulatory protein P-II  33.1 
 
 
112 aa  62  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0303979  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0742  nitrogen regulatory protein P-II  31.43 
 
 
112 aa  61.6  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0112645  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3038  nitrogen regulatory protein P-II 1  30.34 
 
 
112 aa  61.6  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.196983  normal  0.293626 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0850  nitrogen regulatory protein P-II  29.93 
 
 
113 aa  61.6  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1481  nitrogen regulatory protein P-II  31.72 
 
 
112 aa  61.6  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.19711 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7999  nitrogen regulatory protein P-II  28.97 
 
 
112 aa  61.2  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1565  nitrogen regulatory protein P-II  26.21 
 
 
112 aa  61.2  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.204869  normal  0.0818079 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  30.34 
 
 
112 aa  61.2  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0642  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  30.34 
 
 
112 aa  61.2  0.000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0211837  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0715  nitrogen regulatory protein P-II  31.72 
 
 
112 aa  60.8  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630678  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1818  nitrogen regulatory protein P-II  32.19 
 
 
112 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.900474  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1786  nitrogen regulatory protein P-II  26.9 
 
 
112 aa  60.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0435  nitrogen regulatory protein P-II  29.5 
 
 
112 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.17538  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0846  nitrogen regulatory protein P-II  31.03 
 
 
112 aa  60.8  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124556  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4832  nitrogen regulatory protein P-II  29.66 
 
 
112 aa  60.8  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>