More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0742 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0742  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 
125 aa  251  3e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0683  nitrogen regulatory protein P-II  83.2 
 
 
125 aa  215  1e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1951  nitrogen regulatory protein P-II  80.8 
 
 
125 aa  210  3.9999999999999995e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0122455  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1530  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  80.8 
 
 
125 aa  206  6e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.858615  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1246  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  80.8 
 
 
125 aa  206  1e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000500613  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1629  nitrogen regulatory protein P-II  75.81 
 
 
125 aa  196  7e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000227966  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1753  nitrogen regulatory protein P-II  71.77 
 
 
125 aa  178  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.424498  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1156  nitrogen regulatory protein P-II  55.2 
 
 
130 aa  142  2e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1017  nitrogen regulatory protein P-II  55.2 
 
 
126 aa  136  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301084  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2615  nitrogen regulatory protein P-II  53.23 
 
 
124 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3092  nitrogen regulatory protein P-II  43.75 
 
 
131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0836  nitrogen regulatory protein P-II  49.19 
 
 
124 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1025  nitrogen regulatory protein P-II  45.74 
 
 
126 aa  102  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0169  nitrogen regulatory protein P-II  43.2 
 
 
125 aa  101  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00936567  normal  0.629139 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2819  nitrogen regulatory protein P-II  45.74 
 
 
126 aa  99.8  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.587201  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0660  nitrogen regulatory protein P-II  46.77 
 
 
121 aa  97.4  5e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.187673  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0100  nitrogen regulatory protein P-II  47.58 
 
 
121 aa  97.1  8e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.250689  normal  0.0316533 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1801  nitrogen regulatory protein P-II  47.58 
 
 
121 aa  96.7  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0145  nitrogen regulatory protein P-II  41.86 
 
 
120 aa  95.5  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.550451  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0063  nitrogen regulatory protein P-II  45.97 
 
 
121 aa  92  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2279  P-II family nitrogen regulatory protein  45.38 
 
 
123 aa  91.3  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000418064  normal  0.159182 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1554  nitrogen regulatory protein P-II  44.62 
 
 
125 aa  87  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02445  regulatory protein P-II for glutamine synthetase  38.71 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1115  nitrogen regulatory protein P-II  38.71 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  38.71 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2937  nitrogen regulatory protein P-II 1  38.71 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  38.71 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2720  nitrogen regulatory protein P-II 1  38.71 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1124  nitrogen regulatory protein P-II 1  38.71 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3787  nitrogen regulatory protein P-II 1  38.71 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02409  hypothetical protein  38.71 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2803  nitrogen regulatory protein P-II 1  38.71 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2838  nitrogen regulatory protein P-II 1  38.71 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2762  nitrogen regulatory protein P-II 1  38.71 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2918  nitrogen regulatory protein P-II 1  38.71 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.94675  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2824  nitrogen regulatory protein P-II 1  38.71 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  38.71 
 
 
112 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1048  nitrogen regulatory protein P-II  42.54 
 
 
127 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  38.71 
 
 
112 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1432  nitrogen regulatory protein P-II  39.84 
 
 
128 aa  79.7  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3038  nitrogen regulatory protein P-II 1  37.9 
 
 
112 aa  80.1  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.196983  normal  0.293626 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  40.32 
 
 
112 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2767  nitrogen regulatory protein P-II  37.9 
 
 
112 aa  79.3  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  37.9 
 
 
112 aa  79  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03218  hypothetical protein  38.71 
 
 
114 aa  79  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002766  nitrogen regulatory protein P-II  37.9 
 
 
112 aa  78.6  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370925  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3649  nitrogen regulatory protein P-II 1  36.29 
 
 
112 aa  78.6  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  37.1 
 
 
114 aa  78.6  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1227  nitrogen regulatory protein P-II 1  36.29 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0681  nitrogen regulatory protein P-II  37.9 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197163  normal  0.4321 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3048  nitrogen regulatory protein P-II 1  36.29 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1086  nitrogen regulatory protein P-II  37.1 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  39.52 
 
 
112 aa  77  0.00000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2604  nitrogen regulatory protein P-II  37.1 
 
 
112 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320307  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1262  nitrogen regulatory protein P-II 1  35.48 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297918  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  37.1 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3631  nitrogen regulatory protein P-II 1  35.48 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2036  nitrogen regulatory protein P-II  37.9 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.504448  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2408  nitrogen regulatory protein P-II  37.1 
 
 
112 aa  76.6  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.82113  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  37.9 
 
 
112 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  37.1 
 
 
112 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  37.1 
 
 
112 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1155  nitrogen regulatory protein P-II 1  35.48 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.717243  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3162  nitrogen regulatory protein P-II  37.1 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000317831  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0935  nitrogen regulatory protein P-II  36.29 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0360863  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0683  nitrogen regulatory protein P-II  37.1 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.173796  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0321  nitrogen regulatory protein P-II  40.8 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0269  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  37.9 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.76816  normal  0.184312 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0800  nitrogen regulatory protein P-II  37.9 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  37.1 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  38.71 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1494  nitrogen regulatory protein P-II  38.71 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2711  nitrogen regulatory protein P-II  36.29 
 
 
112 aa  74.7  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000634529  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1168  nitrogen regulatory protein P-II  36.29 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2879  nitrogen regulatory protein P-II  35.48 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  35.48 
 
 
112 aa  74.7  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  39.52 
 
 
112 aa  74.7  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1133  nitrogen regulatory protein P-II  35.48 
 
 
112 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0240  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  38.71 
 
 
112 aa  74.7  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3223  nitrogen regulatory protein P-II  35.48 
 
 
112 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.808026  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1118  nitrogen regulatory protein P-II  37.9 
 
 
112 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4404  nitrogen regulatory protein P-II  37.1 
 
 
117 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795902  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0371  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  37.1 
 
 
112 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1069  nitrogen regulatory protein P-II  35.48 
 
 
112 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.607168  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4381  nitrogen regulatory protein P-II  37.1 
 
 
117 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7409  nitrogen regulatory protein P-II  39.2 
 
 
112 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0451  nitrogen regulatory protein P-II  36.29 
 
 
112 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164177  normal  0.269933 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  35.48 
 
 
112 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2168  nitrogen regulatory protein P-II  37.1 
 
 
112 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000216085  hitchhiker  0.000000791345 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2629  nitrogen regulatory protein P-II  37.9 
 
 
112 aa  73.9  0.0000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.594654  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1695  nitrogen regulatory protein P-II  40.94 
 
 
112 aa  73.9  0.0000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.596367 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2480  nitrogen regulatory protein P-II  38.71 
 
 
112 aa  73.6  0.0000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.312055  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3519  nitrogen regulatory protein P-II 1  35.48 
 
 
112 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  36.29 
 
 
112 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6587  nitrogen regulatory protein P-II  39.2 
 
 
112 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.490351 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2945  nitrogen regulatory protein P-II  35.48 
 
 
112 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0214654  normal  0.391037 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3027  nitrogen regulatory protein P-II  35.48 
 
 
112 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3124  nitrogen regulatory protein P-II  35.48 
 
 
112 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.473866  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1516  nitrogen regulatory protein P-II  37.9 
 
 
112 aa  72.8  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.14536 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2387  nitrogen regulatory protein P-II  39.5 
 
 
112 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.344208 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>