More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1246 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1246  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  100 
 
 		 125 aa  248  1e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000500613  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0683  nitrogen regulatory protein P-II  84 
 
 		 125 aa  214  4e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1530  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  84 
 
 		 125 aa  209  1e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.858615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0742  nitrogen regulatory protein P-II  80.8 
 
 		 125 aa  206  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1951  nitrogen regulatory protein P-II  82.4 
 
 		 125 aa  204  4e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0122455  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1629  nitrogen regulatory protein P-II  74.19 
 
 		 125 aa  191  4e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000227966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1753  nitrogen regulatory protein P-II  73.39 
 
 		 125 aa  179  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.424498  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1156  nitrogen regulatory protein P-II  56.8 
 
 		 130 aa  147  4e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1017  nitrogen regulatory protein P-II  57.6 
 
 		 126 aa  140  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2615  nitrogen regulatory protein P-II  56.45 
 
 		 124 aa  135  1e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0836  nitrogen regulatory protein P-II  55 
 
 		 124 aa  122  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3092  nitrogen regulatory protein P-II  46.09 
 
 		 131 aa  119  9e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1025  nitrogen regulatory protein P-II  48.06 
 
 		 126 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0169  nitrogen regulatory protein P-II  46.46 
 
 		 125 aa  107  7.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00936567  normal  0.629139 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2819  nitrogen regulatory protein P-II  46.51 
 
 		 126 aa  104  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.587201  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0100  nitrogen regulatory protein P-II  46.77 
 
 		 121 aa  95.5  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.250689  normal  0.0316533 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0660  nitrogen regulatory protein P-II  45.97 
 
 		 121 aa  95.5  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.187673  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0063  nitrogen regulatory protein P-II  44.44 
 
 		 121 aa  94  6e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0145  nitrogen regulatory protein P-II  42.86 
 
 		 120 aa  89.4  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.550451  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1801  nitrogen regulatory protein P-II  45.16 
 
 		 121 aa  89.7  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1554  nitrogen regulatory protein P-II  44.62 
 
 		 125 aa  86.7  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1048  nitrogen regulatory protein P-II  42.11 
 
 		 127 aa  86.3  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2279  P-II family nitrogen regulatory protein  43.51 
 
 		 123 aa  85.9  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000418064  normal  0.159182 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1432  nitrogen regulatory protein P-II  40.15 
 
 		 128 aa  82  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02445  regulatory protein P-II for glutamine synthetase  39.52 
 
 		 112 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1115  nitrogen regulatory protein P-II  39.52 
 
 		 112 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2918  nitrogen regulatory protein P-II 1  39.52 
 
 		 112 aa  81.6  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.94675  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1124  nitrogen regulatory protein P-II 1  39.52 
 
 		 112 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  39.52 
 
 		 112 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  39.52 
 
 		 112 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2937  nitrogen regulatory protein P-II 1  39.52 
 
 		 112 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2720  nitrogen regulatory protein P-II 1  39.52 
 
 		 112 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2838  nitrogen regulatory protein P-II 1  39.52 
 
 		 112 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02409  hypothetical protein  39.52 
 
 		 112 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2762  nitrogen regulatory protein P-II 1  39.52 
 
 		 112 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2824  nitrogen regulatory protein P-II 1  39.52 
 
 		 112 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3787  nitrogen regulatory protein P-II 1  39.52 
 
 		 112 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2803  nitrogen regulatory protein P-II 1  39.52 
 
 		 112 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3038  nitrogen regulatory protein P-II 1  38.71 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.196983  normal  0.293626 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0240  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  40.32 
 
 		 112 aa  77.4  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  39.52 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  40.32 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2480  nitrogen regulatory protein P-II  40.32 
 
 		 112 aa  76.6  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.312055  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2273  nitrogen regulatory protein P-II  40.8 
 
 		 112 aa  75.1  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.201182  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0559  nitrogen regulatory protein P-II  36.88 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000146576  normal  0.195853 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  38.71 
 
 		 112 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1355  nitrogen regulatory protein p-II  38.4 
 
 		 112 aa  74.3  0.0000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  37.1 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2767  nitrogen regulatory protein P-II  37.1 
 
 		 112 aa  73.6  0.0000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  37.9 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3586  nitrogen regulatory protein P-II  38.84 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0323305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1086  nitrogen regulatory protein P-II  36.29 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2387  nitrogen regulatory protein P-II  38.84 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.344208 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7409  nitrogen regulatory protein P-II  38.84 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4461  nitrogen regulatory protein P-II  34.68 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188449  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  36.29 
 
 		 112 aa  72  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  36.29 
 
 		 112 aa  72  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2408  nitrogen regulatory protein P-II  37.1 
 
 		 112 aa  72  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.82113  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  35.48 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3314  nitrogen regulatory protein P-II  38.84 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0436  nitrogen regulatory protein P-II  36.73 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.447184  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  35.48 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4381  nitrogen regulatory protein P-II  37.9 
 
 		 117 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  35.48 
 
 		 114 aa  72  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6587  nitrogen regulatory protein P-II  38.84 
 
 		 112 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.490351 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2900  nitrogen regulatory protein P-II  38.84 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0642579  normal  0.0916709 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2036  nitrogen regulatory protein P-II  37.1 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.504448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3162  nitrogen regulatory protein P-II  36.29 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000317831  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4404  nitrogen regulatory protein P-II  37.9 
 
 		 117 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795902  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3819  nitrogen regulatory protein P-II  38.02 
 
 		 112 aa  72  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2559  nitrogen regulatory protein P-II  38.84 
 
 		 112 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32282  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1921  nitrogen regulatory protein P-II  40.5 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  37.1 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18621  nitrogen regulatory protein P-II  39.2 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.436109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1065  nitrogen regulatory protein P-II  37.1 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0993  nitrogen regulatory protein P-II  39.2 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.469718  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3048  nitrogen regulatory protein P-II 1  35.48 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1737  nitrogen regulatory protein P-II  39.67 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595912  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1227  nitrogen regulatory protein P-II 1  35.48 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  35.48 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3024  nitrogen regulatory protein P-II  37.9 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0429  nitrogen regulatory protein P-II 1  37.1 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.398049  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1516  nitrogen regulatory protein P-II  37.1 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.14536 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3649  nitrogen regulatory protein P-II 1  34.68 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  37.1 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1005  nitrogen regulatory protein P-II  39.67 
 
 		 112 aa  70.1  0.000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0971  nitrogen regulatory protein P-II  39.67 
 
 		 112 aa  70.1  0.000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2088  nitrogen regulatory protein P-II  39.67 
 
 		 112 aa  70.1  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0935  nitrogen regulatory protein P-II  35.48 
 
 		 112 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0360863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3598  nitrogen regulatory protein P-II  38.4 
 
 		 113 aa  70.1  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1095  nitrogen regulatory protein P-II  35.48 
 
 		 112 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03218  hypothetical protein  35.48 
 
 		 114 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1695  nitrogen regulatory protein P-II  42.62 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.596367 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  36.8 
 
 		 112 aa  69.3  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  37.1 
 
 		 112 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2711  nitrogen regulatory protein P-II  35.48 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000634529  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1168  nitrogen regulatory protein P-II  35.48 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1545  nitrogen regulatory protein P-II  38.84 
 
 		 112 aa  70.1  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2842  nitrogen regulatory protein P-II  37.5 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1144  nitrogen regulatory protein P-II  33.09 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.931676  normal  0.946017 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>