More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1530 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1530  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  100 
 
 
125 aa  248  3e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.858615  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0683  nitrogen regulatory protein P-II  86.4 
 
 
125 aa  218  1.9999999999999999e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1951  nitrogen regulatory protein P-II  86.4 
 
 
125 aa  215  2e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0122455  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1246  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  84 
 
 
125 aa  209  1e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000500613  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0742  nitrogen regulatory protein P-II  80.8 
 
 
125 aa  206  6e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1629  nitrogen regulatory protein P-II  75.81 
 
 
125 aa  197  5e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000227966  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1753  nitrogen regulatory protein P-II  74.19 
 
 
125 aa  186  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.424498  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2615  nitrogen regulatory protein P-II  57.26 
 
 
124 aa  142  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1017  nitrogen regulatory protein P-II  56 
 
 
126 aa  134  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301084  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1156  nitrogen regulatory protein P-II  51.2 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3092  nitrogen regulatory protein P-II  50.78 
 
 
131 aa  130  9e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0836  nitrogen regulatory protein P-II  52 
 
 
124 aa  123  8.000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1025  nitrogen regulatory protein P-II  48.06 
 
 
126 aa  106  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2819  nitrogen regulatory protein P-II  47.29 
 
 
126 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.587201  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0169  nitrogen regulatory protein P-II  44.88 
 
 
125 aa  95.5  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00936567  normal  0.629139 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0660  nitrogen regulatory protein P-II  43.55 
 
 
121 aa  90.1  8e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.187673  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0100  nitrogen regulatory protein P-II  44.35 
 
 
121 aa  90.1  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.250689  normal  0.0316533 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0145  nitrogen regulatory protein P-II  40.31 
 
 
120 aa  89  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.550451  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1048  nitrogen regulatory protein P-II  43.85 
 
 
127 aa  87.4  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2279  P-II family nitrogen regulatory protein  43.08 
 
 
123 aa  87  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000418064  normal  0.159182 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0063  nitrogen regulatory protein P-II  41.86 
 
 
121 aa  85.9  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1801  nitrogen regulatory protein P-II  42.74 
 
 
121 aa  85.9  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1554  nitrogen regulatory protein P-II  43.85 
 
 
125 aa  85.1  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02445  regulatory protein P-II for glutamine synthetase  40.32 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1115  nitrogen regulatory protein P-II  40.32 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02409  hypothetical protein  40.32 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2937  nitrogen regulatory protein P-II 1  40.32 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  40.32 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2838  nitrogen regulatory protein P-II 1  40.32 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2720  nitrogen regulatory protein P-II 1  40.32 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2762  nitrogen regulatory protein P-II 1  40.32 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1432  nitrogen regulatory protein P-II  40.15 
 
 
128 aa  83.2  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  40.32 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2918  nitrogen regulatory protein P-II 1  40.32 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.94675  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2803  nitrogen regulatory protein P-II 1  40.32 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3787  nitrogen regulatory protein P-II 1  40.32 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1124  nitrogen regulatory protein P-II 1  40.32 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2824  nitrogen regulatory protein P-II 1  40.32 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0559  nitrogen regulatory protein P-II  37.14 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000146576  normal  0.195853 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3038  nitrogen regulatory protein P-II 1  39.52 
 
 
112 aa  80.1  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.196983  normal  0.293626 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  39.52 
 
 
112 aa  77  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0240  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  39.52 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2480  nitrogen regulatory protein P-II  40.32 
 
 
112 aa  77  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.312055  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  37.1 
 
 
112 aa  76.6  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2036  nitrogen regulatory protein P-II  38.71 
 
 
112 aa  77  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.504448  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1086  nitrogen regulatory protein P-II  37.9 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  37.9 
 
 
112 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  37.9 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  37.1 
 
 
114 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1494  nitrogen regulatory protein P-II  40.32 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2767  nitrogen regulatory protein P-II  37.9 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4461  nitrogen regulatory protein P-II  35.48 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188449  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3162  nitrogen regulatory protein P-II  37.9 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000317831  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0800  nitrogen regulatory protein P-II  38.71 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  39.52 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0429  nitrogen regulatory protein P-II 1  39.52 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.398049  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7409  nitrogen regulatory protein P-II  39.2 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  36.29 
 
 
112 aa  74.3  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6587  nitrogen regulatory protein P-II  39.2 
 
 
112 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.490351 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2408  nitrogen regulatory protein P-II  37.1 
 
 
112 aa  74.7  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.82113  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  36.29 
 
 
112 aa  74.3  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2273  nitrogen regulatory protein P-II  40.32 
 
 
112 aa  74.7  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.201182  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2387  nitrogen regulatory protein P-II  38.4 
 
 
112 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.344208 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1516  nitrogen regulatory protein P-II  37.9 
 
 
112 aa  73.9  0.0000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.14536 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1355  nitrogen regulatory protein p-II  36.29 
 
 
112 aa  73.9  0.0000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  37.9 
 
 
112 aa  73.9  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  37.1 
 
 
112 aa  73.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0935  nitrogen regulatory protein P-II  36.29 
 
 
112 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0360863  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3819  nitrogen regulatory protein P-II  37.9 
 
 
112 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03218  hypothetical protein  37.1 
 
 
114 aa  73.9  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  39.52 
 
 
112 aa  73.6  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3314  nitrogen regulatory protein P-II  38.4 
 
 
112 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2900  nitrogen regulatory protein P-II  38.4 
 
 
112 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0642579  normal  0.0916709 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1227  nitrogen regulatory protein P-II 1  36.29 
 
 
112 aa  73.6  0.0000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3649  nitrogen regulatory protein P-II 1  35.48 
 
 
112 aa  73.2  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002766  nitrogen regulatory protein P-II  36.29 
 
 
112 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370925  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1168  nitrogen regulatory protein P-II  36.29 
 
 
112 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3048  nitrogen regulatory protein P-II 1  36.29 
 
 
112 aa  73.6  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0550  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  42.45 
 
 
114 aa  73.2  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0094622  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2711  nitrogen regulatory protein P-II  36.29 
 
 
112 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000634529  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1118  nitrogen regulatory protein P-II  37.9 
 
 
112 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0342  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  36.29 
 
 
112 aa  72  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3223  nitrogen regulatory protein P-II  35.48 
 
 
112 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.808026  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1133  nitrogen regulatory protein P-II  35.48 
 
 
112 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  34.68 
 
 
112 aa  72.4  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3631  nitrogen regulatory protein P-II 1  34.68 
 
 
112 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1069  nitrogen regulatory protein P-II  35.48 
 
 
112 aa  72  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.607168  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1155  nitrogen regulatory protein P-II 1  34.68 
 
 
112 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.717243  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  34.68 
 
 
112 aa  72  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2559  nitrogen regulatory protein P-II  38.4 
 
 
112 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32282  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  34.68 
 
 
112 aa  72  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  37.1 
 
 
112 aa  72  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1206  nitrogen regulatory protein P-II  35.48 
 
 
112 aa  72  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1262  nitrogen regulatory protein P-II 1  34.68 
 
 
112 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297918  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0683  nitrogen regulatory protein P-II  36.29 
 
 
112 aa  72  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.173796  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0436  nitrogen regulatory protein P-II  35.86 
 
 
146 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.447184  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1017  nitrogen regulatory protein P-II  40.16 
 
 
113 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000487669  normal  0.288979 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0198  nitrogen regulatory protein P-II  36.29 
 
 
112 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  37.1 
 
 
112 aa  71.6  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3395  nitrogen regulatory protein P-II  37.9 
 
 
112 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>