More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0836 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0836  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 124 aa  244  4e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2615  nitrogen regulatory protein P-II  62.6 
 
 		 124 aa  155  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1017  nitrogen regulatory protein P-II  58.87 
 
 		 126 aa  147  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1951  nitrogen regulatory protein P-II  55.2 
 
 		 125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0122455  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1530  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  52 
 
 		 125 aa  123  8.000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.858615  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1156  nitrogen regulatory protein P-II  51.61 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1246  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  55 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000500613  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0683  nitrogen regulatory protein P-II  52.42 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3092  nitrogen regulatory protein P-II  50.39 
 
 		 131 aa  118  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1629  nitrogen regulatory protein P-II  51.67 
 
 		 125 aa  116  7.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000227966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0742  nitrogen regulatory protein P-II  49.19 
 
 		 125 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1753  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 125 aa  113  8.999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.424498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2819  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 126 aa  104  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.587201  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1025  nitrogen regulatory protein P-II  43.75 
 
 		 126 aa  101  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1432  nitrogen regulatory protein P-II  46.15 
 
 		 128 aa  92  2e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0169  nitrogen regulatory protein P-II  41.73 
 
 		 125 aa  90.5  8e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00936567  normal  0.629139 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1048  nitrogen regulatory protein P-II  42.64 
 
 		 127 aa  87.4  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0559  nitrogen regulatory protein P-II  36.96 
 
 		 139 aa  86.3  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000146576  normal  0.195853 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0063  nitrogen regulatory protein P-II  42.4 
 
 		 121 aa  84  6e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1144  nitrogen regulatory protein P-II  38.06 
 
 		 135 aa  83.6  8e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.931676  normal  0.946017 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0145  nitrogen regulatory protein P-II  40 
 
 		 120 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.550451  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1554  nitrogen regulatory protein P-II  36 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0881  nitrogen regulatory protein P-II  40 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.24631  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0100  nitrogen regulatory protein P-II  40.48 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.250689  normal  0.0316533 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1801  nitrogen regulatory protein P-II  40.65 
 
 		 121 aa  77.4  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  40 
 
 		 112 aa  76.6  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0660  nitrogen regulatory protein P-II  39.84 
 
 		 121 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.187673  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2279  P-II family nitrogen regulatory protein  38.1 
 
 		 123 aa  75.1  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000418064  normal  0.159182 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  40.8 
 
 		 112 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  40.8 
 
 		 112 aa  75.5  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  39.2 
 
 		 112 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1610  nitrogen regulatory protein P-II  38.4 
 
 		 112 aa  74.3  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1613  nitrogen regulatory protein P-II  37.4 
 
 		 112 aa  74.3  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0485  nitrogen regulatory protein P-II  38.4 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.65619  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1066  nitrogen regulatory protein P-II  37.6 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.775357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1081  nitrogen regulatory protein P-II  39.2 
 
 		 113 aa  73.9  0.0000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.630739  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1061  nitrogen regulatory protein P-II  36.59 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.102544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4381  nitrogen regulatory protein P-II  40 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1065  nitrogen regulatory protein P-II  37.82 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4404  nitrogen regulatory protein P-II  40 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795902  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4832  nitrogen regulatory protein P-II  40 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0939  nitrogen regulatory protein P-II, putative  38.4 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1064  nitrogen regulatory protein P-II  36.8 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2209  nitrogen regulatory protein P-II  40 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.448638  normal  0.538315 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0472  nitrogen regulatory protein P-II  38.4 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1507  nitrogen regulatory protein P-II  36.8 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1481  nitrogen regulatory protein P-II  36.8 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.19711 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  36 
 
 		 112 aa  70.1  0.000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1017  nitrogen regulatory protein P-II  34.96 
 
 		 113 aa  70.1  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000487669  normal  0.288979 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0014  nitrogen regulatory protein P-II  35.77 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0394648 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5499  nitrogen regulatory protein P-II  39.2 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1611  nitrogen regulatory protein P-II  36 
 
 		 112 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3586  nitrogen regulatory protein P-II  37.6 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0323305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2709  nitrogen regulatory protein P-II  36 
 
 		 112 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000195324 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2217  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  36.8 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0884  nitrogen regulatory protein P-II  35.2 
 
 		 112 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.275382  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1079  nitrogen regulatory protein P-II  33.6 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.908178  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1063  nitrogen regulatory protein P-II  36.97 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.710847  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1730  nitrogen regulatory protein P-II  36 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.434906  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1657  nitrogen regulatory protein P-II  36 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.655901  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23790  nitrogen regulatory protein P-II  37.6 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.411454  normal  0.269755 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2387  nitrogen regulatory protein P-II  36 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.344208 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0436  nitrogen regulatory protein P-II  36.73 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.447184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  35.2 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0883  nitrogen regulatory protein P-II  37.6 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.386299  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1695  nitrogen regulatory protein P-II  37.4 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.596367 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2577  nitrogen regulatory protein P-II  34.48 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  38.4 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  35.2 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2478  nitrogen regulatory protein P-II  37.6 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.464409  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2206  nitrogen regulatory protein P-II  38.4 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.642209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2374  nitrogen regulatory protein P-II  37.6 
 
 		 112 aa  67  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.35771 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2098  nitrogen regulatory protein P-II  37.6 
 
 		 112 aa  67  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.221402  hitchhiker  0.00315077 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2480  nitrogen regulatory protein P-II  38.4 
 
 		 112 aa  67  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.312055  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  36 
 
 		 112 aa  67  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  36 
 
 		 112 aa  67  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0517  nitrogen regulatory protein P-II  34.96 
 
 		 113 aa  67  0.00000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000164694  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  36 
 
 		 112 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0531  nitrogen regulatory protein P-II  34.96 
 
 		 113 aa  67  0.00000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00497558  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3627  nitrogen regulatory protein P-II  36.8 
 
 		 112 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1063  nitrogen regulatory protein P-II  34.4 
 
 		 112 aa  67  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.403176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2252  nitrogen regulatory protein P-II  36 
 
 		 112 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0233324  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0437  nitrogen regulatory protein P-II  36 
 
 		 112 aa  67  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2921  nitrogen regulatory protein P-II  36 
 
 		 112 aa  67  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0772673  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  36 
 
 		 136 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2050  nitrogen regulatory protein P-II  36.8 
 
 		 112 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.885894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  36 
 
 		 112 aa  67  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2330  nitrogen regulatory protein P-II  36.8 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.678822  normal  0.202545 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0552  nitrogen regulatory protein P-II  35.2 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524059  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1779  nitrogen regulatory protein P-II  36 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.903734 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0146  nitrogen regulatory protein P-II  36 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220304  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  35.2 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2900  nitrogen regulatory protein P-II  36 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0642579  normal  0.0916709 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_942  nitrogen regulatory protein P-II  33.33 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3314  nitrogen regulatory protein P-II  36 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7409  nitrogen regulatory protein P-II  37.6 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0428  nitrogen regulatory protein P-II  37.6 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1345  nitrogen regulatory protein P-II  36 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4580  nitrogen regulatory protein P-II  36 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.495708  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2273  nitrogen regulatory protein P-II  37.6 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.201182  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>