More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1025 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_1025  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 126 aa  245  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2819  nitrogen regulatory protein P-II  70.63 
 
 		 126 aa  185  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.587201  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1156  nitrogen regulatory protein P-II  48.82 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3092  nitrogen regulatory protein P-II  46.46 
 
 		 131 aa  111  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1246  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  48.06 
 
 		 125 aa  110  7.000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000500613  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1554  nitrogen regulatory protein P-II  53.12 
 
 		 125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0683  nitrogen regulatory protein P-II  46.51 
 
 		 125 aa  107  5e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1530  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  48.06 
 
 		 125 aa  106  9.000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.858615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0559  nitrogen regulatory protein P-II  43.36 
 
 		 139 aa  106  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000146576  normal  0.195853 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1144  nitrogen regulatory protein P-II  44.85 
 
 		 135 aa  105  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.931676  normal  0.946017 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1951  nitrogen regulatory protein P-II  48.03 
 
 		 125 aa  105  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0122455  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2615  nitrogen regulatory protein P-II  43.75 
 
 		 124 aa  103  8e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0145  nitrogen regulatory protein P-II  47.66 
 
 		 120 aa  103  8e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.550451  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0742  nitrogen regulatory protein P-II  45.74 
 
 		 125 aa  102  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0836  nitrogen regulatory protein P-II  43.75 
 
 		 124 aa  101  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0169  nitrogen regulatory protein P-II  44.19 
 
 		 125 aa  100  7e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00936567  normal  0.629139 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1017  nitrogen regulatory protein P-II  43.75 
 
 		 126 aa  98.6  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1629  nitrogen regulatory protein P-II  43.41 
 
 		 125 aa  98.2  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000227966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1753  nitrogen regulatory protein P-II  44.96 
 
 		 125 aa  95.9  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.424498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2279  P-II family nitrogen regulatory protein  41.22 
 
 		 123 aa  95.1  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000418064  normal  0.159182 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0063  nitrogen regulatory protein P-II  40.48 
 
 		 121 aa  94.4  4e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0100  nitrogen regulatory protein P-II  41.27 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.250689  normal  0.0316533 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1801  nitrogen regulatory protein P-II  41.27 
 
 		 121 aa  92  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0660  nitrogen regulatory protein P-II  40.48 
 
 		 121 aa  92  3e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.187673  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1432  nitrogen regulatory protein P-II  40.6 
 
 		 128 aa  88.2  4e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0436  nitrogen regulatory protein P-II  36.55 
 
 		 146 aa  82.8  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.447184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1048  nitrogen regulatory protein P-II  39.53 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0550  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  38.74 
 
 		 114 aa  75.9  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0094622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  37.3 
 
 		 112 aa  75.1  0.0000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0556  nitrogen regulatory protein P-II  39.68 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  36.51 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  36.51 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0144  nitrogen regulatory protein P-II  34.75 
 
 		 105 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.419714  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1802  nitrogen regulatory protein P-II  38.14 
 
 		 105 aa  67.4  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  35.71 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2479  nitrogen regulatory protein P-II  37.3 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.494885  normal  0.880519 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0099  nitrogen regulatory protein P-II  37.7 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.477301  normal  0.031272 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1065  nitrogen regulatory protein P-II  33.33 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2273  nitrogen regulatory protein P-II  37.3 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.201182  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2577  nitrogen regulatory protein P-II  36.44 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0953  nitrogen regulatory protein P-II  36.72 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0659  nitrogen regulatory protein P-II  36.89 
 
 		 105 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769311  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1124  nitrogen regulatory protein P-II  35.16 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0770383  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2893  nitrogen regulatory protein P-II  37.9 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0162783  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0064  nitrogen regulatory protein P-II  36.07 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1888  nitrogen regulatory protein P-II  34.92 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_942  nitrogen regulatory protein P-II  35.16 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1017  nitrogen regulatory protein P-II  34.92 
 
 		 113 aa  63.5  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000487669  normal  0.288979 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0881  nitrogen regulatory protein P-II  34.92 
 
 		 112 aa  63.5  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.24631  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1610  nitrogen regulatory protein P-II  34.13 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1300  nitrogen regulatory protein P-II  37.3 
 
 		 112 aa  63.5  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00561712  normal  0.201127 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1695  nitrogen regulatory protein P-II  35.16 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.596367 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1064  nitrogen regulatory protein P-II  36.51 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1047  nitrogen regulatory protein P-II  32.79 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  34.92 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4813  nitrogen regulatory protein P-II  33.33 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0715  nitrogen regulatory protein P-II  34.92 
 
 		 112 aa  62  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630678  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  34.13 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0141  nitrogen regulatory protein P-II  33.33 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457658  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2491  nitrogen regulatory protein P-II  33.33 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0578365  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1235  Nitrogen regulatory protein PII  35.71 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7999  nitrogen regulatory protein P-II  35.71 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  34.13 
 
 		 112 aa  62  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3038  nitrogen regulatory protein P-II 1  34.92 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.196983  normal  0.293626 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  33.33 
 
 		 112 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1611  nitrogen regulatory protein P-II  36.72 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02445  regulatory protein P-II for glutamine synthetase  34.92 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1115  nitrogen regulatory protein P-II  34.92 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2838  nitrogen regulatory protein P-II 1  34.92 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2824  nitrogen regulatory protein P-II 1  34.92 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  34.92 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2918  nitrogen regulatory protein P-II 1  34.92 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.94675  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2310  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  32.54 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0255165  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2803  nitrogen regulatory protein P-II 1  34.92 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2067  nitrogen regulatory protein P-II  31.97 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00356082  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  34.92 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  34.92 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2720  nitrogen regulatory protein P-II 1  34.92 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3787  nitrogen regulatory protein P-II 1  34.92 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2478  nitrogen regulatory protein P-II  34.13 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.464409  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0935  nitrogen regulatory protein P-II  32.54 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000154174  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2762  nitrogen regulatory protein P-II 1  34.92 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1124  nitrogen regulatory protein P-II 1  34.92 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1640  nitrogen regulatory protein P-II  33.33 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.563985  normal  0.465051 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02409  hypothetical protein  34.92 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  34.92 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2937  nitrogen regulatory protein P-II 1  34.92 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0085  nitrogen regulatory protein P-II  34.43 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1613  nitrogen regulatory protein P-II  36.22 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  32.54 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2604  nitrogen regulatory protein P-II  33.33 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320307  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  34.13 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  37.3 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0883  nitrogen regulatory protein P-II  35.16 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.386299  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2408  nitrogen regulatory protein P-II  34.13 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.82113  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  34.13 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  37.3 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  35.71 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0681  nitrogen regulatory protein P-II  32.54 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197163  normal  0.4321 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1061  nitrogen regulatory protein P-II  37.8 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.102544  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>