More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1629 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1629  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 
125 aa  249  1e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000227966  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1753  nitrogen regulatory protein P-II  84.8 
 
 
125 aa  214  2.9999999999999998e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.424498  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1951  nitrogen regulatory protein P-II  76.61 
 
 
125 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0122455  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0683  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 
125 aa  197  3e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1530  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  75.81 
 
 
125 aa  197  5e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.858615  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0742  nitrogen regulatory protein P-II  75.81 
 
 
125 aa  196  7e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1246  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  74.19 
 
 
125 aa  191  4e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000500613  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1017  nitrogen regulatory protein P-II  56.45 
 
 
126 aa  139  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301084  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2615  nitrogen regulatory protein P-II  53.6 
 
 
124 aa  137  7e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1156  nitrogen regulatory protein P-II  54.03 
 
 
130 aa  135  1e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0836  nitrogen regulatory protein P-II  51.67 
 
 
124 aa  116  7.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3092  nitrogen regulatory protein P-II  44.09 
 
 
131 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2819  nitrogen regulatory protein P-II  44.96 
 
 
126 aa  101  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.587201  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1025  nitrogen regulatory protein P-II  43.41 
 
 
126 aa  98.2  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0145  nitrogen regulatory protein P-II  42.31 
 
 
120 aa  88.6  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.550451  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0169  nitrogen regulatory protein P-II  40.5 
 
 
125 aa  89  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00936567  normal  0.629139 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1554  nitrogen regulatory protein P-II  45.04 
 
 
125 aa  89.4  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0100  nitrogen regulatory protein P-II  41.09 
 
 
121 aa  87  8e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.250689  normal  0.0316533 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1801  nitrogen regulatory protein P-II  42.74 
 
 
121 aa  86.3  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0660  nitrogen regulatory protein P-II  41.94 
 
 
121 aa  85.5  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.187673  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0063  nitrogen regulatory protein P-II  41.86 
 
 
121 aa  85.1  3e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  41.13 
 
 
112 aa  85.1  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02445  regulatory protein P-II for glutamine synthetase  40.32 
 
 
112 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1115  nitrogen regulatory protein P-II  40.32 
 
 
112 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2937  nitrogen regulatory protein P-II 1  40.32 
 
 
112 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2918  nitrogen regulatory protein P-II 1  40.32 
 
 
112 aa  84.3  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.94675  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2803  nitrogen regulatory protein P-II 1  40.32 
 
 
112 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  40.32 
 
 
112 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02409  hypothetical protein  40.32 
 
 
112 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  40.32 
 
 
112 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2824  nitrogen regulatory protein P-II 1  40.32 
 
 
112 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2838  nitrogen regulatory protein P-II 1  40.32 
 
 
112 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3787  nitrogen regulatory protein P-II 1  40.32 
 
 
112 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2762  nitrogen regulatory protein P-II 1  40.32 
 
 
112 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1124  nitrogen regulatory protein P-II 1  40.32 
 
 
112 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2720  nitrogen regulatory protein P-II 1  40.32 
 
 
112 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2279  P-II family nitrogen regulatory protein  41.86 
 
 
123 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000418064  normal  0.159182 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0240  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  39.52 
 
 
112 aa  82  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1432  nitrogen regulatory protein P-II  37.12 
 
 
128 aa  81.6  0.000000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3038  nitrogen regulatory protein P-II 1  39.52 
 
 
112 aa  81.3  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.196983  normal  0.293626 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  37.9 
 
 
112 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1345  nitrogen regulatory protein P-II  36.29 
 
 
112 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4461  nitrogen regulatory protein P-II  35.48 
 
 
112 aa  79  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188449  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  38.71 
 
 
112 aa  78.6  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  37.9 
 
 
112 aa  78.6  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1048  nitrogen regulatory protein P-II  38.93 
 
 
127 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  38.71 
 
 
114 aa  77.8  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2310  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  37.5 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0255165  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  39.52 
 
 
136 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0437  nitrogen regulatory protein P-II  39.52 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  37.9 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  39.52 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2252  nitrogen regulatory protein P-II  39.52 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0233324  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  39.52 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2921  nitrogen regulatory protein P-II  39.52 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0772673  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0146  nitrogen regulatory protein P-II  35.48 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220304  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1779  nitrogen regulatory protein P-II  35.48 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.903734 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0559  nitrogen regulatory protein P-II  37.14 
 
 
139 aa  77  0.00000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000146576  normal  0.195853 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2767  nitrogen regulatory protein P-II  37.9 
 
 
112 aa  77  0.00000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  36.29 
 
 
112 aa  77  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3586  nitrogen regulatory protein P-II  37.5 
 
 
112 aa  77  0.00000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0323305  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  42.74 
 
 
112 aa  77  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  37.1 
 
 
112 aa  77  0.00000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2408  nitrogen regulatory protein P-II  37.9 
 
 
112 aa  76.6  0.00000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.82113  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  37.1 
 
 
112 aa  77  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0342  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  37.1 
 
 
112 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  38.71 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0683  nitrogen regulatory protein P-II  35.48 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.173796  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0198  nitrogen regulatory protein P-II  36.29 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  34.68 
 
 
112 aa  76.6  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2387  nitrogen regulatory protein P-II  37.5 
 
 
112 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.344208 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0217  nitrogen regulatory protein P-II  36.29 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000368327 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7409  nitrogen regulatory protein P-II  36.67 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03218  hypothetical protein  38.71 
 
 
114 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  34.68 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1217  nitrogen regulatory protein P-II  38.33 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.967639 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002766  nitrogen regulatory protein P-II  37.9 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370925  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  35.48 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1516  nitrogen regulatory protein P-II  37.1 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.14536 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2852  nitrogen regulatory protein P-II  37.9 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287324  normal  0.0455746 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2900  nitrogen regulatory protein P-II  37.5 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0642579  normal  0.0916709 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2233  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  37.5 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0532084  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1695  nitrogen regulatory protein P-II  42.5 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.596367 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3314  nitrogen regulatory protein P-II  37.5 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  36.29 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2480  nitrogen regulatory protein P-II  38.71 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.312055  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2273  nitrogen regulatory protein P-II  38.71 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.201182  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2036  nitrogen regulatory protein P-II  37.1 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.504448  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  36.29 
 
 
112 aa  74.7  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2559  nitrogen regulatory protein P-II  37.5 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32282  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  33.87 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  33.87 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3649  nitrogen regulatory protein P-II 1  37.1 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6587  nitrogen regulatory protein P-II  36.67 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.490351 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1400  nitrogen regulatory protein P-II  38.71 
 
 
112 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3218  P-II family regulatory protein  38.71 
 
 
112 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472285  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0651  nitrogen regulatory protein P-II  38.71 
 
 
112 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0407  nitrogen regulatory protein P-II  38.71 
 
 
112 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32852  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2827  nitrogen regulatory protein P-II  38.71 
 
 
112 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.994537  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0487  nitrogen regulatory protein P-II  38.71 
 
 
112 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188054  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>