More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2819 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2819  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 126 aa  243  8e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.587201  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1025  nitrogen regulatory protein P-II  70.63 
 
 		 126 aa  185  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1156  nitrogen regulatory protein P-II  50.78 
 
 		 130 aa  120  8e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3092  nitrogen regulatory protein P-II  47.24 
 
 		 131 aa  115  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0559  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 139 aa  106  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000146576  normal  0.195853 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2279  P-II family nitrogen regulatory protein  43.51 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000418064  normal  0.159182 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1530  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  47.29 
 
 		 125 aa  105  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.858615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0836  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 124 aa  104  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1246  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  46.51 
 
 		 125 aa  104  5e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000500613  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0145  nitrogen regulatory protein P-II  46.88 
 
 		 120 aa  103  7e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.550451  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1951  nitrogen regulatory protein P-II  48.06 
 
 		 125 aa  103  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0122455  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0169  nitrogen regulatory protein P-II  46.51 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00936567  normal  0.629139 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1144  nitrogen regulatory protein P-II  45.59 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.931676  normal  0.946017 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2615  nitrogen regulatory protein P-II  49.21 
 
 		 124 aa  101  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1629  nitrogen regulatory protein P-II  44.96 
 
 		 125 aa  101  4e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000227966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0683  nitrogen regulatory protein P-II  44.96 
 
 		 125 aa  100  9e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0742  nitrogen regulatory protein P-II  45.74 
 
 		 125 aa  99.8  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1017  nitrogen regulatory protein P-II  46.09 
 
 		 126 aa  99  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0063  nitrogen regulatory protein P-II  46.46 
 
 		 121 aa  97.1  7e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1753  nitrogen regulatory protein P-II  44.96 
 
 		 125 aa  95.9  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.424498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1554  nitrogen regulatory protein P-II  46.09 
 
 		 125 aa  93.6  9e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1432  nitrogen regulatory protein P-II  43.75 
 
 		 128 aa  93.6  9e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1048  nitrogen regulatory protein P-II  46.92 
 
 		 127 aa  93.2  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0660  nitrogen regulatory protein P-II  43.65 
 
 		 121 aa  91.7  3e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.187673  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0100  nitrogen regulatory protein P-II  44.62 
 
 		 121 aa  92  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.250689  normal  0.0316533 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1801  nitrogen regulatory protein P-II  44.62 
 
 		 121 aa  91.3  4e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0436  nitrogen regulatory protein P-II  37.41 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.447184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0550  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  41.82 
 
 		 114 aa  75.5  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0094622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  43.65 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  39.68 
 
 		 112 aa  75.1  0.0000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0556  nitrogen regulatory protein P-II  39.06 
 
 		 112 aa  75.1  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  38.89 
 
 		 112 aa  74.3  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  40.48 
 
 		 112 aa  73.6  0.0000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  39.68 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1065  nitrogen regulatory protein P-II  35.77 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  41.27 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  39.68 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2273  nitrogen regulatory protein P-II  39.68 
 
 		 112 aa  72  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.201182  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1063  nitrogen regulatory protein P-II  38.1 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.710847  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0715  nitrogen regulatory protein P-II  38.89 
 
 		 112 aa  72  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630678  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  42.06 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  42.06 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2036  nitrogen regulatory protein P-II  36.51 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.504448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  41.27 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0953  nitrogen regulatory protein P-II  37.8 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1879  nitrogen regulatory protein P-II  42.06 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000257329  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00479  nitrogen regulatory protein P-II  38.89 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  35.71 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  35.71 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2408  nitrogen regulatory protein P-II  37.3 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.82113  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1888  nitrogen regulatory protein P-II  40.48 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  40.48 
 
 		 112 aa  70.1  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0552  nitrogen regulatory protein P-II  38.89 
 
 		 112 aa  70.1  0.000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524059  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1124  nitrogen regulatory protein P-II  37.8 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0770383  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1155  nitrogen regulatory protein P-II 1  38.89 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.717243  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2709  nitrogen regulatory protein P-II  42.86 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000195324 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1345  nitrogen regulatory protein P-II  38.1 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1262  nitrogen regulatory protein P-II 1  38.89 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297918  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0104  nitrogen regulatory protein P-II  39.68 
 
 		 112 aa  70.1  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3631  nitrogen regulatory protein P-II 1  38.89 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1507  nitrogen regulatory protein P-II  42.06 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0969  nitrogen regulatory protein P-II  36.51 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.916041  hitchhiker  0.000334887 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  36.51 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0146  nitrogen regulatory protein P-II  38.1 
 
 		 112 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220304  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4832  nitrogen regulatory protein P-II  38.89 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  36.51 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  38.89 
 
 		 112 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1779  nitrogen regulatory protein P-II  38.1 
 
 		 112 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.903734 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  39.68 
 
 		 112 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  38.1 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0491  nitrogen regulatory protein P-II  39.17 
 
 		 112 aa  69.3  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4574  nitrogen regulatory protein P-II  39.68 
 
 		 112 aa  69.3  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2168  nitrogen regulatory protein P-II  35.71 
 
 		 112 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000216085  hitchhiker  0.000000791345 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5933  nitrogen regulatory protein P-II  34.13 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0550  nitrogen regulatory protein P-II  38.89 
 
 		 112 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4461  nitrogen regulatory protein P-II  38.1 
 
 		 112 aa  69.3  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188449  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2861  nitrogen regulatory protein P-II  37.3 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.715878  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  34.92 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3649  nitrogen regulatory protein P-II 1  38.1 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0800  nitrogen regulatory protein P-II  39.68 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002766  nitrogen regulatory protein P-II  38.89 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370925  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_942  nitrogen regulatory protein P-II  37.01 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2893  nitrogen regulatory protein P-II  40.83 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0162783  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4404  nitrogen regulatory protein P-II  39.68 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795902  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4381  nitrogen regulatory protein P-II  39.68 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1071  nitrogen regulatory protein P-II  33.33 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  37.3 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0148  nitrogen regulatory protein P-II  38.89 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  36.51 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1118  nitrogen regulatory protein P-II  34.92 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3819  nitrogen regulatory protein P-II  36.51 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03218  hypothetical protein  38.1 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  36.51 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2577  nitrogen regulatory protein P-II  38.66 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  38.1 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3519  nitrogen regulatory protein P-II 1  33.33 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2863  nitrogen regulatory protein P-II  36.72 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00920081  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2945  nitrogen regulatory protein P-II  33.33 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0214654  normal  0.391037 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3027  nitrogen regulatory protein P-II  33.33 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3124  nitrogen regulatory protein P-II  33.33 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.473866  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>