More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1753 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1753  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 
125 aa  248  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.424498  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1629  nitrogen regulatory protein P-II  84.8 
 
 
125 aa  214  2.9999999999999998e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000227966  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1530  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  74.19 
 
 
125 aa  186  1e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.858615  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0683  nitrogen regulatory protein P-II  70.97 
 
 
125 aa  181  2.0000000000000003e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1246  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  73.39 
 
 
125 aa  179  1e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000500613  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0742  nitrogen regulatory protein P-II  71.77 
 
 
125 aa  178  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1951  nitrogen regulatory protein P-II  70.16 
 
 
125 aa  175  2e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0122455  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2615  nitrogen regulatory protein P-II  55.2 
 
 
124 aa  137  7e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1017  nitrogen regulatory protein P-II  53.23 
 
 
126 aa  128  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301084  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1156  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
130 aa  119  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0836  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
124 aa  113  8.999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3092  nitrogen regulatory protein P-II  44.88 
 
 
131 aa  110  5e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0169  nitrogen regulatory protein P-II  47.24 
 
 
125 aa  100  7e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00936567  normal  0.629139 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2819  nitrogen regulatory protein P-II  44.96 
 
 
126 aa  95.9  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.587201  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1025  nitrogen regulatory protein P-II  44.96 
 
 
126 aa  95.9  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0145  nitrogen regulatory protein P-II  41.54 
 
 
120 aa  89  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.550451  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1554  nitrogen regulatory protein P-II  45.8 
 
 
125 aa  88.2  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2279  P-II family nitrogen regulatory protein  43.85 
 
 
123 aa  86.7  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000418064  normal  0.159182 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0100  nitrogen regulatory protein P-II  42.75 
 
 
121 aa  83.2  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.250689  normal  0.0316533 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1801  nitrogen regulatory protein P-II  44.35 
 
 
121 aa  82.8  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1494  nitrogen regulatory protein P-II  42.74 
 
 
112 aa  82.4  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0660  nitrogen regulatory protein P-II  41.22 
 
 
121 aa  81.3  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.187673  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02445  regulatory protein P-II for glutamine synthetase  39.52 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1115  nitrogen regulatory protein P-II  39.52 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02409  hypothetical protein  39.52 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2824  nitrogen regulatory protein P-II 1  39.52 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2720  nitrogen regulatory protein P-II 1  39.52 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1124  nitrogen regulatory protein P-II 1  39.52 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  39.52 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2762  nitrogen regulatory protein P-II 1  39.52 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2803  nitrogen regulatory protein P-II 1  39.52 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3787  nitrogen regulatory protein P-II 1  39.52 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2838  nitrogen regulatory protein P-II 1  39.52 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  39.52 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2918  nitrogen regulatory protein P-II 1  39.52 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.94675  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2937  nitrogen regulatory protein P-II 1  39.52 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0559  nitrogen regulatory protein P-II  38.57 
 
 
139 aa  79  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000146576  normal  0.195853 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0063  nitrogen regulatory protein P-II  41.22 
 
 
121 aa  79  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1516  nitrogen regulatory protein P-II  40.32 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.14536 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03218  hypothetical protein  39.52 
 
 
114 aa  78.2  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2629  nitrogen regulatory protein P-II  39.52 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.594654  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1432  nitrogen regulatory protein P-II  37.88 
 
 
128 aa  77.8  0.00000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2273  nitrogen regulatory protein P-II  41.13 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.201182  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002766  nitrogen regulatory protein P-II  38.71 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370925  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3038  nitrogen regulatory protein P-II 1  38.71 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.196983  normal  0.293626 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0342  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  38.71 
 
 
112 aa  77  0.00000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  40.32 
 
 
112 aa  77  0.00000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0217  nitrogen regulatory protein P-II  37.9 
 
 
112 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000368327 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0198  nitrogen regulatory protein P-II  37.9 
 
 
112 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2480  nitrogen regulatory protein P-II  41.13 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.312055  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6587  nitrogen regulatory protein P-II  39.52 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.490351 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  40.32 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2767  nitrogen regulatory protein P-II  38.71 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0240  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  40.32 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  38.71 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1086  nitrogen regulatory protein P-II  37.9 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0428  nitrogen regulatory protein P-II  38.71 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1048  nitrogen regulatory protein P-II  37.88 
 
 
127 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1017  nitrogen regulatory protein P-II  42.86 
 
 
113 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000487669  normal  0.288979 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3649  nitrogen regulatory protein P-II 1  37.1 
 
 
112 aa  74.7  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  36.29 
 
 
114 aa  74.3  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7409  nitrogen regulatory protein P-II  38.71 
 
 
112 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1005  nitrogen regulatory protein P-II  41.32 
 
 
112 aa  73.6  0.0000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1903  nitrogen regulatory protein P-II  39.17 
 
 
112 aa  73.6  0.0000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.88445  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2088  nitrogen regulatory protein P-II  41.32 
 
 
112 aa  73.6  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0971  nitrogen regulatory protein P-II  41.32 
 
 
112 aa  73.6  0.0000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1217  nitrogen regulatory protein P-II  39.17 
 
 
112 aa  73.6  0.0000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.967639 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1918  nitrogen regulatory protein P-II  35.48 
 
 
112 aa  73.6  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3047  nitrogen regulatory protein P-II  37.9 
 
 
112 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.414736  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1206  nitrogen regulatory protein P-II  36.29 
 
 
112 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1130  nitrogen regulatory protein P-II  37.1 
 
 
112 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3854  nitrogen regulatory protein P-II  35.48 
 
 
112 aa  73.6  0.0000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.069365 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0939  nitrogen regulatory protein P-II, putative  38.71 
 
 
112 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  35.48 
 
 
112 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0715  nitrogen regulatory protein P-II  39.17 
 
 
112 aa  72.8  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630678  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3631  nitrogen regulatory protein P-II 1  36.29 
 
 
112 aa  73.2  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2536  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  41.13 
 
 
112 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.679414  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  39.52 
 
 
112 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3048  nitrogen regulatory protein P-II 1  37.1 
 
 
112 aa  73.6  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1227  nitrogen regulatory protein P-II 1  37.1 
 
 
112 aa  73.6  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1155  nitrogen regulatory protein P-II 1  36.29 
 
 
112 aa  73.2  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.717243  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  40.32 
 
 
112 aa  72.8  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0472  nitrogen regulatory protein P-II  39.52 
 
 
112 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2326  nitrogen regulatory protein P-II  36.29 
 
 
112 aa  73.2  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.875617  normal  0.385523 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2408  nitrogen regulatory protein P-II  37.1 
 
 
112 aa  73.2  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.82113  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1262  nitrogen regulatory protein P-II 1  36.29 
 
 
112 aa  73.2  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297918  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1355  nitrogen regulatory protein p-II  37.1 
 
 
112 aa  73.2  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  36.29 
 
 
112 aa  72.8  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  37.9 
 
 
112 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  38.71 
 
 
112 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0468  nitrogen regulatory protein P-II  39.52 
 
 
112 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.409463  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1400  nitrogen regulatory protein P-II  39.52 
 
 
112 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0651  nitrogen regulatory protein P-II  39.52 
 
 
112 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4580  nitrogen regulatory protein P-II  37.5 
 
 
112 aa  72.4  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.495708  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0407  nitrogen regulatory protein P-II  39.52 
 
 
112 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32852  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  39.52 
 
 
112 aa  72  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3314  nitrogen regulatory protein P-II  37.5 
 
 
112 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0995  nitrogen regulatory protein P-II  37.1 
 
 
112 aa  72.4  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.882952  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0935  nitrogen regulatory protein P-II  35.48 
 
 
112 aa  72  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0360863  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2827  nitrogen regulatory protein P-II  39.52 
 
 
112 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.994537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>