More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1156 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1156  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 
130 aa  259  1e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1246  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  56.8 
 
 
125 aa  147  4e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000500613  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1017  nitrogen regulatory protein P-II  58.73 
 
 
126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301084  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1951  nitrogen regulatory protein P-II  55.2 
 
 
125 aa  142  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0122455  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0742  nitrogen regulatory protein P-II  55.2 
 
 
125 aa  142  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0683  nitrogen regulatory protein P-II  53.6 
 
 
125 aa  140  7e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1629  nitrogen regulatory protein P-II  54.03 
 
 
125 aa  135  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000227966  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1530  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  51.2 
 
 
125 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.858615  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2615  nitrogen regulatory protein P-II  52.85 
 
 
124 aa  122  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0836  nitrogen regulatory protein P-II  51.61 
 
 
124 aa  122  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2819  nitrogen regulatory protein P-II  50.78 
 
 
126 aa  120  8e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.587201  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1753  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
125 aa  119  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.424498  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3092  nitrogen regulatory protein P-II  48.46 
 
 
131 aa  118  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1025  nitrogen regulatory protein P-II  48.82 
 
 
126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0169  nitrogen regulatory protein P-II  44 
 
 
125 aa  99.8  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00936567  normal  0.629139 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0145  nitrogen regulatory protein P-II  45.38 
 
 
120 aa  99.4  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.550451  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1432  nitrogen regulatory protein P-II  44.88 
 
 
128 aa  97.1  7e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0063  nitrogen regulatory protein P-II  44.72 
 
 
121 aa  94  6e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1048  nitrogen regulatory protein P-II  39.85 
 
 
127 aa  93.2  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0660  nitrogen regulatory protein P-II  40.65 
 
 
121 aa  92  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.187673  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0100  nitrogen regulatory protein P-II  40.65 
 
 
121 aa  92  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.250689  normal  0.0316533 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2279  P-II family nitrogen regulatory protein  39.39 
 
 
123 aa  91.3  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000418064  normal  0.159182 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0559  nitrogen regulatory protein P-II  43.88 
 
 
139 aa  90.9  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000146576  normal  0.195853 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1801  nitrogen regulatory protein P-II  39.84 
 
 
121 aa  87.4  6e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4461  nitrogen regulatory protein P-II  41.6 
 
 
112 aa  84.3  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188449  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1554  nitrogen regulatory protein P-II  38.4 
 
 
125 aa  82.8  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0550  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  46.67 
 
 
114 aa  81.3  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0094622  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1345  nitrogen regulatory protein P-II  40.8 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1144  nitrogen regulatory protein P-II  38.06 
 
 
135 aa  80.5  0.000000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.931676  normal  0.946017 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0146  nitrogen regulatory protein P-II  40 
 
 
112 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220304  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1888  nitrogen regulatory protein P-II  39.84 
 
 
112 aa  78.6  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1779  nitrogen regulatory protein P-II  40 
 
 
112 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.903734 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1065  nitrogen regulatory protein P-II  35.77 
 
 
112 aa  79  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  37.4 
 
 
112 aa  78.6  0.00000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  41.6 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1695  nitrogen regulatory protein P-II  38.21 
 
 
112 aa  77  0.00000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.596367 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  41.6 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2217  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  40.8 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1079  nitrogen regulatory protein P-II  37.4 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.908178  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1730  nitrogen regulatory protein P-II  40.8 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.434906  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  36.8 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1657  nitrogen regulatory protein P-II  40.8 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.655901  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  36.8 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1610  nitrogen regulatory protein P-II  37.4 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2842  nitrogen regulatory protein P-II  39.84 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_002936  DET1124  nitrogen regulatory protein P-II  34.96 
 
 
112 aa  74.7  0.0000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0770383  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  40.8 
 
 
112 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  40.8 
 
 
112 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0556  nitrogen regulatory protein P-II  36.59 
 
 
112 aa  74.3  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1081  nitrogen regulatory protein P-II  35.48 
 
 
113 aa  73.9  0.0000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.630739  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_942  nitrogen regulatory protein P-II  34.15 
 
 
112 aa  73.9  0.0000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4574  nitrogen regulatory protein P-II  38.21 
 
 
112 aa  73.2  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3635  nitrogen regulatory protein P-II  38.21 
 
 
112 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.284455 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2310  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  37.4 
 
 
112 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0255165  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  40 
 
 
112 aa  72.8  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1017  nitrogen regulatory protein P-II  37.6 
 
 
113 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000487669  normal  0.288979 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2273  nitrogen regulatory protein P-II  35.77 
 
 
112 aa  72.4  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.201182  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  34.96 
 
 
112 aa  72.4  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1613  nitrogen regulatory protein P-II  36.59 
 
 
112 aa  72  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1516  nitrogen regulatory protein P-II  38.4 
 
 
112 aa  72.8  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.14536 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0436  nitrogen regulatory protein P-II  32.19 
 
 
146 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.447184  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  39.2 
 
 
112 aa  72.4  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1061  nitrogen regulatory protein P-II  37.4 
 
 
112 aa  72  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.102544  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1064  nitrogen regulatory protein P-II  37.4 
 
 
112 aa  72  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0193  nitrogen regulatory protein P-II  36.59 
 
 
112 aa  71.6  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0953  nitrogen regulatory protein P-II  34.15 
 
 
112 aa  71.6  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  39.2 
 
 
112 aa  71.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1020  nitrogen regulatory protein P-II  36.59 
 
 
113 aa  71.2  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.852949  normal  0.847893 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2709  nitrogen regulatory protein P-II  40 
 
 
112 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000195324 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12933  nitrogen regulatory protein P-II glnB  36.59 
 
 
112 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.30403e-36  normal  0.258229 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2783  nitrogen regulatory protein P-II  36.75 
 
 
109 aa  71.6  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  36.8 
 
 
112 aa  70.9  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4404  nitrogen regulatory protein P-II  39.2 
 
 
117 aa  70.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795902  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0883  nitrogen regulatory protein P-II  38.21 
 
 
112 aa  71.2  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.386299  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0321  nitrogen regulatory protein P-II  36.59 
 
 
112 aa  70.9  0.000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4381  nitrogen regulatory protein P-II  39.2 
 
 
117 aa  70.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02445  regulatory protein P-II for glutamine synthetase  38.4 
 
 
112 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1115  nitrogen regulatory protein P-II  38.4 
 
 
112 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2937  nitrogen regulatory protein P-II 1  38.4 
 
 
112 aa  70.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2803  nitrogen regulatory protein P-II 1  38.4 
 
 
112 aa  70.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2762  nitrogen regulatory protein P-II 1  38.4 
 
 
112 aa  70.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0881  nitrogen regulatory protein P-II  36.59 
 
 
112 aa  70.9  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.24631  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2838  nitrogen regulatory protein P-II 1  38.4 
 
 
112 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02409  hypothetical protein  38.4 
 
 
112 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  38.4 
 
 
112 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2918  nitrogen regulatory protein P-II 1  38.4 
 
 
112 aa  70.9  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.94675  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2824  nitrogen regulatory protein P-II 1  38.4 
 
 
112 aa  70.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0935  nitrogen regulatory protein P-II  38.21 
 
 
112 aa  70.9  0.000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000154174  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2720  nitrogen regulatory protein P-II 1  38.4 
 
 
112 aa  70.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  38.4 
 
 
112 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3787  nitrogen regulatory protein P-II 1  38.4 
 
 
112 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1124  nitrogen regulatory protein P-II 1  38.4 
 
 
112 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1023  nitrogen regulatory protein P-II  37.6 
 
 
112 aa  70.5  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.350926  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3649  nitrogen regulatory protein P-II 1  38.4 
 
 
112 aa  70.5  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0550  nitrogen regulatory protein P-II  37.4 
 
 
112 aa  70.5  0.000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1640  nitrogen regulatory protein P-II  35.48 
 
 
123 aa  70.1  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.563985  normal  0.465051 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0969  nitrogen regulatory protein P-II  36.59 
 
 
112 aa  70.1  0.000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.916041  hitchhiker  0.000334887 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1830  nitrogen regulatory protein P-II  36.59 
 
 
115 aa  70.1  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.579927  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5499  nitrogen regulatory protein P-II  36.59 
 
 
112 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2735  nitrogen regulatory protein P-II  37.4 
 
 
112 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120563  normal  0.895699 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>