More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0559 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0559  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 139 aa  274  4e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000146576  normal  0.195853 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1144  nitrogen regulatory protein P-II  74.07 
 
 		 135 aa  207  4e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.931676  normal  0.946017 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1025  nitrogen regulatory protein P-II  43.36 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2819  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.587201  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1156  nitrogen regulatory protein P-II  43.88 
 
 		 130 aa  90.9  5e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2615  nitrogen regulatory protein P-II  41.3 
 
 		 124 aa  90.5  6e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1554  nitrogen regulatory protein P-II  42.45 
 
 		 125 aa  89  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0836  nitrogen regulatory protein P-II  36.96 
 
 		 124 aa  86.3  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0169  nitrogen regulatory protein P-II  38.41 
 
 		 125 aa  85.5  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00936567  normal  0.629139 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1432  nitrogen regulatory protein P-II  36.23 
 
 		 128 aa  85.9  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1530  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  37.14 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.858615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1017  nitrogen regulatory protein P-II  38.41 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0660  nitrogen regulatory protein P-II  38.41 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.187673  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0100  nitrogen regulatory protein P-II  38.41 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.250689  normal  0.0316533 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1753  nitrogen regulatory protein P-II  38.57 
 
 		 125 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.424498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1801  nitrogen regulatory protein P-II  37.68 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0063  nitrogen regulatory protein P-II  37.68 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0145  nitrogen regulatory protein P-II  36.17 
 
 		 120 aa  77.4  0.00000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.550451  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1629  nitrogen regulatory protein P-II  37.14 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000227966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1246  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  36.88 
 
 		 125 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000500613  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3092  nitrogen regulatory protein P-II  34.78 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2279  P-II family nitrogen regulatory protein  35.21 
 
 		 123 aa  74.3  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000418064  normal  0.159182 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1048  nitrogen regulatory protein P-II  34.04 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0742  nitrogen regulatory protein P-II  35.71 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0550  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  38.26 
 
 		 114 aa  69.7  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0094622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0436  nitrogen regulatory protein P-II  35.37 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.447184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1951  nitrogen regulatory protein P-II  34.29 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0122455  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0683  nitrogen regulatory protein P-II  32.14 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  34.06 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  34.78 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0953  nitrogen regulatory protein P-II  31.88 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1124  nitrogen regulatory protein P-II  31.88 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0770383  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0141  nitrogen regulatory protein P-II  31.16 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457658  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1064  nitrogen regulatory protein P-II  33.33 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  34.06 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_942  nitrogen regulatory protein P-II  31.16 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1065  nitrogen regulatory protein P-II  32.59 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1079  nitrogen regulatory protein P-II  32.61 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.908178  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4404  nitrogen regulatory protein P-II  33.33 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795902  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4381  nitrogen regulatory protein P-II  33.33 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  33.33 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0881  nitrogen regulatory protein P-II  31.88 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.24631  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2477  nitrogen regulatory protein P-II  34.06 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.698113  normal  0.567778 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1610  nitrogen regulatory protein P-II  31.88 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2478  nitrogen regulatory protein P-II  34.06 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.464409  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0884  nitrogen regulatory protein P-II  32.61 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.275382  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2480  nitrogen regulatory protein P-II  35.51 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.312055  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0556  nitrogen regulatory protein P-II  33.33 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0715  nitrogen regulatory protein P-II  33.33 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630678  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1830  nitrogen regulatory protein P-II  50.85 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.579927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1300  nitrogen regulatory protein P-II  30.94 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00561712  normal  0.201127 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1356  nitrogen regulatory protein P-II  34.29 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.51478  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  34.78 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4461  nitrogen regulatory protein P-II  32.61 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188449  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1879  nitrogen regulatory protein P-II  32.61 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000257329  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7999  nitrogen regulatory protein P-II  32.61 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0935  nitrogen regulatory protein P-II  32.61 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000154174  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0883  nitrogen regulatory protein P-II  31.16 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.386299  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  34.06 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1066  nitrogen regulatory protein P-II  29.71 
 
 		 112 aa  53.5  0.0000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.775357  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2273  nitrogen regulatory protein P-II  33.33 
 
 		 112 aa  53.5  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.201182  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0693  nitrogen regulatory protein P-II  32.61 
 
 		 112 aa  53.5  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.333555  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1611  nitrogen regulatory protein P-II  31.88 
 
 		 112 aa  53.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1695  nitrogen regulatory protein P-II  33.33 
 
 		 112 aa  53.1  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.596367 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2310  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  44.07 
 
 		 112 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0255165  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1063  nitrogen regulatory protein P-II  31.16 
 
 		 112 aa  53.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.403176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0564  nitrogen regulatory protein P-II  31.88 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000717962  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  31.16 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  32.61 
 
 		 112 aa  52.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1359  nitrogen regulatory protein P-II  31.88 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.202328  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  31.16 
 
 		 112 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4832  nitrogen regulatory protein P-II  33.33 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  29.71 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1613  nitrogen regulatory protein P-II  30.43 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0485  nitrogen regulatory protein P-II  33.33 
 
 		 112 aa  52.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.65619  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0939  nitrogen regulatory protein P-II, putative  33.33 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  31.88 
 
 		 112 aa  51.6  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4813  nitrogen regulatory protein P-II  33.33 
 
 		 112 aa  51.6  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002572  nitrogen regulatory protein P-II  33.33 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000156099  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03437  hypothetical protein  33.33 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0552  nitrogen regulatory protein P-II  31.88 
 
 		 112 aa  51.6  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524059  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1481  nitrogen regulatory protein P-II  31.88 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.19711 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  31.88 
 
 		 112 aa  51.6  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1061  nitrogen regulatory protein P-II  31.88 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.102544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3058  nitrogen regulatory protein P-II  31.16 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2479  nitrogen regulatory protein P-II  32.61 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.494885  normal  0.880519 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0969  nitrogen regulatory protein P-II  32.61 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.916041  hitchhiker  0.000334887 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1507  nitrogen regulatory protein P-II  33.33 
 
 		 112 aa  51.6  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2209  nitrogen regulatory protein P-II  31.58 
 
 		 112 aa  51.2  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.448638  normal  0.538315 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0148  nitrogen regulatory protein P-II  31.88 
 
 		 112 aa  51.2  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0080  nitrogen regulatory protein P-II  30.43 
 
 		 112 aa  51.2  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416357  normal  0.780104 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  31.16 
 
 		 112 aa  50.8  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  32.61 
 
 		 112 aa  50.8  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1017  nitrogen regulatory protein P-II  30.43 
 
 		 113 aa  50.4  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000487669  normal  0.288979 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  31.16 
 
 		 112 aa  50.8  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  30.43 
 
 		 112 aa  50.4  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2326  nitrogen regulatory protein P-II  30.43 
 
 		 112 aa  50.4  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.875617  normal  0.385523 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5234  nitrogen regulatory protein P-II  31.16 
 
 		 112 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5506  nitrogen regulatory protein P-II  31.16 
 
 		 112 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.851812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5295  nitrogen regulatory protein P-II  31.16 
 
 		 112 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>