More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1144 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1144  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 135 aa  272  1.0000000000000001e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.931676  normal  0.946017 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0559  nitrogen regulatory protein P-II  74.07 
 
 		 139 aa  207  4e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000146576  normal  0.195853 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1025  nitrogen regulatory protein P-II  44.85 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2819  nitrogen regulatory protein P-II  45.59 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.587201  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3092  nitrogen regulatory protein P-II  37.31 
 
 		 131 aa  84  7e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0836  nitrogen regulatory protein P-II  38.06 
 
 		 124 aa  83.6  8e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0169  nitrogen regulatory protein P-II  38.35 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00936567  normal  0.629139 
 
 
-
 
NC_002936  DET1156  nitrogen regulatory protein P-II  38.06 
 
 		 130 aa  80.5  0.000000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1554  nitrogen regulatory protein P-II  39.26 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2615  nitrogen regulatory protein P-II  37.78 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0550  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  40.87 
 
 		 114 aa  75.9  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0094622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1530  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  34.56 
 
 		 125 aa  72  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.858615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0145  nitrogen regulatory protein P-II  35.77 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.550451  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1017  nitrogen regulatory protein P-II  38.06 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1432  nitrogen regulatory protein P-II  31.34 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2279  P-II family nitrogen regulatory protein  33.58 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000418064  normal  0.159182 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1246  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  33.09 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000500613  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1048  nitrogen regulatory protein P-II  34.33 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0063  nitrogen regulatory protein P-II  32.84 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1753  nitrogen regulatory protein P-II  34.56 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.424498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1951  nitrogen regulatory protein P-II  33.09 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0122455  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0100  nitrogen regulatory protein P-II  36.03 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.250689  normal  0.0316533 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0660  nitrogen regulatory protein P-II  36.03 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.187673  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1801  nitrogen regulatory protein P-II  34.33 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1629  nitrogen regulatory protein P-II  32.59 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000227966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0436  nitrogen regulatory protein P-II  33.57 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.447184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0683  nitrogen regulatory protein P-II  31.39 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0742  nitrogen regulatory protein P-II  32.59 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1124  nitrogen regulatory protein P-II  33.08 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0770383  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1300  nitrogen regulatory protein P-II  34.59 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00561712  normal  0.201127 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  33.83 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0953  nitrogen regulatory protein P-II  33.08 
 
 		 112 aa  62  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_942  nitrogen regulatory protein P-II  32.33 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4381  nitrogen regulatory protein P-II  36.84 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4404  nitrogen regulatory protein P-II  36.84 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795902  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  36.84 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  36.84 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  36.09 
 
 		 112 aa  60.1  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1359  nitrogen regulatory protein P-II  35.07 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.202328  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0881  nitrogen regulatory protein P-II  33.83 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.24631  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1356  nitrogen regulatory protein P-II  36.03 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.51478  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1064  nitrogen regulatory protein P-II  32.33 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1879  nitrogen regulatory protein P-II  37.04 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000257329  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2478  nitrogen regulatory protein P-II  35.07 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.464409  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1063  nitrogen regulatory protein P-II  32.33 
 
 		 112 aa  57  0.00000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.403176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0884  nitrogen regulatory protein P-II  32.33 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.275382  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1610  nitrogen regulatory protein P-II  33.83 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1611  nitrogen regulatory protein P-II  33.08 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  34.59 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1079  nitrogen regulatory protein P-II  32.33 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.908178  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  33.83 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0556  nitrogen regulatory protein P-II  30.83 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1361  nitrogen regulatory protein P-II  34.33 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.212904  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1695  nitrogen regulatory protein P-II  33.08 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.596367 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0693  nitrogen regulatory protein P-II  32.84 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.333555  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  35.56 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  35.56 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2477  nitrogen regulatory protein P-II  32.84 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.698113  normal  0.567778 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0715  nitrogen regulatory protein P-II  34.59 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630678  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0146  nitrogen regulatory protein P-II  35.56 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220304  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1779  nitrogen regulatory protein P-II  35.56 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.903734 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1345  nitrogen regulatory protein P-II  35.56 
 
 		 112 aa  53.5  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2273  nitrogen regulatory protein P-II  32.33 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.201182  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1066  nitrogen regulatory protein P-II  31.58 
 
 		 112 aa  53.5  0.0000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.775357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0883  nitrogen regulatory protein P-II  30.83 
 
 		 112 aa  53.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.386299  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03437  hypothetical protein  34.59 
 
 		 112 aa  53.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2310  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  32.58 
 
 		 112 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0255165  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1830  nitrogen regulatory protein P-II  45.76 
 
 		 115 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.579927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2326  nitrogen regulatory protein P-II  32.09 
 
 		 112 aa  53.5  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.875617  normal  0.385523 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0135  nitrogen regulatory protein P-II  33.83 
 
 		 121 aa  53.5  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000114835  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002572  nitrogen regulatory protein P-II  34.59 
 
 		 112 aa  53.5  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000156099  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5234  nitrogen regulatory protein P-II  33.83 
 
 		 112 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0217  nitrogen regulatory protein P-II  33.83 
 
 		 112 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.531374  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0190  nitrogen regulatory protein P-II  33.83 
 
 		 112 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  33.83 
 
 		 112 aa  52.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5506  nitrogen regulatory protein P-II  33.83 
 
 		 112 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.851812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  33.83 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  32.33 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5143  nitrogen regulatory protein P-II  33.83 
 
 		 112 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1065  nitrogen regulatory protein P-II  32.31 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0935  nitrogen regulatory protein P-II  30.83 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000154174  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0238  nitrogen regulatory protein P-II  33.83 
 
 		 112 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0928138  normal  0.898368 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5295  nitrogen regulatory protein P-II  33.83 
 
 		 112 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4461  nitrogen regulatory protein P-II  34.81 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188449  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2479  nitrogen regulatory protein P-II  36.09 
 
 		 112 aa  52.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.494885  normal  0.880519 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0523  nitrogen regulatory protein P-II  34.59 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278087  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0641  nitrogen regulatory protein P-II  33.83 
 
 		 112 aa  51.6  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252116  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1481  nitrogen regulatory protein P-II  35.56 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.19711 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  33.83 
 
 		 112 aa  51.6  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2861  nitrogen regulatory protein P-II  31.58 
 
 		 112 aa  51.6  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.715878  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  35.34 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  34.59 
 
 		 112 aa  51.6  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  32.33 
 
 		 112 aa  51.6  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3026  nitrogen regulatory protein P-II  33.08 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.522952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2209  nitrogen regulatory protein P-II  32.56 
 
 		 112 aa  51.6  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.448638  normal  0.538315 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3058  nitrogen regulatory protein P-II  33.08 
 
 		 112 aa  51.2  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  32.33 
 
 		 112 aa  51.2  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15821  nitrogen regulatory protein P-II  31.58 
 
 		 112 aa  51.2  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2783  nitrogen regulatory protein P-II  33.07 
 
 		 109 aa  51.6  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7999  nitrogen regulatory protein P-II  39.29 
 
 		 112 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>