More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0550 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0550  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 112 aa  222  1e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2480  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  148  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.312055  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  148  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47790  Nitrogen regulatory protein P-II GlnK  58.93 
 
 		 112 aa  146  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0523  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278087  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  144  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2346  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  59.82 
 
 		 112 aa  144  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.235899 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2137  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  144  5e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.573897  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2357  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  144  5e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0171  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  144  5e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138781  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5234  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  143  7.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0217  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.531374  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0190  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5506  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.851812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5295  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0238  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0928138  normal  0.898368 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0173  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  143  7.0000000000000006e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000293377  normal  0.353092 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5143  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2043  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  143  8.000000000000001e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.242523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3942  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5933  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0181  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.153981  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00479  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6030  nitrogen regulatory protein P-II 2  58.04 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0163  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.814781 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0259  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69810  nitrogen regulatory protein P-II 2  58.04 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.241854 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1400  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3218  P-II family regulatory protein  57.14 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472285  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2827  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.994537  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0651  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0193  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431486  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0407  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32852  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1181  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000688194 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0218  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  141  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0468  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.409463  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0487  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188054  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6195  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 136 aa  141  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2479  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  141  4e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.494885  normal  0.880519 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0183  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  140  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 136 aa  140  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3656  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  141  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  140  5e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  140  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  140  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  140  5e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2252  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  140  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0233324  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0437  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  140  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2921  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  140  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0772673  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1937  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  140  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1861  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  140  6e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.751643 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2003  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  140  6e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0914763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3161  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  140  6e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0791702  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1957  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  140  6e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3314  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  140  6e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.258343  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0156  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  140  7e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4014  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  140  7e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00726508  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0233  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  139  9e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0053  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0041295  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0217  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000368327 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0198  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0085  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  58.04 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.308979  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0491  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0080  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416357  normal  0.780104 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0939  nitrogen regulatory protein P-II, putative  57.14 
 
 		 112 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0342  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  55.36 
 
 		 112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3819  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0525  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0240  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2361  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  138  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0912  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  54.46 
 
 		 112 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  4.42242e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  138  1.9999999999999998e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2406  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  138  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0256  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4190  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.959597 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0815  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 136 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2415  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194654  hitchhiker  0.00652052 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  53.57 
 
 		 112 aa  138  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3772  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  137  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.762526 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12933  nitrogen regulatory protein P-II glnB  50.89 
 
 		 112 aa  138  3e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.30403e-36  normal  0.258229 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5738  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  138  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0879  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  138  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2321  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  138  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0286658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0472  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  138  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0120  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  138  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0723912 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1799  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.534869  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2456  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  138  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00114582  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2411  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122032  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2733  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.122931 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  137  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2905  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>