More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2024 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2024  HflK protein  100 
 
 
379 aa  758    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2728  HflK protein  44.97 
 
 
385 aa  325  7e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4005  HflK protein  43.67 
 
 
383 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.906349  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2458  HflK protein  49.86 
 
 
398 aa  305  8.000000000000001e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0761893 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3262  HflK protein  43.48 
 
 
383 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.264682  normal  0.260183 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3352  HflK protein  43.43 
 
 
389 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.154635 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2349  HflK  44.94 
 
 
382 aa  297  3e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1664  HflK protein  44.59 
 
 
385 aa  292  7e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2038  HflK protein  43.4 
 
 
390 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal  0.793303 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6097  protease activity modulator HflK  44.29 
 
 
379 aa  282  5.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2203  HflK  44.57 
 
 
407 aa  280  3e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0604  HflK protein  42.93 
 
 
368 aa  267  2e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0450848 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0603  HflK  42.3 
 
 
395 aa  265  1e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1730  HflK protein  40.66 
 
 
389 aa  262  6e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000348315 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3383  HflK protein  40.1 
 
 
433 aa  259  6e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0357  HflK protein  43.49 
 
 
393 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.24266  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2001  HflK protein  43.77 
 
 
393 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.610891  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1090  HflK protein  39.58 
 
 
405 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0885  HflK protein  43.18 
 
 
394 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.240559 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0899  HflK protein  44.14 
 
 
393 aa  251  2e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3670  HflK protein  41.67 
 
 
399 aa  248  1e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119308  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1981  hflK protein  38.97 
 
 
403 aa  246  3e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.245892  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2588  HflK-like protein  38.73 
 
 
413 aa  246  4e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268051  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1089  HflK protein  42.54 
 
 
386 aa  246  6e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0604271 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2630  HflK protein  39.8 
 
 
414 aa  243  5e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.587706  unclonable  0.00000000000633953 
 
 
-
 
NC_002978  WD0831  hflK protein  38.44 
 
 
344 aa  242  7e-63  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.604081  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2736  Protein HflK  43.35 
 
 
382 aa  241  1e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.12799  normal  0.0330194 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1066  HflK protein  38.36 
 
 
477 aa  241  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1177  HflK protein  40.62 
 
 
451 aa  239  4e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.621922 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2099  HflK protein  36.51 
 
 
447 aa  240  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.080069 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1097  HflK protein  40.62 
 
 
451 aa  239  4e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0701  HflK protein  42.18 
 
 
389 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.704502  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3173  HflK protein  43.64 
 
 
394 aa  238  1e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1158  HflK protein  38.56 
 
 
475 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1956  HflK protein  41.83 
 
 
387 aa  238  2e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.733622  normal  0.100531 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0574  HflK  38.12 
 
 
400 aa  236  3e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1573  HflK protein  38.46 
 
 
367 aa  237  3e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000427817  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4940  hflK protein  37.63 
 
 
395 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0073  HflK protein  39.95 
 
 
452 aa  235  9e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.715541  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2780  HflK protein  43 
 
 
379 aa  235  9e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.224376 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2665  heat shock protein HslU  40.22 
 
 
386 aa  234  1.0000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.288159  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1942  HflK protein  42.78 
 
 
406 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4527  HflK protein  43.23 
 
 
394 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1879  HflK protein  38.77 
 
 
471 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239775  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0843  HflK  35.71 
 
 
355 aa  233  3e-60  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2767  HflK protein  40.77 
 
 
394 aa  233  6e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397323  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0664  HflK protein  39.77 
 
 
395 aa  232  1e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119349  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0263  HflK protein  39.94 
 
 
360 aa  229  5e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2946  HflK protein  41.08 
 
 
359 aa  229  6e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2601  HflK protein  38.59 
 
 
474 aa  229  6e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.373557  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5012  HflK protein  39.56 
 
 
464 aa  229  7e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1050  hflK protein  36.71 
 
 
357 aa  229  7e-59  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1431  HflK protein  40.62 
 
 
471 aa  229  7e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.936066 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2658  HflK protein  40.62 
 
 
382 aa  228  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2885  HflK protein  41.03 
 
 
382 aa  227  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4683  HflK protein  40.28 
 
 
393 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4944  HflK protein  39.72 
 
 
393 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499727 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4892  HflK protein  39.89 
 
 
405 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.42676  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4768  HflK protein  39.89 
 
 
393 aa  226  6e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2978  HflK  39.53 
 
 
436 aa  226  7e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.750881  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0445  HflK protein  39.78 
 
 
399 aa  225  8e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.713082  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2018  HflK protein  40.41 
 
 
362 aa  225  8e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0637  HflK protein  39.22 
 
 
389 aa  224  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0128609 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2674  HflK protein  36.96 
 
 
388 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162976 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1222  hypothetical protein  37.43 
 
 
447 aa  222  7e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0015724  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2079  HflK  36.68 
 
 
457 aa  222  7e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0575  HflK protein  36.59 
 
 
459 aa  222  7e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.289879  hitchhiker  0.000000000363385 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65280  protease subunit HflK  39.89 
 
 
400 aa  222  7e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5671  protease subunit HflK  40.5 
 
 
399 aa  222  8e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2194  HflK protein  38.98 
 
 
456 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0525  HflK  37.57 
 
 
389 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325556  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0537  HflK protein  36.39 
 
 
418 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.141396  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0486  HflK protein  38.31 
 
 
361 aa  219  5e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.333714 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1749  HflK protein  38.67 
 
 
376 aa  219  5e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254466  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0673  HflK protein  32.85 
 
 
498 aa  218  1e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1353  band 7 protein:stomatin  37.68 
 
 
384 aa  218  2e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3384  HflK protein  42.05 
 
 
359 aa  216  4e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.16512  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0494  HflK protein  34.92 
 
 
420 aa  216  4e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0869387  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0866  HflK protein  38.54 
 
 
387 aa  216  5e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134837  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1397  hflK protein  37.68 
 
 
382 aa  216  5.9999999999999996e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2818  HFLK protein  41.31 
 
 
383 aa  216  5.9999999999999996e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44638  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2775  HflK protein  36.67 
 
 
407 aa  215  9.999999999999999e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.631508  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2300  HflK protein  38.61 
 
 
464 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194929  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1989  hypothetical protein  38.87 
 
 
435 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0560  HflK protein  34.41 
 
 
379 aa  212  7e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000508673  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1601  FtsH protease activity modulator HflK  35.71 
 
 
460 aa  212  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.559516  normal  0.13244 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1284  HflK protein  33.17 
 
 
503 aa  212  1e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1587  HflK protein  39.41 
 
 
391 aa  210  3e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000287062 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2279  HflK protein  38.64 
 
 
378 aa  210  4e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1413  HflK protein  34.34 
 
 
465 aa  209  6e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.843638  hitchhiker  0.0000076277 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0548  protease subunit HflK  37.31 
 
 
380 aa  208  1e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0524  protease subunit HflK  37.31 
 
 
380 aa  207  2e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1794  HflK protein  37.43 
 
 
383 aa  207  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301305  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2760  hflK protein  37.98 
 
 
395 aa  207  3e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.467094  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0600  HflK protein  33.6 
 
 
381 aa  207  3e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0138092  hitchhiker  0.00143389 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3430  HflK protein  33.6 
 
 
381 aa  207  3e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0909026  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2534  HflK protein  35.16 
 
 
466 aa  206  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0683686  hitchhiker  0.0000321559 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00651  HflK complex with HflC  38.14 
 
 
383 aa  206  5e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.763897  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002261  HflK protein  37.11 
 
 
401 aa  205  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0330443  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1805  HflK protein  35.79 
 
 
462 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.644359  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>