More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1475 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1961  AcrB/AcrD/AcrF family protein  52.66 
 
 		 1038 aa  1047    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2667  AcrB/AcrD/AcrF family protein  42.97 
 
 		 1035 aa  812    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3430  acriflavin resistance protein  43.49 
 
 		 1037 aa  796    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0044  acriflavin resistance protein  44.48 
 
 		 1036 aa  823    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1475  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1027 aa  2023    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.521845  normal  0.0685081 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4375  acriflavin resistance protein  43.84 
 
 		 1038 aa  849    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000150121  normal  0.679218 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0140  acriflavin resistance protein  42.35 
 
 		 1026 aa  786    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4767  acriflavin resistance protein  44.3 
 
 		 1037 aa  847    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.300742  unclonable  0.0000000523741 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2381  acriflavin resistance protein D  32.98 
 
 		 1092 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.422424  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0835  acriflavin resistance protein  33.17 
 
 		 1042 aa  557  1e-157  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.181435  normal  0.546259 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0917  acriflavin resistance protein  36.79 
 
 		 1054 aa  524  1e-147  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6349  acriflavin resistance protein  34.6 
 
 		 1064 aa  526  1e-147  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.945315 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2405  acriflavin resistance protein  33.49 
 
 		 1051 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4429  acriflavin resistance protein  31.87 
 
 		 1059 aa  452  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4289  acriflavin resistance protein  31.69 
 
 		 1055 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0104  acriflavin resistance protein  30.58 
 
 		 1056 aa  449  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0111  acriflavin resistance protein  31.68 
 
 		 1059 aa  432  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3737  acriflavin resistance protein  30.7 
 
 		 1014 aa  429  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0267  acriflavin resistance protein  29.21 
 
 		 1040 aa  360  8e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.856769 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.74 
 
 		 1024 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  28.3 
 
 		 1050 aa  358  2.9999999999999997e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1158  cation/multidrug efflux pump-like protein  27.31 
 
 		 1009 aa  356  2e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  27.87 
 
 		 1040 aa  350  9e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01735  RND family efflux transporter  27.72 
 
 		 1035 aa  349  1e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1983  acriflavin resistance protein  29.47 
 
 		 1034 aa  344  5.999999999999999e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000463224  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0175  acriflavin resistance protein  29.29 
 
 		 1046 aa  343  1e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.481543 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1187  acriflavin resistance protein  28.64 
 
 		 1036 aa  338  2.9999999999999997e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.359485  normal  0.0265423 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  27.57 
 
 		 1038 aa  337  5.999999999999999e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  28.27 
 
 		 1030 aa  336  1e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  29.07 
 
 		 1039 aa  336  2e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  26.26 
 
 		 1044 aa  335  4e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  26.26 
 
 		 1034 aa  334  5e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1905  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.18 
 
 		 1034 aa  334  6e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.209576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  26.96 
 
 		 1029 aa  332  2e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2523  acriflavin resistance protein  29.02 
 
 		 1026 aa  332  2e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199891 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  28.36 
 
 		 1048 aa  332  2e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  26.82 
 
 		 1023 aa  332  3e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1705  acriflavin resistance protein  27.91 
 
 		 1031 aa  330  7e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0236776  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3361  acriflavin resistance protein  28.52 
 
 		 1048 aa  330  7e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629992 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1648  acriflavin resistance protein  26.82 
 
 		 1082 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2337  acriflavin resistance protein  28.52 
 
 		 1031 aa  328  3e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120926  hitchhiker  0.000298899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1659  acriflavin resistance protein  28.52 
 
 		 1031 aa  328  3e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178159  normal  0.998047 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  26.28 
 
 		 1068 aa  327  5e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2409  acriflavin resistance protein  28.52 
 
 		 1031 aa  327  5e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.677885  normal  0.0307662 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  26.65 
 
 		 1044 aa  327  7e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2000  acriflavin resistance protein  28.14 
 
 		 1028 aa  327  7e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1882  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.33 
 
 		 1031 aa  326  1e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2549  acriflavin resistance protein  28.03 
 
 		 1031 aa  326  1e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0932297  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2587  acriflavin resistance protein  28.03 
 
 		 1031 aa  325  2e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000412735  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1037  acriflavin resistance protein  27.9 
 
 		 1036 aa  326  2e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1797  acriflavin resistance protein  28.03 
 
 		 1031 aa  325  3e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0223723  hitchhiker  0.000000350495 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  26.49 
 
 		 1011 aa  325  4e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2664  acriflavin resistance protein  27.93 
 
 		 1031 aa  324  5e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  28.79 
 
 		 1031 aa  323  8e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  27.07 
 
 		 1022 aa  321  3e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2033  acriflavin resistance protein  26.74 
 
 		 1044 aa  321  5e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  26.07 
 
 		 1043 aa  320  7e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1852  acriflavin resistance protein  28.78 
 
 		 1042 aa  319  1e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0174296  hitchhiker  0.000605557 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.29 
 
 		 1024 aa  319  2e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  29.57 
 
 		 1027 aa  319  2e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2503  acriflavin resistance protein  27.12 
 
 		 1016 aa  317  6e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000075994  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  27.67 
 
 		 1034 aa  317  7e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1350  acriflavin resistance protein  29.46 
 
 		 1024 aa  316  9.999999999999999e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0568344 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1738  acriflavin resistance protein  28.46 
 
 		 1031 aa  317  9.999999999999999e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0173564  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  25.81 
 
 		 1046 aa  316  9.999999999999999e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2796  acriflavin resistance protein  27.88 
 
 		 1040 aa  316  1.9999999999999998e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  28.53 
 
 		 1028 aa  315  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0211  acriflavin resistance protein  26.87 
 
 		 1026 aa  314  5.999999999999999e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.824478 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  26.85 
 
 		 1065 aa  313  1e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1738  acriflavin resistance protein  28.24 
 
 		 1038 aa  311  2.9999999999999997e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1029  acriflavin resistance protein  27.12 
 
 		 1034 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.2741  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2815  acriflavin resistance protein  27.01 
 
 		 1051 aa  311  5e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.874616  normal  0.995091 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1366  acriflavin resistance protein  27.59 
 
 		 1035 aa  310  8e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0602713  hitchhiker  0.00132005 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2827  acriflavin resistance protein  25.67 
 
 		 1041 aa  310  1.0000000000000001e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3926  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.41 
 
 		 1029 aa  309  2.0000000000000002e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.831264  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1267  acriflavin resistance protein  27.63 
 
 		 1035 aa  309  2.0000000000000002e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0368024  hitchhiker  0.0000615461 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2359  acriflavin resistance protein  29.28 
 
 		 1028 aa  309  2.0000000000000002e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995142  normal  0.101465 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0948  acriflavin resistance protein  27.12 
 
 		 1015 aa  308  3e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  28.2 
 
 		 1028 aa  308  3e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1020  acriflavin resistance protein  25.27 
 
 		 1037 aa  308  4.0000000000000004e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000109455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1146  acriflavine resistance protein  26.16 
 
 		 1026 aa  308  4.0000000000000004e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  26.61 
 
 		 1032 aa  307  6e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3203  acriflavin resistance protein  27.11 
 
 		 1041 aa  307  6e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  28.25 
 
 		 1028 aa  306  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  25.02 
 
 		 1053 aa  306  1.0000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  27.76 
 
 		 1031 aa  305  2.0000000000000002e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  28.12 
 
 		 1043 aa  305  2.0000000000000002e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0473  acriflavin resistance protein  26.7 
 
 		 1033 aa  306  2.0000000000000002e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.239628  normal  0.228728 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1178  acriflavin resistance protein  27.52 
 
 		 1042 aa  305  3.0000000000000004e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  25.96 
 
 		 1036 aa  305  4.0000000000000003e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  25.86 
 
 		 1470 aa  304  6.000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  27.2 
 
 		 1055 aa  303  8.000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2556  acriflavin resistance protein  27.08 
 
 		 1051 aa  303  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0277  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  27.57 
 
 		 1043 aa  303  1e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0517386  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0291  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  27.37 
 
 		 1043 aa  303  1e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.601595  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3289  acriflavin resistance protein  25.37 
 
 		 1032 aa  301  3e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00142508  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1652  acriflavin resistance protein  24.76 
 
 		 1037 aa  301  4e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.257724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01445  hypothetical protein  27.44 
 
 		 1037 aa  301  4e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  29.34 
 
 		 1017 aa  301  4e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1816  acriflavin resistance protein  28.31 
 
 		 1023 aa  301  4e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.742902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>