97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_21410 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012803  Mlut_21410  phenylacetic acid degradation protein PaaD  100 
 
 		 146 aa  297  3e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1924  phenylacetic acid degradation protein PaaD  40 
 
 		 157 aa  96.7  9e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.082152  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3635  phenylacetic acid degradation protein PaaD  40.15 
 
 		 157 aa  94  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.182413  normal  0.29852 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1660  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.14 
 
 		 164 aa  92.8  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.388826  normal  0.270829 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1830  phenylacetic acid degradation protein PaaD  40.17 
 
 		 150 aa  92  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.307923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2481  phenylacetic acid degradation protein PaaD  41.13 
 
 		 160 aa  91.3  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000323431  hitchhiker  0.00762361 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0478  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.86 
 
 		 153 aa  88.6  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0682  phenylacetic acid degradation protein PaaD  40.87 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3281  phenylacetic acid degradation protein PaaD  40.32 
 
 		 146 aa  84.7  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4800  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.59 
 
 		 154 aa  85.1  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.283675  normal  0.204675 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0937  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.29 
 
 		 149 aa  84.7  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2478  phenylacetic acid degradation protein PaaD  40.32 
 
 		 146 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1371  phenylacetic acid degradation protein PaaD  40.34 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.154408  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2615  phenylacetic acid degradation protein PaaD  39.52 
 
 		 146 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.518393  normal  0.199542 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2628  phenylacetic acid degradation protein PaaD  38.13 
 
 		 151 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45641  normal  0.0525731 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0439  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.43 
 
 		 143 aa  79.3  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.778856  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2476  phenylacetic acid degradation protein PaaD  38.24 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2871  phenylacetic acid degradation protein  34.11 
 
 		 152 aa  78.2  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165217  normal  0.133325 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1237  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.27 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2696  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.76 
 
 		 160 aa  77  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.165626  hitchhiker  0.00035972 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0902  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.9 
 
 		 165 aa  77  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3366  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.9 
 
 		 154 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27764  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5525  phenylacetic acid degradation protein PaaD  39.47 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.717257  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3825  phenylacetic acid degradation protein PaaD  40 
 
 		 141 aa  75.9  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.17422  normal  0.478257 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0373  phenylacetic acid degradation-related protein:phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.96 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000506078  hitchhiker  0.00000423415 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2692  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.21 
 
 		 153 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0223  thioesterase superfamily protein  34.71 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.103741 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26560  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.75 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.190774 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2903  phenylacetic acid degradation protein PaaD  32.87 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00325077  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0569  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.29 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2854  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.69 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0283833  normal  0.621321 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0751  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.36 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.117185  normal  0.261303 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2259  phenylacetic acid degradation protein PaaD  39.77 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.059519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1483  phenylacetic acid degradation protein PaaD  39.77 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1581  phenylacetic acid degradation protein PaaD  39.77 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3489  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.9 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00562362  hitchhiker  0.000228083 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2249  phenylacetic acid degradation protein PaaD  39.77 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0320405  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1553  thioesterase superfamily protein  34.56 
 
 		 146 aa  67.4  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0657  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.59 
 
 		 143 aa  67  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3098  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35 
 
 		 154 aa  67  0.00000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278086 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1510  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.9 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269892  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3549  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.91 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0916225  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3576  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.91 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3567  phenylacetic acid degradation protein PaaI  34.11 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.060136  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3943  phenylacetic acid degradation protein PaaD  32.85 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.545833 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0467  phenylacetic acid degradation- related thioesterase (PaaI)  34.45 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0985  phenylacetic acid degradation protein  31.97 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.594777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0402  phenylacetic acid degradation protein PaaD  41.05 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.925599  decreased coverage  0.0065275 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3080  phenylacetic acid degradation protein PaaD  32.5 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.378312 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2404  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.65 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.671288 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0445  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.08 
 
 		 150 aa  62  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2565  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.08 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0540  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.08 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460721  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1324  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.04 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0859981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4483  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.62 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2751  phenylacetic acid degradation protein PaaD  32.28 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00224854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0470  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.08 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0904963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0512  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.08 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.245476  normal  0.787837 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3627  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.66 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0218071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3116  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.5 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00121794  normal  0.101093 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3016  phenylacetic acid degradation-related protein:phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.65 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0658  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.83 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2652  hypothetical protein  32.23 
 
 		 148 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2608  phenylacetic acid degradation-related protein  32.23 
 
 		 148 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824711  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3164  phenylacetic acid degradation protein PaaD  28.77 
 
 		 146 aa  57  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000726933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2638  hypothetical protein  32.23 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2874  phenylacetic acid degradation protein  31.67 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00122895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0637  hypothetical protein  32.98 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0764989  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2320  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.51 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0539.1  hypothetical protein  34 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0622463  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0934  hypothetical protein  32.98 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.431465  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01900  hypothetical protein  27.93 
 
 		 199 aa  51.2  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5041  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.48 
 
 		 153 aa  50.8  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  33.07 
 
 		 158 aa  50.4  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0432  thioesterase superfamily protein  27.03 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1848  phenylacetic acid degradation-related protein  28.93 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0232  hypothetical protein  32.71 
 
 		 142 aa  47.4  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000358883  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3047  phenylacetic acid degradation protein PaaD  25.87 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1384  thioesterase superfamily protein  27.55 
 
 		 137 aa  45.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487893 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  25.77 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  29.87 
 
 		 139 aa  45.4  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05295  hypothetical protein  28.85 
 
 		 136 aa  45.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.702585  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2154  thioesterase superfamily protein  33.93 
 
 		 147 aa  43.9  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.770141  normal  0.098751 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1117  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 		 138 aa  42.7  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.692478 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5230  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317352  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20340  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.51 
 
 		 138 aa  42  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  27.17 
 
 		 161 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1701  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 142 aa  41.2  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000649367  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1645  phenylacetic acid degradation protein  25.58 
 
 		 136 aa  41.2  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1955  hypothetical protein  36.45 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2244  thioesterase superfamily protein  28 
 
 		 153 aa  41.2  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1379  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 		 166 aa  40.8  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23835  normal  0.28314 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3246  hypothetical protein  27.43 
 
 		 172 aa  40.8  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0984  phenylacetic acid degradation-related protein  29.52 
 
 		 155 aa  40.8  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.299901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2248  thioesterase superfamily protein  29.2 
 
 		 138 aa  40.8  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05030  phenylacetic acid degradation protein  36.59 
 
 		 127 aa  40.4  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  30.77 
 
 		 139 aa  40.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>