More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_09090 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_09090  arabinose efflux permease family protein  100 
 
 
434 aa  833    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0241408  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  47.15 
 
 
440 aa  346  5e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2493  major facilitator transporter  51.36 
 
 
420 aa  338  9.999999999999999e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.995351  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  47.47 
 
 
435 aa  329  6e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04650  arabinose efflux permease family protein  49.36 
 
 
405 aa  329  7e-89  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  45.65 
 
 
421 aa  326  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  47.63 
 
 
403 aa  325  1e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2233  major facilitator superfamily MFS_1  52.62 
 
 
422 aa  310  4e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000391707 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05310  arabinose efflux permease family protein  47.45 
 
 
400 aa  301  2e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3242  major facilitator superfamily MFS_1  46.62 
 
 
401 aa  300  5e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1729  major facilitator transporter  45.25 
 
 
423 aa  297  2e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1708  major facilitator transporter  45.25 
 
 
423 aa  297  2e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.841617  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1776  major facilitator superfamily transporter  45.25 
 
 
423 aa  297  2e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436677  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1894  major facilitator transporter  36.49 
 
 
431 aa  189  1e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3885  major facilitator superfamily MFS_1  36.55 
 
 
403 aa  178  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.37466  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  25.67 
 
 
387 aa  108  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  27.51 
 
 
395 aa  108  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  26.72 
 
 
387 aa  102  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  28.18 
 
 
412 aa  98.2  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  27.91 
 
 
370 aa  94.7  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1385  major facilitator superfamily MFS_1  28.31 
 
 
429 aa  94  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2754  major facilitator superfamily MFS_1  26.68 
 
 
430 aa  91.7  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  28.65 
 
 
397 aa  91.7  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3286  major facilitator superfamily MFS_1  26.01 
 
 
395 aa  90.9  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  26.53 
 
 
425 aa  89.4  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2342  major facilitator superfamily MFS_1  28.92 
 
 
427 aa  89.4  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000352958  decreased coverage  0.00223229 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1645  major facilitator superfamily permease  25.44 
 
 
409 aa  89  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  27.51 
 
 
416 aa  87.8  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00896  transport transmembrane protein  28.64 
 
 
406 aa  87.4  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124825  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3232  major facilitator transporter  28.53 
 
 
395 aa  86.3  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.904986 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1006  major facilitator superfamily MFS_1  27.56 
 
 
407 aa  85.5  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  31.07 
 
 
424 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  28.8 
 
 
397 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  35.07 
 
 
444 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  26.24 
 
 
394 aa  84.7  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  30.64 
 
 
423 aa  84.3  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0227  major facilitator superfamily MFS_1  27.34 
 
 
390 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142544  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  33.98 
 
 
389 aa  84  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  29.78 
 
 
392 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  27.97 
 
 
406 aa  83.2  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0740  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.79 
 
 
615 aa  82.8  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000446229  decreased coverage  0.00171071 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  25.87 
 
 
396 aa  82.4  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  26.62 
 
 
408 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  30.5 
 
 
414 aa  81.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1203  major facilitator superfamily MFS_1  26.68 
 
 
410 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1351  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  27.25 
 
 
416 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0854503  normal  0.0233504 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  29.49 
 
 
398 aa  79.3  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  32.92 
 
 
424 aa  79  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  25 
 
 
391 aa  78.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  29.33 
 
 
407 aa  78.2  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0478  major facilitator superfamily transporter  26.11 
 
 
403 aa  78.2  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  25.7 
 
 
386 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0418  major facilitator superfamily MFS_1  26.11 
 
 
403 aa  77.8  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  26.28 
 
 
423 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0725  drug resistance protein, putative  34.12 
 
 
417 aa  77.8  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02050  arabinose efflux permease family protein  29.2 
 
 
446 aa  77.8  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.205652  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  29.73 
 
 
414 aa  77.8  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0436  major facilitator superfamily MFS_1  25.85 
 
 
403 aa  77.4  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal  0.769414 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0424  major facilitator superfamily MFS_1  25.85 
 
 
403 aa  77.4  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.477286  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  27.52 
 
 
421 aa  77.4  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  28.15 
 
 
412 aa  77  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2463  major facilitator superfamily MFS_1  27.18 
 
 
438 aa  77  0.0000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.132377  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  27.15 
 
 
398 aa  76.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  25.12 
 
 
411 aa  76.6  0.0000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  23.04 
 
 
409 aa  76.3  0.0000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1774  major facilitator superfamily permease  24.03 
 
 
404 aa  76.6  0.0000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000179467 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1079  major facilitator transporter  25.26 
 
 
407 aa  76.3  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000078531  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  29.33 
 
 
428 aa  76.3  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0693  major facilitator superfamily permease  25.07 
 
 
405 aa  75.9  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.883245  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  29.79 
 
 
421 aa  75.5  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1514  major facilitator superfamily MFS_1  31.33 
 
 
393 aa  75.5  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  26.14 
 
 
411 aa  75.1  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4835  major facilitator transporter  36.31 
 
 
419 aa  74.7  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  26.98 
 
 
398 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1661  major facilitator transporter  26.56 
 
 
406 aa  74.7  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171561  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0973  major facilitator transporter  26.4 
 
 
406 aa  74.7  0.000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0924739  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0127  major facilitator superfamily permease  25.72 
 
 
398 aa  74.3  0.000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0361045  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2247  major facilitator transporter  28.47 
 
 
399 aa  73.9  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224163  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  27.43 
 
 
407 aa  73.9  0.000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  25.13 
 
 
400 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3444  major facilitator transporter  26.73 
 
 
403 aa  73.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.39865 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  27.42 
 
 
398 aa  73.6  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2032  multidrug-efflux transporter quinolene resistance protein NorA  26.09 
 
 
396 aa  73.6  0.000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.810377 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  25.85 
 
 
416 aa  73.2  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  25.65 
 
 
410 aa  73.2  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3433  major facilitator transporter  26.73 
 
 
403 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0912154  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  25.38 
 
 
387 aa  73.2  0.000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3496  major facilitator superfamily transporter  26.73 
 
 
403 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.950594  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0829  major facilitator transporter  25.86 
 
 
426 aa  73.2  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000111783  unclonable  0.000000000756922 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  27.68 
 
 
406 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  26.99 
 
 
411 aa  72.8  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3307  major facilitator transporter  31.49 
 
 
405 aa  72.4  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.16 
 
 
505 aa  72.4  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.18 
 
 
540 aa  72  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  26.23 
 
 
387 aa  72  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  23.5 
 
 
410 aa  72  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  24.31 
 
 
388 aa  72  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4204  major facilitator superfamily MFS_1  26.72 
 
 
422 aa  72  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2776  major facilitator superfamily MFS_1  22.22 
 
 
406 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00570116  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  24.31 
 
 
388 aa  72  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>