More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1112 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1112  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
422 aa  845    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.46212 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3706  histidine kinase  43.3 
 
 
492 aa  167  4e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.421002  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0820  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.05 
 
 
506 aa  166  8e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3077  Signal transduction histidine kinase  42.41 
 
 
492 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0316  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.27 
 
 
461 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.07 
 
 
492 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251898  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0686  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  42.29 
 
 
495 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.723155  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0067  ATP-binding region, ATPase-like  41.85 
 
 
495 aa  163  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.491711  hitchhiker  0.00453262 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7323  putative sensor histidine kinase  44.39 
 
 
491 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0334  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.42 
 
 
467 aa  159  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0995263  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0871  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.95 
 
 
478 aa  157  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0646  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.22 
 
 
484 aa  156  6e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.609641  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1056  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.57 
 
 
466 aa  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.511775  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0073  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.62 
 
 
465 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_004310  BR0274  sensor histidine kinase  35.84 
 
 
541 aa  152  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2717  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 
466 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.401537  normal  0.0193829 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 
517 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3530  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38 
 
 
498 aa  148  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0792957  normal  0.828938 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5115  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.53 
 
 
478 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0716188  hitchhiker  0.00491502 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2330  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.15 
 
 
538 aa  147  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101402 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6068  histidine kinase  40.97 
 
 
478 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.201334  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0461  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.08 
 
 
488 aa  146  5e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4580  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.43 
 
 
496 aa  145  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.730418 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0289  sensor histidine kinase  34.96 
 
 
541 aa  145  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.712529  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4467  histidine kinase  40 
 
 
494 aa  144  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106277  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0305  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.79 
 
 
504 aa  145  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4099  ATPase domain-containing protein  40 
 
 
511 aa  144  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.826621  normal  0.165494 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0351  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 
508 aa  142  8e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
519 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.916439  normal  0.413843 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0085  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 
493 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 
510 aa  136  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.386696 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0453  two component sensor kinase  34.8 
 
 
474 aa  134  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156809  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5066  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.23 
 
 
495 aa  133  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0948498 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0099  histidine kinase  36.84 
 
 
506 aa  133  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 
502 aa  124  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2136  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 
465 aa  117  5e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4471  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 
677 aa  99.4  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.465536  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1188  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 
679 aa  97.4  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.91419 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2816  sensory box histidine kinase/response regulator  26.58 
 
 
882 aa  97.1  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.3 
 
 
1359 aa  95.9  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1414  sensory box histidine kinase/response regulator  22.75 
 
 
844 aa  93.6  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.6 
 
 
652 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3335  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 
346 aa  91.7  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2495  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.48 
 
 
363 aa  91.7  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  21.23 
 
 
456 aa  90.9  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0666  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.96 
 
 
831 aa  90.9  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2598  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.07 
 
 
661 aa  90.9  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.49 
 
 
414 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2223  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.3 
 
 
457 aa  88.6  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.450879  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0532  histidine kinase  49.51 
 
 
414 aa  87  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.137214  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1751  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.38 
 
 
671 aa  86.3  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0503  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  49.51 
 
 
414 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.502232  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 
496 aa  85.9  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.739503  normal  0.406153 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1076  sensor histidine kinase  23.12 
 
 
395 aa  85.9  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1577  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 
515 aa  85.5  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.441834  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0914  signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 
343 aa  85.1  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.51298  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2406  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.32 
 
 
1301 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0237  ATP-binding region ATPase domain protein  25.98 
 
 
567 aa  84.3  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2534  cyclic nucleotide-binding protein  25.91 
 
 
367 aa  84.7  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.809153  normal  0.0324751 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1175  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 
412 aa  84.3  0.000000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0245607  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0632  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.21 
 
 
695 aa  84  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.554525  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3503  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.02 
 
 
1043 aa  83.2  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0754  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.84 
 
 
492 aa  82.4  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.499334  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2911  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.07 
 
 
642 aa  82.8  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.71 
 
 
991 aa  82.8  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0989  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.71 
 
 
477 aa  81.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1029  two-component sensor CbrA  26.21 
 
 
986 aa  81.3  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.211087  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0078  histidine kinase  25.82 
 
 
475 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.24 
 
 
412 aa  81.3  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000397625  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3408  histidine kinase  34.07 
 
 
573 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0068838  normal  0.336005 
 
 
-
 
NC_002936  DET1293  sensory box sensor histidine kinase  21.68 
 
 
394 aa  80.9  0.00000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00147637  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4147  ATP-binding region ATPase domain protein  26.07 
 
 
1230 aa  80.9  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.175374 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0320  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.51 
 
 
576 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4055  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.15 
 
 
586 aa  80.5  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.424185  normal  0.174789 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1839  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.51 
 
 
423 aa  80.9  0.00000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00841086  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3022  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.16 
 
 
1101 aa  80.5  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0317  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.47 
 
 
407 aa  80.5  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.294431  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.14 
 
 
559 aa  80.5  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.500087  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.13 
 
 
534 aa  80.5  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.311499 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1413  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.33 
 
 
579 aa  80.1  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119595  normal  0.0381206 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0771  histidine kinase  33.75 
 
 
594 aa  80.1  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4457  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.06 
 
 
598 aa  79.7  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.235161  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0661  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
537 aa  79.3  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  26.04 
 
 
1629 aa  79.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1318  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.5 
 
 
680 aa  79  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2545  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 
556 aa  79.3  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.0765765 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1489  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.2 
 
 
422 aa  79.3  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165567  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1487  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.14 
 
 
368 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.785514 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1606  sensor histidine kinase  29.91 
 
 
403 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2837  nitrogen regulation protein, NtrB signal transduction histidine kinase  26.86 
 
 
368 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5442  two-component sensor CbrA  28.45 
 
 
983 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.74 
 
 
528 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568926  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0142  histidine kinase  29.39 
 
 
614 aa  79  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2329  histidine kinase  36 
 
 
489 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1457  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.86 
 
 
368 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.291348 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1628  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  26.74 
 
 
1026 aa  77.8  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.677715  normal  0.19967 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0777  histidine kinase  27.14 
 
 
379 aa  77.8  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.147887  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1139  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.72 
 
 
578 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62530  two-component sensor CbrA  28.03 
 
 
983 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0599  sensor histidine kinase  23.11 
 
 
516 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.712445  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>