More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5077 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13812  aminotransferase  78.89 
 
 		 398 aa  640    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.609711 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4989  cysteine desulphurase-like protein  100 
 
 		 398 aa  786    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5077  cysteine desulfurase family protein  100 
 
 		 398 aa  786    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5616  cysteine desulfurase family protein  83.42 
 
 		 398 aa  651    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.316888  normal  0.823554 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5370  cysteine desulfurase family protein  100 
 
 		 398 aa  786    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1188  cysteine desulfurase family protein  80.65 
 
 		 398 aa  625  1e-178  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.191261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0280  cysteine desulfurase family protein  53.77 
 
 		 398 aa  411  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.155667  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0136  cysteine desulfurase family protein  53.88 
 
 		 399 aa  394  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4098  cysteine desulfurase family protein  54.16 
 
 		 418 aa  389  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01610  cysteine desulfurase family protein, VC1184 subfamily  50.5 
 
 		 399 aa  372  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.129421  normal  0.129157 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0289  cysteine desulfurase family protein  45.59 
 
 		 407 aa  280  3e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1769  cysteine desulfurase family protein  40.25 
 
 		 403 aa  251  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1756  cysteine desulfurase family protein  40.5 
 
 		 403 aa  241  1e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.115577  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4945  cysteine desulfurase family protein  37.56 
 
 		 400 aa  196  6e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3807  cysteine desulfurase family protein  36.25 
 
 		 399 aa  191  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4075  cysteine desulfurase family protein  34.75 
 
 		 400 aa  179  9e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000488918  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1449  cysteine desulfurase family protein  31.19 
 
 		 414 aa  176  6e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1455  cysteine desulfurase family protein  29.52 
 
 		 419 aa  173  5e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000306553  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2971  cysteine desulfurase family protein  30.81 
 
 		 410 aa  171  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000129059  hitchhiker  0.0000905656 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3128  cysteine desulfurase family protein  34.36 
 
 		 414 aa  168  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000597393  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0805  aminotransferase, class V  30.39 
 
 		 416 aa  166  5.9999999999999996e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1728  cysteine desulfurase family protein  31.63 
 
 		 410 aa  164  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0576314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003742  cysteine desulfurase  28.88 
 
 		 411 aa  164  4.0000000000000004e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.180127  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3869  cysteine desulfurase family protein  29.85 
 
 		 409 aa  162  9e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1826  cysteine desulphurase-like protein  29.04 
 
 		 457 aa  162  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4166  cysteine desulphurase-like protein  29.34 
 
 		 418 aa  161  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.744365  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0879  NifS-related protein, putative aminotransferase  30.59 
 
 		 387 aa  159  6e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35946  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3113  cysteine desulfurase family protein  29.68 
 
 		 415 aa  149  9e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000139968  hitchhiker  0.00618461 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0934  cysteine desulfurase family protein  32.76 
 
 		 395 aa  146  5e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.114652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02028  hypothetical protein  26.49 
 
 		 412 aa  146  8.000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2890  cysteine desulphurase-like protein  32.35 
 
 		 421 aa  145  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.74738  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3645  cysteine desulfurase family protein  26.83 
 
 		 451 aa  140  3.9999999999999997e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2142  cysteine desulfurase family protein  32 
 
 		 407 aa  139  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.528034  normal  0.0416996 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2982  cysteine desulfurase family protein  27.9 
 
 		 425 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.234076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4526  Cysteine desulfurase  30.32 
 
 		 412 aa  127  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110932  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0343  cysteine desulfurase family protein  30.1 
 
 		 398 aa  125  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.394645  normal  0.251773 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28070  cysteine desulfurase-like protein  26.76 
 
 		 442 aa  120  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.622503  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0639  hypothetical protein  24.4 
 
 		 414 aa  120  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1261  cysteine desulphurase-like protein  30.79 
 
 		 397 aa  120  4.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666075  normal  0.478253 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0655  hypothetical protein  24.4 
 
 		 414 aa  119  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2837  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.63 
 
 		 415 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00234776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2745  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.6 
 
 		 415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  28.3 
 
 		 413 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.05 
 
 		 408 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2459  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.33 
 
 		 415 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2990  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.09 
 
 		 428 aa  113  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398941  normal  0.104458 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3969  cysteine desulfurase  26.46 
 
 		 415 aa  113  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0413583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2325  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.08 
 
 		 414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.553712  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1661  cysteine desulphurases, SufS  26.39 
 
 		 414 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  25.42 
 
 		 420 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  23.46 
 
 		 419 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.24 
 
 		 644 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0617  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.4 
 
 		 621 aa  108  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000358817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1549  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.9 
 
 		 673 aa  107  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0186902 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  22.96 
 
 		 419 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1436  aminotransferase class V  26.04 
 
 		 411 aa  106  7e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.82 
 
 		 421 aa  106  8e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000771215  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.27 
 
 		 444 aa  105  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1427  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.6 
 
 		 664 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000769952 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  24.16 
 
 		 419 aa  105  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3306  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.63 
 
 		 434 aa  103  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000348872 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.5 
 
 		 429 aa  103  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.33 
 
 		 605 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.27 
 
 		 418 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0699  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.43 
 
 		 419 aa  101  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  24.45 
 
 		 420 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  22.69 
 
 		 408 aa  102  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.26 
 
 		 429 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5682  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.72 
 
 		 560 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.26 
 
 		 429 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.62 
 
 		 413 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2089  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.44 
 
 		 441 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1138  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.71 
 
 		 411 aa  100  4e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.730169  normal  0.0524008 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.54 
 
 		 418 aa  100  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16160  cysteine desulfurase  27.64 
 
 		 429 aa  99.8  7e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2446  cysteine desulfurase SufS subfamily  26.24 
 
 		 429 aa  99.8  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0353595 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  26.97 
 
 		 604 aa  99.4  9e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  26.97 
 
 		 604 aa  99  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.59 
 
 		 419 aa  99  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  26.12 
 
 		 421 aa  99.4  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.58 
 
 		 417 aa  99  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1764  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  25.96 
 
 		 406 aa  99  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000868369  hitchhiker  0.0000289207 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.07 
 
 		 657 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  25.88 
 
 		 413 aa  98.2  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0087  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.27 
 
 		 420 aa  98.6  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2068  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.87 
 
 		 443 aa  98.6  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.512945  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3227  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.07 
 
 		 662 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.545837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  26.4 
 
 		 408 aa  98.6  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3079  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.2 
 
 		 434 aa  97.4  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0582401  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  26.34 
 
 		 393 aa  96.7  7e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0995  hypothetical protein  24.38 
 
 		 412 aa  96.7  7e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.20271 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0815  selenocysteine lyase  25.19 
 
 		 416 aa  96.3  9e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.643683  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1552  cysteine desulphurases, SufS  24.72 
 
 		 682 aa  96.3  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3442  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.73 
 
 		 420 aa  96.3  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000291669 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.29 
 
 		 413 aa  95.9  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.41 
 
 		 413 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1249  cysteine desulfurase  24.04 
 
 		 406 aa  94.7  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.491768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.42 
 
 		 414 aa  95.1  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.54 
 
 		 414 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0101  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.64 
 
 		 414 aa  95.1  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.724967 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>