144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4979 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4890  nitroreductase  100 
 
 
199 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4979  nitroreductase  100 
 
 
199 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5258  nitroreductase  98.49 
 
 
199 aa  384  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.656936 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1303  nitroreductase  68.62 
 
 
199 aa  254  7e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.805588 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5505  nitroreductase  64.74 
 
 
194 aa  247  9e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0533827 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36390  nitroreductase  44.9 
 
 
199 aa  154  9e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0458  nitroreductase  47.83 
 
 
195 aa  150  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.348313  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2267  nitroreductase family protein, putative  41.71 
 
 
203 aa  136  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0215  nitroreductase  44.63 
 
 
210 aa  135  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0491  nitroreductase  40.64 
 
 
315 aa  125  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.807689 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2730  nitroreductase  39.39 
 
 
205 aa  121  8e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.796867  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4118  nitroreductase  40.22 
 
 
197 aa  118  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1300  nitroreductase  40.22 
 
 
197 aa  118  7e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4588  nitroreductase  39.67 
 
 
197 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  39.2 
 
 
201 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  39.2 
 
 
201 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  39.2 
 
 
201 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  39.2 
 
 
201 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  39.2 
 
 
201 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2261  nitroreductase  40.21 
 
 
201 aa  115  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.746283  normal  0.134626 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  38.69 
 
 
201 aa  115  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  38.69 
 
 
201 aa  115  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0014  nitroreductase family protein  38.59 
 
 
198 aa  114  7.999999999999999e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  38.69 
 
 
201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4613  nitroreductase  39.59 
 
 
214 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.250865 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1391  nitroreductase  37.43 
 
 
197 aa  112  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0427  oxidoreductase  36.36 
 
 
205 aa  112  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1829  nitroreductase  39.09 
 
 
200 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00202262  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2838  nitroreductase  37.7 
 
 
223 aa  111  7.000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3947  nitroreductase  38.95 
 
 
199 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3531  nitroreductase  35.35 
 
 
197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12812  normal  0.174487 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4273  nitroreductase  38.42 
 
 
199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1566  nitroreductase  36.22 
 
 
197 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00494476 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2000  nitroreductase  41.27 
 
 
213 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3221  nitroreductase  38.04 
 
 
198 aa  105  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3919  nitroreductase family protein  35.68 
 
 
197 aa  105  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3177  putative NADH dehydrogenase/NAD(P)H nitroreductase  38.78 
 
 
204 aa  105  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.999951  normal  0.135022 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0345  nitroreductase  37.37 
 
 
212 aa  105  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3562  nitroreductase  32.99 
 
 
200 aa  104  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2772  nitroreductase  37.7 
 
 
200 aa  104  9e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5063  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  37.5 
 
 
199 aa  104  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.772676  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1538  nitroreductase  37.3 
 
 
203 aa  101  8e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.422269 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2896  nitroreductase  36.36 
 
 
207 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3146  nitroreductase  32.99 
 
 
200 aa  99.8  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1659  nitroreductase  42.63 
 
 
233 aa  99.4  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00583847  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3589  nitroreductase  36.36 
 
 
201 aa  98.6  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2604  nitroreductase  35.86 
 
 
201 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.759207  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0501  nitroreductase  35.86 
 
 
201 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0474  nitroreductase  35.35 
 
 
201 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.573695 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0406  nitroreductase  35.86 
 
 
201 aa  96.7  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699033  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1442  nitroreductase  34.05 
 
 
195 aa  96.3  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0432  nitroreductase  35.86 
 
 
201 aa  96.3  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181342  normal  0.330733 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4899  nitroreductase  34.62 
 
 
203 aa  95.5  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4435  nitroreductase  35.16 
 
 
203 aa  95.1  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.676369  normal  0.38334 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4639  nitroreductase  38.6 
 
 
189 aa  93.6  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.564298  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2200  nitroreductase  37.5 
 
 
199 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0875675  normal  0.438667 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4947  nitroreductase  34.92 
 
 
203 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.907105  normal  0.53209 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1732  nitroreductase  42.11 
 
 
209 aa  92  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.639581  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2245  nitroreductase  33.85 
 
 
197 aa  92  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2215  nitroreductase  41.58 
 
 
209 aa  90.5  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0324809  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1571  nitroreductase  34.05 
 
 
199 aa  90.5  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.160224  normal  0.163104 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0264  nitroreductase  37.43 
 
 
187 aa  89.4  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.284109  hitchhiker  0.00114487 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3370  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  34.59 
 
 
199 aa  88.6  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0510232  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0225  nitroreductase  34.29 
 
 
200 aa  88.6  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.936652  normal  0.851937 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5012  nitroreductase  29.95 
 
 
191 aa  87.8  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0181044  hitchhiker  0.00444875 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1636  nitroreductase  36.26 
 
 
192 aa  87.8  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0000151333  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0589  nitroreductase  38.38 
 
 
192 aa  87  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2397  nitroreductase  34.05 
 
 
205 aa  85.5  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2404  nitroreductase  41.38 
 
 
151 aa  84  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1159  nitroreductase  33.88 
 
 
199 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250977  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2102  nitroreductase  34.97 
 
 
200 aa  83.2  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2095  nitroreductase family protein  31.18 
 
 
189 aa  82.4  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4328  nitroreductase  32.34 
 
 
199 aa  81.6  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.59961  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0111  putative nitroreductase  35.59 
 
 
198 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0057  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.39 
 
 
330 aa  80.9  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0289  nitroreductase  38.65 
 
 
190 aa  79.7  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10883  Nitroreductase  29.9 
 
 
197 aa  77  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0150  hypothetical protein  41.03 
 
 
214 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.197759  normal  0.577731 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1639  nitroreductase  27.53 
 
 
184 aa  74.3  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15950  nitroreductase  29.28 
 
 
188 aa  74.3  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1207  nitroreductase family protein  28.18 
 
 
195 aa  73.9  0.000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3075  nitroreductase  29.35 
 
 
198 aa  71.6  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0551  nitroreductase  30.22 
 
 
321 aa  70.1  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0537  nitroreductase  29.67 
 
 
321 aa  68.9  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18320  nitroreductase  31.68 
 
 
174 aa  60.8  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  35.06 
 
 
174 aa  59.7  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  30.06 
 
 
178 aa  58.9  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  31.71 
 
 
178 aa  58.2  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  30.52 
 
 
180 aa  56.2  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  29.1 
 
 
176 aa  55.5  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  31.08 
 
 
174 aa  53.1  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  28.83 
 
 
194 aa  50.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  28.83 
 
 
194 aa  50.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  25.6 
 
 
183 aa  49.7  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2524  nitroreductase-like  26.52 
 
 
211 aa  49.3  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000539057  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24750  nitroreductase  29.11 
 
 
176 aa  48.9  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  30.06 
 
 
184 aa  47.4  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3978  nitroreductase  31.11 
 
 
209 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0811138 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  32 
 
 
192 aa  46.6  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  32.26 
 
 
174 aa  47  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>