48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_3169 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_3169  type II secretion system protein  100 
 
 
296 aa  589  1e-167  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2002  type II secretion system protein  58.98 
 
 
307 aa  335  5.999999999999999e-91  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1904  type II secretion system protein  65.61 
 
 
224 aa  306  4.0000000000000004e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.374216 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0253  type II secretion system protein  40.07 
 
 
306 aa  219  3e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0793731  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0449  type II secretion system protein  37.79 
 
 
716 aa  178  1e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1173  type II secretion system protein  34.81 
 
 
641 aa  155  7e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0525708  normal  0.392057 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2686  type II secretion system protein  33.33 
 
 
644 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.473115 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2354  type II secretion system protein  32.45 
 
 
652 aa  146  3e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.149954  normal  0.434022 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2401  type II secretion system protein  30.59 
 
 
647 aa  146  5e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0007  Type II secretion system F domain protein  33.68 
 
 
332 aa  144  2e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0732  transporter  30.36 
 
 
660 aa  130  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2385  type II secretion system protein  31.19 
 
 
610 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0700595  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1031  type II secretion system protein  28.33 
 
 
715 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.549235 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1538  hypothetical protein  36.61 
 
 
601 aa  110  3e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000607294  hitchhiker  0.000766837 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2815  type II secretion system protein  34.76 
 
 
802 aa  109  6e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2722  type II secretion system protein  28.27 
 
 
807 aa  107  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.722587 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1458  hypothetical protein  27.78 
 
 
625 aa  103  3e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.441143 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2860  type II secretion system protein  26.9 
 
 
678 aa  99.4  7e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2404  type II secretion system protein  29.83 
 
 
300 aa  97.4  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1065  Type II secretion system F domain protein  32.62 
 
 
536 aa  98.2  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0977  type II secretion system protein  27.49 
 
 
680 aa  96.3  5e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2147  type II secretion system protein  27.3 
 
 
679 aa  91.3  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0236165 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0313  type II secretion system protein  32.53 
 
 
625 aa  90.5  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.549227  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3138  Type II secretion system F domain protein  27.05 
 
 
684 aa  88.6  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160866  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0947  Type II secretion system F domain protein  26.79 
 
 
697 aa  84  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0445  type II secretion system protein  25.25 
 
 
604 aa  80.5  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.179017  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0229  type II secretion system protein  25.26 
 
 
582 aa  73.2  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2869  Type II secretion system F domain protein  22.75 
 
 
574 aa  65.5  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43773  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0961  flagellar assembly protein J  23.4 
 
 
581 aa  63.9  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0777  type II secretion system protein  26.19 
 
 
284 aa  62.4  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3411  Type II secretion system F domain protein  21.21 
 
 
577 aa  60.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2569  flagellar assembly protein J  21.32 
 
 
578 aa  60.1  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1648  type II secretion system protein  23.35 
 
 
590 aa  56.6  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.505042  hitchhiker  0.00186987 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1575  flagellar assembly protein J  23.26 
 
 
551 aa  52.8  0.000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00843715  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0494  Type II secretion system F domain protein  22.92 
 
 
658 aa  48.9  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0218  type II secretion system protein  23.05 
 
 
664 aa  47.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.444432  normal  0.0181412 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0651  type II secretion system protein  23.12 
 
 
615 aa  47.4  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.219631 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1317  Type II secretion system F domain protein  21.69 
 
 
554 aa  47  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.89339  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1905  hypothetical protein  38.78 
 
 
65 aa  44.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.454467 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0127  type II secretion system protein  31.37 
 
 
630 aa  44.3  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.887891  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0105  flagellar assembly protein J  23.65 
 
 
534 aa  43.9  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.461814  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0949  flagellar assembly protein J  20.55 
 
 
558 aa  43.9  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0948  flagellar assembly protein J  25.6 
 
 
532 aa  43.5  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0756318  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1641  type II secretion system protein  25 
 
 
352 aa  43.1  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.333542  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1054  type II secretion system protein  24.35 
 
 
351 aa  42.7  0.007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.517581  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1048  type II secretion system protein  24.35 
 
 
351 aa  42.7  0.007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1042  type II secretion system protein  24.35 
 
 
351 aa  42.7  0.007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1036  type II secretion system protein  24.35 
 
 
351 aa  42.7  0.007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>