79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2718 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2718  DNA polymerase, beta-like region  100 
 
 		 109 aa  216  1e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000888869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2347  DNA polymerase beta subunit  41.05 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.048778  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0354  DNA polymerase beta subunit  39.62 
 
 		 105 aa  66.6  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2470  DNA polymerase beta subunit  37.74 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.22963  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3041  DNA polymerase beta subunit  42.53 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1920  DNA polymerase beta subunit  41.94 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388354 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1028  DNA polymerase beta domain protein region  34.91 
 
 		 111 aa  63.5  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000129156  normal  0.703188 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0236  DNA polymerase beta subunit  34.86 
 
 		 103 aa  62.8  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2432  DNA polymerase beta subunit  40.82 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.71469  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1450  DNA polymerase beta subunit  37.74 
 
 		 115 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374866 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1725  DNA polymerase beta subunit  36.94 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000013917  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0606  DNA polymerase beta domain protein region  29.63 
 
 		 105 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000675523 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1020  DNA polymerase beta subunit  36.17 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1577  DNA polymerase, beta-like region  39.22 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241752  normal  0.133279 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2147  DNA polymerase beta domain protein region  36.89 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3962  DNA polymerase beta domain protein region  36.46 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3842  DNA polymerase beta subunit  30.39 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000823006 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4091  DNA polymerase beta subunit  37.65 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.761535  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3922  DNA polymerase beta subunit  30.77 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0657046 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0997  DNA polymerase beta subunit  37.93 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.995341  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0576  DNA polymerase beta subunit  38.71 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.28507 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1363  nucleotidyltransferase, putative  33.33 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00238094  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0040  nucleotidyltransferase domain protein  39.18 
 
 		 128 aa  48.1  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000549944 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0063  nucleotidyltransferase domain protein  39.18 
 
 		 128 aa  48.1  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0102  nucleotidyltransferase domain-containing protein  39.18 
 
 		 128 aa  48.1  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0913883  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0037  nucleotidyltransferase domain-containing protein  37.63 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4127  hypothetical protein  36.9 
 
 		 191 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000129079 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1359  nucleotidyltransferase, putative  33.33 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0365  DNA polymerase beta subunit  35.42 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.200117 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2919  DNA polymerase beta domain protein region  39.39 
 
 		 173 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0317  DNA polymerase beta domain protein region  37.5 
 
 		 121 aa  47.8  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0618  DNA polymerase beta domain protein region  33.73 
 
 		 106 aa  47.4  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.686113  normal  0.81414 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2209  DNA polymerase beta domain protein region  41.43 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0574  DNA polymerase beta subunit  31.68 
 
 		 120 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412375  normal  0.178688 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3846  DNA polymerase beta subunit  40 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000154582  unclonable  0.00000693944 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3436  DNA polymerase beta subunit  37.5 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0076  nucleotidyltransferase domain protein  38.37 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.467951  normal  0.54284 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2191  DNA polymerase beta subunit  37.21 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190588  normal  0.488652 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2316  DNA polymerase beta domain protein region  60 
 
 		 155 aa  45.1  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.763015  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0083  hypothetical protein  32.26 
 
 		 111 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0216  hypothetical protein  33.33 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0242312  hitchhiker  0.0000000000000575833 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4164  DNA polymerase beta domain protein region  53.49 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0697  DNA polymerase beta subunit  31.82 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0468  DNA polymerase beta domain protein region  35 
 
 		 304 aa  43.5  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.651395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5631  DNA polymerase beta domain protein region  36.36 
 
 		 102 aa  43.9  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000350885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0793  DNA polymerase, beta-like region  44.19 
 
 		 110 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.304754 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1392  DNA polymerase beta subunit  37.5 
 
 		 107 aa  43.5  0.0009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.206077  normal  0.55899 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4035  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3225  nucleotidyltransferase domain-containing protein  38.27 
 
 		 166 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00907014  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3858  DNA polymerase beta domain protein region  29.73 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0908144  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1397  DNA polymerase, beta-like region  70.37 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2669  DNA polymerase beta domain protein region  31.4 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3203  DNA polymerase beta subunit  63.33 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1748  DNA polymerase beta subunit  32.38 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000372139  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1619  DNA polymerase beta domain-containing protein region  35.71 
 
 		 105 aa  43.5  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.316623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1617  DNA polymerase beta domain-containing protein region  37.11 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.450393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0218  DNA polymerase beta subunit  42.31 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0524  DNA polymerase beta subunit  37.93 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0053  DNA polymerase beta subunit  50 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0582464  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1643  DNA polymerase beta domain protein region  42 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1301  DNA polymerase beta subunit  36.05 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.452159 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0626  DNA polymerase beta subunit  50 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.717752  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0855  DNA polymerase beta subunit  35.94 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.725816 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1697  DNA polymerase beta subunit  39.68 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00000599045  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1565  DNA polymerase, beta-like region  60.61 
 
 		 111 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0145  hypothetical protein  32.63 
 
 		 131 aa  42  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.345001  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0499  nucleotidyltransferase domain-containing protein  37.04 
 
 		 102 aa  42  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0506  DNA polymerase beta subunit  43.14 
 
 		 121 aa  42  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00399144 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0686  DNA polymerase beta subunit  41.82 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0234  DNA polymerase beta domain protein region  51.11 
 
 		 265 aa  41.6  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.126142  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1476  DNA polymerase beta subunit  46 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3233  nucleotidyltransferase domain protein  37.04 
 
 		 166 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.73519  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4607  DNA polymerase beta domain protein region  36.59 
 
 		 119 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1883  DNA polymerase, beta-like region  30.56 
 
 		 108 aa  40.4  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.230497 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2641  DNA polymerase beta domain protein region  53.57 
 
 		 125 aa  40.4  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1067  DNA polymerase beta subunit  34.18 
 
 		 108 aa  40.4  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.485724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0829  DNA polymerase beta subunit  50 
 
 		 98 aa  40.8  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141069  normal  0.412533 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0718  DNA polymerase beta subunit  36.11 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.525185 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0086  DNA polymerase beta subunit  35.71 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.109385  normal  0.256886 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>