56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1081 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1081  hypothetical protein  100 
 
 		 1107 aa  2292    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.202194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1819  hypothetical protein  47.81 
 
 		 1154 aa  1009    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0470618 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1326  hypothetical protein  50 
 
 		 1141 aa  1095    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.770705  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1709  hypothetical protein  48.33 
 
 		 1154 aa  1021    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.18586  normal  0.0585819 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2756  hypothetical protein  50.6 
 
 		 1162 aa  1142    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.206504  normal  0.110579 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3233  hypothetical protein  42.4 
 
 		 1129 aa  875    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1132  hypothetical protein  47.55 
 
 		 1174 aa  1063    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00035988 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2241  hypothetical protein  46.41 
 
 		 731 aa  615  9.999999999999999e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2238  hypothetical protein  46.42 
 
 		 389 aa  334  4e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0102712 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1895  type IIS restriction enzyme  29.63 
 
 		 612 aa  157  8e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.4814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1608  hypothetical protein  24.82 
 
 		 1182 aa  157  1e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4847  putative restriction enzyme  25.67 
 
 		 1219 aa  149  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000521229  normal  0.767237 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1677  hypothetical protein  27.39 
 
 		 1171 aa  147  9e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114545 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0561  hypothetical protein  27.76 
 
 		 1162 aa  145  4e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5027  type II restriction enzyme  22.63 
 
 		 1180 aa  144  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.776061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02940  hypothetical protein  28.26 
 
 		 1140 aa  143  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.45552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2493  type IIS restriction enzyme  27.14 
 
 		 1183 aa  140  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02930  hypothetical protein  25.44 
 
 		 1131 aa  134  6.999999999999999e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.264298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3731  hypothetical protein  27.32 
 
 		 1174 aa  134  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0339  putative restriction enzyme  25.91 
 
 		 1205 aa  129  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00710778  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0295  type II restriction enzyme  26.63 
 
 		 1167 aa  127  9e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2288  type II restriction enzyme  27.77 
 
 		 1160 aa  127  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2107  hypothetical protein  27.13 
 
 		 1270 aa  124  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0601  hypothetical protein  27.77 
 
 		 1497 aa  121  6e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1235  hypothetical protein  27.77 
 
 		 1484 aa  119  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1156  hypothetical protein  25.54 
 
 		 1324 aa  119  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3080  hypothetical protein  27.35 
 
 		 1425 aa  116  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1299  Eco57I restriction endonuclease  26.94 
 
 		 1144 aa  112  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0387167  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2208  hypothetical protein  29.79 
 
 		 1218 aa  108  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00220427  normal  0.956264 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1916  hypothetical protein  22.02 
 
 		 1430 aa  105  6e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  21.32 
 
 		 1125 aa  88.2  8e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2038  hypothetical protein  20.57 
 
 		 1241 aa  87.8  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.769996  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_260  hypothetical protein  24.59 
 
 		 1359 aa  67.8  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1124  hypothetical protein  26.7 
 
 		 1326 aa  65.1  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0583  hypothetical protein  24.64 
 
 		 882 aa  55.5  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3191  hypothetical protein  21.61 
 
 		 288 aa  53.9  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2953  putative DNA methylase  36.17 
 
 		 1239 aa  52  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.468848  normal  0.142335 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  23.17 
 
 		 1120 aa  50.8  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  23.5 
 
 		 1041 aa  51.2  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0997  hypothetical protein  27.45 
 
 		 706 aa  49.7  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1469  type I restriction-modification system, M subunit, putative  37.31 
 
 		 1002 aa  48.9  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  28.19 
 
 		 974 aa  48.9  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0991  hypothetical protein  32.5 
 
 		 300 aa  48.5  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1545  hypothetical protein  31.82 
 
 		 1195 aa  48.5  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0985179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0114  hypothetical protein  28.23 
 
 		 1231 aa  48.5  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20220  N-6 DNA methylase  35.45 
 
 		 484 aa  47.8  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.644983  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  22.34 
 
 		 995 aa  47.8  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  21.1 
 
 		 1058 aa  47.8  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3315  type II restriction enzyme, methylase subunit  30.99 
 
 		 929 aa  47.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3141  N-6 DNA methylase  27.34 
 
 		 746 aa  47  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7058  hypothetical protein  29.93 
 
 		 1188 aa  45.8  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.48722  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1424  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  33.33 
 
 		 1194 aa  45.4  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4283  hypothetical protein  31.25 
 
 		 1233 aa  45.4  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  35.29 
 
 		 1319 aa  45.1  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0971  putative DNA methylase  29.41 
 
 		 1222 aa  45.1  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  21.11 
 
 		 1612 aa  44.7  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>