More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0532 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_1674  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 325 aa  665    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.954641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0532  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 325 aa  665    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0558  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 325 aa  665    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.6555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1696  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 325 aa  665    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1740  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 325 aa  665    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1724  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 325 aa  665    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3897  dihydrodipicolinate synthetase  46.62 
 
 		 320 aa  297  2e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.63489  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1594  dihydrodipicolinate synthetase  26 
 
 		 317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.299034 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4403  dihydrodipicolinate synthetase  24.92 
 
 		 318 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.210844  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1453  dihydrodipicolinate synthetase  26.76 
 
 		 317 aa  100  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.535565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  29.61 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  28.93 
 
 		 292 aa  75.9  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  31.15 
 
 		 290 aa  75.1  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4271  dihydrodipicolinate synthetase  28.42 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0828  dihydrodipicolinate synthase  26.83 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  28.89 
 
 		 290 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  28.31 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1531  dihydrodipicolinate synthetase family protein  25.68 
 
 		 304 aa  72  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00114549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3387  dihydrodipicolinate synthase  27.47 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1217  dihydrodipicolinate synthetase  23.25 
 
 		 293 aa  71.6  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.881213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4439  dihydrodipicolinate synthetase  27.11 
 
 		 290 aa  71.6  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.609265 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0415  N-acetylneuraminate lyase  25.67 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.275578  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1762  dihydrodipicolinate synthase  25.68 
 
 		 304 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000163874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  25.82 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1479  dihydrodipicolinate synthetase  25.99 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  26.9 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  24.19 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  26.09 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  24.19 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  22.83 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  26.76 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0257  dihydrodipicolinate synthase  23.23 
 
 		 296 aa  68.9  0.0000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.457936  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0921  dihydrodipicolinate synthase  29.67 
 
 		 295 aa  68.9  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3191  dihydrodipicolinate synthase  27.47 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0843  dihydrodipicolinate synthase  28.22 
 
 		 290 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0686751  normal  0.56042 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0987  dihydrodipicolinate synthase  28.22 
 
 		 290 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.193638  normal  0.417753 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1417  putative dihydrodipicolinate synthetase  27.17 
 
 		 300 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000330737  normal  0.0220995 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  27.37 
 
 		 290 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  27.37 
 
 		 290 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3515  dihydrodipicolinate synthase  27.47 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.142026 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  28.02 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2362  dihydrodipicolinate synthase  25.14 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000117821  normal  0.484255 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1160  dihydrodipicolinate synthetase  25.24 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.340867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0827  dihydrodipicolinate synthase  24.59 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.579615  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  24.37 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  24.19 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5586  dihydrodipicolinate synthetase  25 
 
 		 304 aa  67  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.285938  normal  0.789314 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  28.65 
 
 		 297 aa  67  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  26.52 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  28.57 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  25.9 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1449  dihydrodipicolinate synthetase family protein  25.54 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.365355  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2524  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  26.33 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3007  dihydrodipicolinate synthase  29.45 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0527103  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  27.72 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3845  dihydrodipicolinate synthetase  23.6 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2816  dihydrodipicolinate synthase  25.86 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.303791  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2822  dihydrodipicolinate synthetase  25.14 
 
 		 304 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0197523  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  26.35 
 
 		 298 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  29.49 
 
 		 292 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4989  dihydrodipicolinate synthetase  24.41 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3586  dihydrodipicolinate synthase  27.47 
 
 		 297 aa  65.9  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28170  dihydrodipicolinate synthase  25.48 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00641704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  27.78 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  27.98 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5278  dihydrodipicolinate synthetase  23.78 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.995462 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0847  dihydrodipicolinate synthase  24.28 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  26.63 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0124  dihydrodipicolinate synthase  27.61 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.139881  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  26.78 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  25.24 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0882  dihydrodipicolinate synthase  28.22 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  25.67 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3957  dihydrodipicolinate synthetase  23.03 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2542  dihydrodipicolinate synthase  28.22 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0922563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  26.83 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  25.75 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1142  dihydrodipicolinate synthase  26.92 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  29.05 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2517  dihydrodipicolinate synthetase  23.89 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4575  dihydrodipicolinate synthetase  26.25 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3832  N-acetylneuraminate lyase  23.26 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.217271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  25.62 
 
 		 290 aa  62.8  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1432  dihydrodipicolinate synthase  25 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.230305  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0991  dihydrodipicolinate synthase  25.17 
 
 		 290 aa  62.8  0.000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  26.06 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  25.82 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  26.99 
 
 		 292 aa  62.4  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0989  dihydrodipicolinate synthase  26.28 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.484172  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4793  dihydrodipicolinate synthetase  21.61 
 
 		 305 aa  62.4  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11774  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2036  dihydrodipicolinate synthetase  26.22 
 
 		 295 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  27.44 
 
 		 292 aa  62.4  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  26.06 
 
 		 298 aa  62  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  25.15 
 
 		 298 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  25.56 
 
 		 290 aa  62  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  23.79 
 
 		 289 aa  62  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1389  dihydrodipicolinate synthase  27.56 
 
 		 308 aa  62.4  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0873  putative dihydrodipicolinate synthase  26.01 
 
 		 301 aa  62  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.414654 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  23.73 
 
 		 294 aa  62  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4666  dihydrodipicolinate synthetase  25.43 
 
 		 301 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0656669  normal  0.616699 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>