More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3897 on replicon NC_009426
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009426  Saro_3897  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 320 aa  663    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.63489  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0532  dihydrodipicolinate synthetase  46.62 
 
 		 325 aa  282  6.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1696  dihydrodipicolinate synthetase  46.62 
 
 		 325 aa  282  6.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1724  dihydrodipicolinate synthetase  46.62 
 
 		 325 aa  282  6.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1740  dihydrodipicolinate synthetase  46.62 
 
 		 325 aa  282  6.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0558  dihydrodipicolinate synthetase  46.62 
 
 		 325 aa  282  6.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.6555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1674  dihydrodipicolinate synthetase  46.62 
 
 		 325 aa  282  6.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.954641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4403  dihydrodipicolinate synthetase  27.16 
 
 		 318 aa  112  7.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.210844  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1453  dihydrodipicolinate synthetase  26.84 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.535565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1594  dihydrodipicolinate synthetase  24.62 
 
 		 317 aa  107  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.299034 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0847  dihydrodipicolinate synthase  28.11 
 
 		 307 aa  80.5  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  23.51 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  23.51 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  23.51 
 
 		 298 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08690  dihydrodipicolinate synthase  22.9 
 
 		 294 aa  79  0.00000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0207042  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  25.75 
 
 		 292 aa  78.6  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1626  dihydrodipicolinate synthase  24 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0389231  hitchhiker  0.0000523491 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  23.53 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  23.34 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  23.13 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  21.09 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  23.38 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  23.38 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  23.38 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0415  N-acetylneuraminate lyase  24.33 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.275578  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  23.05 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0341  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  25.16 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  23.05 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3164  dihydrodipicolinate synthase  22.3 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  22.8 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3470  dihydrodipicolinate synthase  23.1 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604806  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  26.21 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  26.11 
 
 		 294 aa  72.8  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0258  dihydrodipicolinate synthase  26.78 
 
 		 293 aa  72.4  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2927  dihydrodipicolinate synthase  25.45 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3169  dihydrodipicolinate synthase  25.45 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  22.88 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0991  dihydrodipicolinate synthase  27.87 
 
 		 290 aa  70.9  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339523  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  22.68 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  23.2 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003669  1-pyrroline-4-hydroxy-2-carboxylate deaminase  22.13 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  24.51 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  25.3 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  24.18 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  21.45 
 
 		 294 aa  69.3  0.00000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  24.51 
 
 		 294 aa  69.3  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  25.49 
 
 		 300 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  25.3 
 
 		 298 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0575  dihydrodipicolinate synthase  20.69 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0929  dihydrodipicolinate synthetase  24.25 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.568933 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  22.9 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00780  dihydrodipicolinate synthase  24.4 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.868751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0593  dihydrodipicolinate synthase  21.47 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  24.02 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  23.59 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0828  dihydrodipicolinate synthase  25.44 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  23.05 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02370  dihydrodipicolinate synthase  23.67 
 
 		 292 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3700  dihydrodipicolinate synthase  23.67 
 
 		 292 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2850  dihydrodipicolinate synthase  23.67 
 
 		 292 aa  67  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  25.51 
 
 		 296 aa  67  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1790  dihydrodipicolinate synthase  22.63 
 
 		 290 aa  67  0.0000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2610  dihydrodipicolinate synthase  23.67 
 
 		 292 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2760  dihydrodipicolinate synthase  23.67 
 
 		 292 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2625  dihydrodipicolinate synthase  23.67 
 
 		 292 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1503  dihydrodipicolinate synthase  25.57 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00000230491  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02332  hypothetical protein  23.67 
 
 		 292 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  21.81 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2748  dihydrodipicolinate synthase  23.33 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2634  dihydrodipicolinate synthase  23.33 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2723  dihydrodipicolinate synthase  23.33 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1731  dihydrodipicolinate synthase  25.91 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.457824  normal  0.527965 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  23.38 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2682  dihydrodipicolinate synthase  23.33 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.958571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  23.38 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2855  dihydrodipicolinate synthase  23.33 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.239791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4559  dihydrodipicolinate synthetase  19.93 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  23.7 
 
 		 301 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2568  dihydrodipicolinate synthetase  22.36 
 
 		 304 aa  65.9  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  23.11 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1567  dihydrodipicolinate synthetase  24.21 
 
 		 336 aa  65.9  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1427  dihydrodipicolinate synthase  28.4 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.544407 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0843  dihydrodipicolinate synthase  26.92 
 
 		 290 aa  65.9  0.0000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0686751  normal  0.56042 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0987  dihydrodipicolinate synthase  26.92 
 
 		 290 aa  65.9  0.0000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.193638  normal  0.417753 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  22.51 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1191  dihydrodipicolinate synthase  23.33 
 
 		 292 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1198  dihydrodipicolinate synthase  23.33 
 
 		 292 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1139  dihydrodipicolinate synthase  22.46 
 
 		 292 aa  65.1  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2097  dihydrodipicolinate synthase  26.88 
 
 		 297 aa  65.9  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143233  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0873  putative dihydrodipicolinate synthase  20 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.414654 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2714  dihydrodipicolinate synthetase  23.81 
 
 		 304 aa  65.9  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  23.38 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  22.73 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2475  putative dihydropicolinate synthase family protein  24.76 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0884087  normal  0.0522853 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  24.26 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  23.35 
 
 		 292 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3944  dihydrodipicolinate synthase  24.26 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0494  dihydrodipicolinate synthetase  23.18 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.78772  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2739  dihydrodipicolinate synthetase  22.78 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.145378  normal  0.165925 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  23.05 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>