More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2612 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_2612  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 
273 aa  552  1e-156  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0499  mechanosensitive ion channel  51.25 
 
 
321 aa  243  3e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.979826 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3531  MscS Mechanosensitive ion channel  42.18 
 
 
356 aa  168  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2549  mechanosensitive ion channel MscS  40.09 
 
 
342 aa  167  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7354  mechanosensitive ion channel  36.69 
 
 
337 aa  165  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1334  MscS Mechanosensitive ion channel  42.72 
 
 
335 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1754  MscS mechanosensitive ion channel  39.81 
 
 
879 aa  160  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1277  MscS mechanosensitive ion channel  38.6 
 
 
718 aa  158  8e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.175782  normal  0.44534 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1608  MscS Mechanosensitive ion channel  36.89 
 
 
876 aa  157  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2861  small conductance mechanosensitive channel ion channel  37.08 
 
 
767 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.753072  normal  0.757549 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0186  MscS Mechanosensitive ion channel  36.08 
 
 
304 aa  157  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3563  MscS mechanosensitive ion channel  38.89 
 
 
762 aa  155  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1688  MscS mechanosensitive ion channel  38.14 
 
 
719 aa  155  7e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.265093  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0266  small-conductance mechanosensitive channel-like  33.33 
 
 
505 aa  155  9e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0068339 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3908  putative small-conductance mechanosensitive channel transmembrane protein  37.28 
 
 
771 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.385979 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1728  hypothetical protein  39.07 
 
 
717 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.784062  normal  0.0313644 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5854  hypothetical protein  37.56 
 
 
735 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.213099  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1320  MscS mechanosensitive ion channel  38.6 
 
 
717 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3991  MscS mechanosensitive ion channel  39.07 
 
 
715 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0693455  normal  0.349566 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67630  hypothetical protein  37.07 
 
 
735 aa  149  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1154  MscS mechanosensitive ion channel  36.44 
 
 
442 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4680  MscS mechanosensitive ion channel  35.1 
 
 
837 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1136  MscS Mechanosensitive ion channel  33.09 
 
 
325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0950  MscS mechanosensitive ion channel  36.84 
 
 
787 aa  146  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5420  MscS Mechanosensitive ion channel  32.35 
 
 
889 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0435  MscS mechanosensitive ion channel  34.55 
 
 
288 aa  146  4.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2189  MscS mechanosensitive ion channel  35.1 
 
 
821 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3278  MscS mechanosensitive ion channel  33.47 
 
 
864 aa  145  9e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5311  MscS mechanosensitive ion channel  32.35 
 
 
858 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021896 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2062  MscS mechanosensitive ion channel  35.27 
 
 
747 aa  145  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.237724 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3797  MscS mechanosensitive ion channel  33.47 
 
 
871 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198076  normal  0.260408 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5312  MscS mechanosensitive ion channel  37.07 
 
 
454 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.518656 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1181  hypothetical protein  31.51 
 
 
884 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.40697 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3624  MscS mechanosensitive ion channel  32.11 
 
 
822 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.749548 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4463  MscS mechanosensitive ion channel  32.11 
 
 
822 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141403  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2935  MscS Mechanosensitive ion channel  35.66 
 
 
282 aa  144  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.863949  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3903  MscS mechanosensitive ion channel  32.11 
 
 
822 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4477  MscS mechanosensitive ion channel  34.4 
 
 
772 aa  142  6e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1535  MscS Mechanosensitive ion channel  38.92 
 
 
336 aa  142  8e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.20239  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0940  MscS Mechanosensitive ion channel  32.12 
 
 
293 aa  141  9.999999999999999e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.285938  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1514  MscS mechanosensitive ion channel  37.62 
 
 
836 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.767095  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5033  MscS mechanosensitive ion channel  32.93 
 
 
701 aa  140  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.149124 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1916  MscS mechanosensitive ion channel  32.08 
 
 
308 aa  140  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  35.85 
 
 
344 aa  139  3.9999999999999997e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2666  MscS Mechanosensitive ion channel  31.13 
 
 
911 aa  139  3.9999999999999997e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.232424  normal  0.397707 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3871  MscS mechanosensitive ion channel  34.69 
 
 
674 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0676  mechanosensitive ion channel family protein  33.6 
 
 
767 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11820  small-conductance mechanosensitive channel  36.41 
 
 
336 aa  137  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1378  MscS mechanosensitive ion channel  36.71 
 
 
342 aa  137  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586081  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0602  MscS mechanosensitive ion channel  36.1 
 
 
568 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0823902  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2054  MscS Mechanosensitive ion channel  34.3 
 
 
350 aa  137  3.0000000000000003e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.553207  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3072  MscS mechanosensitive ion channel  32 
 
 
773 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.718015  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1224  MscS Mechanosensitive ion channel  35 
 
 
838 aa  135  6.0000000000000005e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1363  MscS Mechanosensitive ion channel  38.12 
 
 
366 aa  135  9e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.207761  hitchhiker  0.0000810048 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1802  MscS Mechanosensitive ion channel  30 
 
 
753 aa  134  9.999999999999999e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.135784  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3373  MscS Mechanosensitive ion channel  31.91 
 
 
528 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2729  MscS Mechanosensitive ion channel  31.91 
 
 
528 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1833  MscS mechanosensitive ion channel  35.27 
 
 
394 aa  133  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0332  MscS Mechanosensitive ion channel  30.04 
 
 
773 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.323369  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1971  MscS Mechanosensitive ion channel  34.98 
 
 
716 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0170847  normal  0.348628 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24600  small-conductance mechanosensitive channel  34.98 
 
 
337 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.503052  normal  0.13458 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1790  MscS Mechanosensitive ion channel  34.98 
 
 
716 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.192721 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3911  MscS mechanosensitive ion channel  36.89 
 
 
367 aa  132  5e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3536  MscS mechanosensitive ion channel  33.58 
 
 
388 aa  132  7.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0544  MscS mechanosensitive ion channel  34.95 
 
 
787 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1895  small-conductance mechanosensitive ion channel  34.95 
 
 
787 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3001  MscS mechanosensitive ion channel  30.51 
 
 
693 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3068  hypothetical protein  35.14 
 
 
756 aa  130  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.36924 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3421  MscS Mechanosensitive ion channel  31.2 
 
 
299 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0306302  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0853  MscS mechanosensitive ion channel  32.75 
 
 
327 aa  128  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0593395  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0864  MscS mechanosensitive ion channel  32.75 
 
 
327 aa  128  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0847  MscS mechanosensitive ion channel  32.75 
 
 
327 aa  128  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3001  MscS Mechanosensitive ion channel  32.78 
 
 
755 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.996341  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1487  MscS mechanosensitive ion channel  38.01 
 
 
796 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7342  MscS Mechanosensitive ion channel  31.76 
 
 
342 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00546474 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3348  MscS Mechanosensitive ion channel  32.78 
 
 
757 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.703913 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3550  MscS Mechanosensitive ion channel  32.79 
 
 
294 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0571  MscS Mechanosensitive ion channel  29.92 
 
 
260 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000639441  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2401  MscS Mechanosensitive ion channel  32.8 
 
 
718 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0124939 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0901  MscS Mechanosensitive ion channel  31.66 
 
 
766 aa  124  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0181  MscS mechanosensitive ion channel  35.98 
 
 
707 aa  124  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1412  MscS Mechanosensitive ion channel  31.02 
 
 
550 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1188  MscS Mechanosensitive ion channel  36.11 
 
 
549 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3994  hypothetical protein  33.5 
 
 
792 aa  123  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.535307  normal  0.386715 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0610  hypothetical protein  32.2 
 
 
599 aa  123  3e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1457  MscS mechanosensitive ion channel  33.86 
 
 
768 aa  123  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2396  MscS mechanosensitive ion channel  32.94 
 
 
283 aa  122  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000120764  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4634  MscS Mechanosensitive ion channel  31.05 
 
 
334 aa  123  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0333987  normal  0.045581 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1627  MscS mechanosensitive ion channel  32.95 
 
 
881 aa  122  9e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23390  MscS Mechanosensitive ion channel  32.64 
 
 
299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350298  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2784  MscS mechanosensitive ion channel  30.45 
 
 
801 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.582826  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0349  MscS Mechanosensitive ion channel  33.15 
 
 
759 aa  120  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1580  MscS mechanosensitive ion channel  30.86 
 
 
319 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1609  MscS mechanosensitive ion channel  30.86 
 
 
319 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1634  MscS mechanosensitive ion channel  30.86 
 
 
319 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112948  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4017  MscS mechanosensitive ion channel  30.52 
 
 
285 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5270  MscS mechanosensitive ion channel  29.44 
 
 
285 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3795  MscS mechanosensitive ion channel  32.89 
 
 
313 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.840492  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6137  hypothetical protein  29.73 
 
 
725 aa  119  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.119326  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11550  small-conductance mechanosensitive channel  29.43 
 
 
316 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>