More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1490 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_1490  DNA repair and recombination protein RadB  100 
 
 		 213 aa  414  9.999999999999999e-116  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.695224  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1640  DNA repair and recombination protein RadB  77.25 
 
 		 215 aa  327  9e-89  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.301627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0988  DNA repair and recombination protein RadB  75.83 
 
 		 216 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0377224  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0274  DNA repair and recombination protein RadB  75.83 
 
 		 215 aa  324  8.000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.944285  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0285  DNA repair and recombination protein RadB  60.09 
 
 		 213 aa  266  2e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.652849  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1039  DNA repair and recombination protein RadB  42.45 
 
 		 243 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2159  DNA repair and recombination protein RadB  40.09 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2123  DNA repair and recombination protein RadB  40.09 
 
 		 225 aa  149  3e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0260  DNA repair and recombination protein RadB  39.07 
 
 		 224 aa  145  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.92433 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0907  DNA repair and recombination protein RadB  33.64 
 
 		 227 aa  135  3.0000000000000003e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2158  DNA repair and recombination protein RadB  34.56 
 
 		 235 aa  134  7.000000000000001e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1786  DNA repair and recombination protein RadB  35.16 
 
 		 235 aa  134  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.729381  normal  0.0464986 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1272  hypothetical protein  35.81 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.998309 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2453  ATPase  35.65 
 
 		 234 aa  132  5e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.695737 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2429  DNA repair and recombination protein RadB  34.11 
 
 		 226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0926  DNA repair and recombination protein RadB  33.96 
 
 		 221 aa  121  9e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0077  DNA repair and recombination protein RadB  29.96 
 
 		 275 aa  117  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0491  DNA repair and recombination protein RadB  35.98 
 
 		 227 aa  117  9.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1629  DNA repair and recombination protein RadB  33.64 
 
 		 235 aa  115  6.9999999999999995e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.554742  normal  0.462396 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2081  DNA repair and recombination protein RadA  29.82 
 
 		 332 aa  85.5  6e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0713  DNA repair and recombination protein RadA  30.26 
 
 		 330 aa  85.1  7e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.33185 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2310  DNA repair and recombination protein RadA  29.82 
 
 		 333 aa  84.3  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.469487  hitchhiker  0.00856648 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1953  DNA repair and recombination protein RadA  29.82 
 
 		 330 aa  83.2  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1118  DNA repair and recombination protein RadA  33.16 
 
 		 358 aa  77  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17346  predicted protein  28.45 
 
 		 358 aa  73.2  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.908819  normal  0.780808 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1017  DNA repair and recombination protein RadA  29.44 
 
 		 358 aa  68.6  0.00000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.103289  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33041  predicted protein  27.47 
 
 		 343 aa  67.8  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0526282 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1226  DNA repair and recombination protein RadA  28.38 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0009  DNA repair and recombination protein RadA  28.82 
 
 		 324 aa  66.6  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.416037  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01780  meiotic recombination-related protein, putative  28.38 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51774  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1386  DNA repair and recombination protein RadA  29.07 
 
 		 388 aa  63.2  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54533  Rad51 DNA recombination/repair protein  24.49 
 
 		 350 aa  62.8  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.724719  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0368  DNA repair and recombination protein RadA  28.75 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0982  DNA repair and recombination protein RadA  27.78 
 
 		 322 aa  60.1  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1023  Rad51-like  27.23 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.973197  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0537  DNA repair and recombination protein RadA  28.33 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1450  DNA repair and recombination protein RadA  28.44 
 
 		 322 aa  58.9  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0942903  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50387  predicted protein  24.43 
 
 		 351 aa  59.3  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142215  normal  0.0213314 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl206  recombinase A  25.73 
 
 		 346 aa  58.9  0.00000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0469  DNA repair and recombination protein RadA  28.44 
 
 		 322 aa  58.9  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10145  DNA repair protein (Rad57), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12520)  27.93 
 
 		 554 aa  58.9  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.263483 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0762  Fis family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 312 aa  58.9  0.00000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0530008 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2031  Rad51-like protein  28.49 
 
 		 314 aa  58.5  0.00000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000738645 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2099  DNA repair and recombination protein RadA  25.74 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0886  recA protein  22.1 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1606  hypothetical protein  23.94 
 
 		 337 aa  57  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.533727  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0618  recA protein  22.81 
 
 		 347 aa  57.4  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.186792  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0523  recombinase A  25.14 
 
 		 362 aa  57.4  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000473291  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0743  Rad51-like  25.11 
 
 		 250 aa  57  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09092  meiotic recombination protein (Dmc1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02200)  27.72 
 
 		 658 aa  56.6  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.515485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0663  recA protein  23.39 
 
 		 346 aa  56.6  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2033  DNA repair and recombination protein RadA  26.63 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.507845  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0090  recombinase A  23.3 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.999196  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1488  recombination protein RecA  23.94 
 
 		 337 aa  56.6  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1352  recA protein  23.4 
 
 		 337 aa  56.6  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  21.05 
 
 		 343 aa  55.8  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0628  recA protein  20.43 
 
 		 346 aa  55.8  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.067585  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2940  DNA repair and recombination protein RadA  25.74 
 
 		 407 aa  56.2  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00873973  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01237  UvsC protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78579]  25.65 
 
 		 348 aa  55.8  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.523208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0087  RecA/RadA recombinase-like protein  30.82 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.439691 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1255  hypothetical protein  21.93 
 
 		 344 aa  55.5  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000979449  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0360  recA protein  22.65 
 
 		 339 aa  55.1  0.0000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000245068  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2398  recA protein  21.26 
 
 		 428 aa  54.3  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.38659e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1633  Rad51 domain-containing protein  28.65 
 
 		 307 aa  54.3  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.11008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3106  recA protein  21.62 
 
 		 346 aa  54.3  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1396  Fis family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 312 aa  54.7  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.358472  normal  0.485282 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3750  recA protein  20.27 
 
 		 340 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.79987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0400  recombinase A  23.84 
 
 		 387 aa  53.9  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.392545  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1658  recA protein  23.5 
 
 		 377 aa  53.1  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000206716  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1050  recA protein  19.88 
 
 		 349 aa  53.1  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2338  DNA repair and recombination protein RadA  24.62 
 
 		 325 aa  52.8  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.901889  normal  0.0155582 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1162  recA protein  21.62 
 
 		 356 aa  52.4  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.501327  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  18.92 
 
 		 341 aa  52.4  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1338  recombinase A  22.95 
 
 		 364 aa  52.4  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000000600753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  19.88 
 
 		 347 aa  52.4  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  20.95 
 
 		 363 aa  52.4  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3878  recombinase A  21.98 
 
 		 343 aa  52  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000422739  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3629  recombinase A  21.98 
 
 		 343 aa  52  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000256078  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17589  predicted protein  33.33 
 
 		 288 aa  52  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0328752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0584  recombinase A  23.19 
 
 		 385 aa  52  0.000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000230133  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3814  recombinase A  21.98 
 
 		 343 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000388705  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1421  recombinase A  21.98 
 
 		 343 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000173809  normal  0.454678 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2553  recA protein  23 
 
 		 352 aa  51.6  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.159054  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3550  recombinase A  21.43 
 
 		 343 aa  51.6  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000225228  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0355  recA protein  19.59 
 
 		 367 aa  51.6  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0986  recA protein  20.47 
 
 		 356 aa  50.8  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000028976  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  25.98 
 
 		 454 aa  51.2  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54013  chloroplast-targeted nuclear-encoded recombinase  22.86 
 
 		 431 aa  50.8  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.481805  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0040  DNA repair and recombination protein RadA  23.63 
 
 		 327 aa  51.2  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1079  recA protein  22.22 
 
 		 348 aa  50.8  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2431  recombinase A  21.43 
 
 		 343 aa  51.2  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.173685  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1473  RecA protein  18.92 
 
 		 364 aa  50.8  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0213351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1460  recombinase A  22.09 
 
 		 351 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00992179  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0430  DNA repair and recombination protein RadA  24.55 
 
 		 324 aa  51.2  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4925  recombinase A  22.22 
 
 		 358 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.705325  normal  0.253637 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0296  recA protein  22.92 
 
 		 339 aa  50.8  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.197187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2439  recA protein  19.3 
 
 		 347 aa  50.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000566681  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17531  recombinase A  20.71 
 
 		 365 aa  50.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  unclonable  0.00363576  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16811  recombinase A  20.71 
 
 		 367 aa  50.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17691  recombinase A  20.71 
 
 		 365 aa  50.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.757808  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>