More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1846 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1846  hypothetical protein  100 
 
 
321 aa  644    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0246944  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  32.82 
 
 
332 aa  169  8e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1676  hypothetical protein  34.44 
 
 
327 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3124  hypothetical protein  33.74 
 
 
340 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.65371  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2429  hypothetical protein  29.36 
 
 
326 aa  158  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  31.45 
 
 
328 aa  155  7e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0623  hypothetical protein  29.97 
 
 
339 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2463  hypothetical protein  34.68 
 
 
327 aa  152  5e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  30.77 
 
 
331 aa  152  8e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  32.06 
 
 
326 aa  145  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2249  hypothetical protein  30.43 
 
 
325 aa  145  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1625  hypothetical protein  30.43 
 
 
325 aa  145  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  32.71 
 
 
328 aa  144  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4284  hypothetical protein  36 
 
 
335 aa  144  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3214  hypothetical protein  34.89 
 
 
323 aa  143  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  30.77 
 
 
328 aa  142  7e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3588  hypothetical protein  33 
 
 
326 aa  140  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.117868  normal  0.0136594 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4275  extra-cytoplasmic solute receptor  33.64 
 
 
341 aa  139  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0444565  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  31.73 
 
 
321 aa  139  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4598  hypothetical protein  31.19 
 
 
332 aa  139  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  33.33 
 
 
326 aa  139  7e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  31.42 
 
 
328 aa  139  8.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  32.51 
 
 
332 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  31.15 
 
 
331 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1372  hypothetical protein  30.46 
 
 
329 aa  137  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1672  hypothetical protein  34.51 
 
 
326 aa  136  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0669762  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  31.89 
 
 
328 aa  136  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  30.97 
 
 
336 aa  135  8e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  31.17 
 
 
331 aa  135  8e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1011  hypothetical protein  33.07 
 
 
395 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.630289  normal  0.164657 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  33.58 
 
 
329 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  34.66 
 
 
332 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  31.99 
 
 
325 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2356  hypothetical protein  33.21 
 
 
329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.632454  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3910  hypothetical protein  32.33 
 
 
332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.032337  normal  0.0571508 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  32.09 
 
 
327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1427  twin-arginine translocation pathway signal  31.38 
 
 
334 aa  134  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2769  hypothetical protein  31.99 
 
 
322 aa  133  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.455932  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3968  hypothetical protein  33.58 
 
 
328 aa  134  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4947  extra-cytoplasmic solute receptor  32 
 
 
327 aa  133  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.395577  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3493  hypothetical protein  31.69 
 
 
323 aa  134  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.103315 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0102  hypothetical protein  29.43 
 
 
328 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.337169 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0094  hypothetical protein  30.48 
 
 
333 aa  133  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0119  hypothetical protein  29.43 
 
 
328 aa  132  6e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0183  hypothetical protein  30.41 
 
 
333 aa  132  6.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.248413 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4422  hypothetical protein  29.17 
 
 
352 aa  132  6.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386029  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0242  hypothetical protein  33.33 
 
 
325 aa  132  9e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4115  hypothetical protein  30.67 
 
 
336 aa  132  9e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4553  hypothetical protein  32 
 
 
341 aa  132  9e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4494  hypothetical protein  30.21 
 
 
330 aa  132  9e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.125803 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1145  hypothetical protein  33.56 
 
 
325 aa  131  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0298  hypothetical protein  30.27 
 
 
323 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1757  hypothetical protein  29.21 
 
 
325 aa  131  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207491  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5302  hypothetical protein  30.31 
 
 
326 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5303  hypothetical protein  35.02 
 
 
325 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0123034  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5108  hypothetical protein  31.97 
 
 
324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031393  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4356  hypothetical protein  30.34 
 
 
323 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1466  hypothetical protein  32.34 
 
 
335 aa  130  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.652931 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  32.57 
 
 
304 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1755  hypothetical protein  29.81 
 
 
325 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.191519  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5492  hypothetical protein  34.33 
 
 
329 aa  129  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1191  hypothetical protein  33.33 
 
 
335 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0120541  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  30.3 
 
 
337 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  31.35 
 
 
358 aa  129  6e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5050  hypothetical protein  31.54 
 
 
330 aa  129  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4611  hypothetical protein  28.52 
 
 
349 aa  129  6e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3721  extra-cytoplasmic solute receptor  28.62 
 
 
345 aa  129  6e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  32.36 
 
 
326 aa  129  7.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  29.73 
 
 
322 aa  129  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  31.97 
 
 
327 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0228  hypothetical protein  32.97 
 
 
328 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  32.23 
 
 
334 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4541  hypothetical protein  31.99 
 
 
330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  31.79 
 
 
326 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  29.64 
 
 
336 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1070  hypothetical protein  32.08 
 
 
332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.530289  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0288  hypothetical protein  31.02 
 
 
325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3217  hypothetical protein  33.11 
 
 
338 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.388089  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1598  hypothetical protein  31.41 
 
 
330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.667416  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  31.45 
 
 
341 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5610  hypothetical protein  27.59 
 
 
333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  33.33 
 
 
330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  29.6 
 
 
330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  29.78 
 
 
327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  30.26 
 
 
325 aa  127  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4615  hypothetical protein  27.67 
 
 
320 aa  127  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3827  hypothetical protein  28.86 
 
 
330 aa  127  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0498  hypothetical protein  29.61 
 
 
318 aa  127  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2783  hypothetical protein  32.53 
 
 
324 aa  127  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  30.64 
 
 
330 aa  126  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3785  hypothetical protein  30.51 
 
 
362 aa  126  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0141562  normal  0.251227 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1257  hypothetical protein  32.23 
 
 
323 aa  126  5e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.37979  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4169  hypothetical protein  30.48 
 
 
319 aa  126  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.719911  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  29.01 
 
 
328 aa  126  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  30.92 
 
 
333 aa  126  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3917  extra-cytoplasmic solute receptor  30.98 
 
 
328 aa  126  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3789  extra-cytoplasmic solute receptor  31.41 
 
 
326 aa  126  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  30.92 
 
 
336 aa  125  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  30.07 
 
 
328 aa  126  6e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4419  hypothetical protein  29.45 
 
 
321 aa  126  6e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>