More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0623 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0623  hypothetical protein  100 
 
 
339 aa  698    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1846  hypothetical protein  29.97 
 
 
321 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0246944  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  30.06 
 
 
356 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4413  hypothetical protein  34.6 
 
 
302 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.112259  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4211  periplasmic binding protein  30.67 
 
 
324 aa  135  9e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00352553 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03721  conserved hypothetical protein  30.67 
 
 
324 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03670  hypothetical protein  30.67 
 
 
324 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  31.73 
 
 
333 aa  133  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3513  hypothetical protein  27.87 
 
 
333 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  29.14 
 
 
328 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0094  hypothetical protein  29.56 
 
 
333 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  30.86 
 
 
326 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3819  hypothetical protein  30.64 
 
 
318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1436  hypothetical protein  28.71 
 
 
318 aa  130  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779932  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1404  hypothetical protein  30.75 
 
 
328 aa  129  5.0000000000000004e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1842  twin-arginine translocation pathway signal  31.33 
 
 
327 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00400007  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0267  hypothetical protein  29.71 
 
 
337 aa  129  6e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.717963  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0125  hypothetical protein  29.13 
 
 
332 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  29.33 
 
 
329 aa  129  7.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1420  twin-arginine translocation pathway signal  32.12 
 
 
327 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00102429  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1604  hypothetical protein  27.42 
 
 
334 aa  128  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  29.67 
 
 
325 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0298  hypothetical protein  29.67 
 
 
323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  33.46 
 
 
318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0108  hypothetical protein  29.08 
 
 
332 aa  127  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.251449 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  29.84 
 
 
331 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1164  hypothetical protein  27.81 
 
 
332 aa  127  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  32.1 
 
 
322 aa  127  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1918  hypothetical protein  27.58 
 
 
333 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549926  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1712  hypothetical protein  29.01 
 
 
325 aa  126  5e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.407863  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0434  hypothetical protein  28.1 
 
 
327 aa  126  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000234827  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2792  hypothetical protein  28.45 
 
 
346 aa  126  6e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0336  hypothetical protein  29.73 
 
 
330 aa  125  9e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3575  hypothetical protein  28.9 
 
 
336 aa  125  9e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.106202 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  28.92 
 
 
328 aa  124  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0990  twin-arginine translocation pathway signal  26.82 
 
 
332 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.242855  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4197  hypothetical protein  28.14 
 
 
316 aa  123  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504073  normal  0.975042 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5175  hypothetical protein  27.12 
 
 
332 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.573585  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1370  hypothetical protein  31.39 
 
 
338 aa  123  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1696  hypothetical protein  28.14 
 
 
327 aa  123  5e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3789  extra-cytoplasmic solute receptor  28.96 
 
 
326 aa  123  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  31.15 
 
 
330 aa  122  6e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2041  hypothetical protein  34.92 
 
 
320 aa  122  7e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3411  hypothetical protein  25.61 
 
 
330 aa  122  7e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3705  hypothetical protein  28.29 
 
 
337 aa  122  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  28.94 
 
 
326 aa  122  8e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  26.73 
 
 
327 aa  122  9e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  29.77 
 
 
304 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4691  hypothetical protein  29.53 
 
 
324 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4416  hypothetical protein  26.61 
 
 
327 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1958  hypothetical protein  27.97 
 
 
322 aa  122  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.654771  normal  0.486973 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6179  hypothetical protein  29.69 
 
 
323 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  32 
 
 
322 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  28.85 
 
 
322 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2769  hypothetical protein  29.79 
 
 
322 aa  121  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.455932  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  30.19 
 
 
325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2083  hypothetical protein  28.79 
 
 
332 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280461  normal  0.301608 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  28.66 
 
 
320 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3920  extra-cytoplasmic solute receptor  27.58 
 
 
325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00653883  normal  0.672719 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5494  extra-cytoplasmic solute receptor  28.42 
 
 
329 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4137  hypothetical protein  29.87 
 
 
326 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.864349 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2078  hypothetical protein  28.37 
 
 
341 aa  120  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000784829  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0982  hypothetical protein  28.09 
 
 
326 aa  120  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0183  hypothetical protein  28.15 
 
 
333 aa  120  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.248413 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4115  hypothetical protein  26.32 
 
 
336 aa  120  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2777  hypothetical protein  27.63 
 
 
322 aa  120  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.89737  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4275  extra-cytoplasmic solute receptor  28.75 
 
 
341 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0444565  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  31.02 
 
 
325 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  31.02 
 
 
327 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5153  extra-cytoplasmic solute receptor  30.51 
 
 
329 aa  119  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.415379 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2294  hypothetical protein  30.59 
 
 
326 aa  119  6e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000131413  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1767  hypothetical protein  28.78 
 
 
327 aa  119  6e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0125693  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3516  hypothetical protein  29.1 
 
 
318 aa  119  7e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000184229  normal  0.0629404 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  29.87 
 
 
337 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3901  hypothetical protein  30.66 
 
 
325 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1719  hypothetical protein  27.44 
 
 
327 aa  119  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0287751  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2833  hypothetical protein  26.87 
 
 
342 aa  119  9e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.226544  normal  0.225758 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  31.46 
 
 
331 aa  119  9e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1624  hypothetical protein  30.16 
 
 
331 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6081  hypothetical protein  29.61 
 
 
326 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0284  hypothetical protein  27 
 
 
323 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4673  hypothetical protein  27.41 
 
 
344 aa  119  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  30.95 
 
 
338 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  27.91 
 
 
325 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3545  hypothetical protein  28.24 
 
 
350 aa  118  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3799  hypothetical protein  29.48 
 
 
329 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  31.13 
 
 
331 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0693  hypothetical protein  26.33 
 
 
320 aa  118  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4341  extra-cytoplasmic solute receptor  27.61 
 
 
320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  27.8 
 
 
332 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3092  hypothetical protein  28.52 
 
 
328 aa  117  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.23333  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4068  hypothetical protein  29.77 
 
 
315 aa  117  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0498  hypothetical protein  29.55 
 
 
318 aa  117  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6086  hypothetical protein  27.65 
 
 
338 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.859457  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1719  hypothetical protein  27.85 
 
 
326 aa  117  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0711752  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  27.72 
 
 
328 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1162  hypothetical protein  28.49 
 
 
330 aa  117  3.9999999999999997e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0801  hypothetical protein  28.8 
 
 
337 aa  116  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0552  hypothetical protein  30.66 
 
 
332 aa  116  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1971  hypothetical protein  27.2 
 
 
336 aa  116  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.803745  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>