234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1258 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  100 
 
 		 268 aa  528  1e-149  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3570  protein of unknown function DUF218  47.17 
 
 		 264 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  46.21 
 
 		 267 aa  207  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  48.87 
 
 		 262 aa  205  5e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3072  hypothetical protein  46.04 
 
 		 264 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  43.94 
 
 		 280 aa  195  7e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  43.82 
 
 		 267 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3338  hypothetical protein  43.98 
 
 		 264 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2382  hypothetical protein  45.66 
 
 		 264 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371494  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  42.21 
 
 		 268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  43.12 
 
 		 281 aa  182  6e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1136  hypothetical protein  41.83 
 
 		 268 aa  182  6e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2014  hypothetical protein  45.13 
 
 		 235 aa  181  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  45.72 
 
 		 278 aa  177  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  43.66 
 
 		 278 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  44.03 
 
 		 265 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1366  hypothetical protein  41.27 
 
 		 266 aa  169  5e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  39.55 
 
 		 284 aa  166  2.9999999999999998e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  40.98 
 
 		 264 aa  163  3e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6345  hypothetical protein  45.71 
 
 		 273 aa  158  9e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.842525  hitchhiker  0.00886625 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3555  hypothetical protein  44.55 
 
 		 275 aa  150  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3048  hypothetical protein  37.65 
 
 		 280 aa  142  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.09156  normal  0.289832 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0413  hypothetical protein  35.09 
 
 		 272 aa  141  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  34.22 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  34.98 
 
 		 262 aa  139  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3403  hypothetical protein  38.04 
 
 		 280 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  36.4 
 
 		 262 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  33.98 
 
 		 242 aa  106  5e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3103  protein of unknown function DUF218  30.12 
 
 		 256 aa  97.4  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2266  hypothetical protein  32.08 
 
 		 268 aa  94  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2002  hypothetical protein  29.17 
 
 		 254 aa  92.4  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  32.54 
 
 		 237 aa  92.8  6e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  32.54 
 
 		 237 aa  91.7  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  32.61 
 
 		 263 aa  89.7  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1321  hypothetical protein  30.83 
 
 		 282 aa  89.7  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000340007  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  31 
 
 		 260 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  42.54 
 
 		 252 aa  85.9  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  29.66 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0242  hypothetical protein  30.77 
 
 		 272 aa  82.8  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2397  integral membrane protein  30.68 
 
 		 250 aa  81.6  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  32.43 
 
 		 256 aa  81.3  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  31.8 
 
 		 251 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2681  hypothetical protein  29.96 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0996  hypothetical protein  28.89 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490044  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1055  hypothetical protein  29.78 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.102955 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1088  hypothetical protein  29.33 
 
 		 258 aa  78.6  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213248  normal  0.252564 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1104  hypothetical protein  29.33 
 
 		 258 aa  78.6  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0147337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2685  hypothetical protein  34.73 
 
 		 251 aa  78.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0188872  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2201  protein of unknown function DUF218  33.2 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0561041  normal  0.0364927 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2225  hypothetical protein  31.92 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433325  normal  0.444103 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2571  hypothetical protein  33.2 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1023  hypothetical protein  28.89 
 
 		 258 aa  75.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14835  normal  0.458616 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4276  protein of unknown function DUF218  29.75 
 
 		 272 aa  75.9  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  31.15 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  35.71 
 
 		 262 aa  75.5  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  31.15 
 
 		 265 aa  75.5  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0127  protein of unknown function DUF218  32.17 
 
 		 258 aa  73.6  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.703428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0731  hypothetical protein  29.6 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.853147  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2303  hypothetical protein  30.61 
 
 		 258 aa  72.4  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  31.73 
 
 		 214 aa  71.6  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00924  conserved inner membrane protein  26.97 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0692012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2723  protein of unknown function DUF218  26.97 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00143107  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1027  hypothetical protein  26.97 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000464041  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2553  hypothetical protein  28.57 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2201  hypothetical protein  26.97 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000670511  normal  0.151519 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0039  protein of unknown function DUF218  30.91 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1017  hypothetical protein  26.97 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000186844  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00931  hypothetical protein  26.97 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0659639  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1080  hypothetical protein  26.97 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00727998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2676  hypothetical protein  26.97 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000584627  normal  0.41839 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2405  hypothetical protein  27.82 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000200717  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12821  hypothetical protein  29.41 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2202  hypothetical protein  31.49 
 
 		 259 aa  70.5  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2047  hypothetical protein  27.04 
 
 		 282 aa  69.7  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0045  protein of unknown function DUF218  30.81 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.164009 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003938  membrane protein functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  30.59 
 
 		 261 aa  68.9  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0113551  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0668  hypothetical protein  27.41 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0549  protein of unknown function DUF218  28.96 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1775  hypothetical protein  27.04 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0146  lipoprotein transmembrane  30.88 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01585  hypothetical protein  27.78 
 
 		 268 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  30.68 
 
 		 251 aa  67  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1557  hypothetical protein  32.67 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2830  putative lipoprotein transmembrane  32.2 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.160067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2141  protein of unknown function DUF218  33.6 
 
 		 346 aa  65.1  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00423736  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1732  protein of unknown function DUF218  30.5 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000709574  normal  0.252079 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3086  hypothetical protein  29.65 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0886  hypothetical protein  35.06 
 
 		 236 aa  62  0.000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.351499  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1206  hypothetical protein  34.85 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1721  hypothetical protein  26.8 
 
 		 257 aa  62  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.944065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1772  hypothetical protein  28.21 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442971  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1217  hypothetical protein  31.84 
 
 		 219 aa  61.6  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1685  hypothetical protein  30.71 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.730157  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0733  hypothetical protein  30.71 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1601  hypothetical protein  27.94 
 
 		 375 aa  60.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1895  hypothetical protein  30.71 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.845232  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2400  hypothetical protein  30.71 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.115236  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1496  hypothetical protein  27.94 
 
 		 375 aa  60.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2263  hypothetical protein  30.71 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.338192  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0567  hypothetical protein  30.71 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.323416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>