88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0914 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0914  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
335 aa  668    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0621  AP endonuclease domain-containing protein  53.33 
 
 
357 aa  298  1e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0622  AP endonuclease domain-containing protein  53.33 
 
 
322 aa  297  2e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2657  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.04 
 
 
337 aa  233  3e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1015  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.45 
 
 
301 aa  99.4  9e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.382783  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3043  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.48 
 
 
310 aa  93.2  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.524343 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2996  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.08 
 
 
318 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3245  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.3 
 
 
318 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1106  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.03 
 
 
358 aa  83.6  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.673739 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2779  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.86 
 
 
310 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2189  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.89 
 
 
324 aa  82  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.18678 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1778  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.95 
 
 
299 aa  78.6  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0099655  normal  0.734329 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01235  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.36 
 
 
325 aa  75.1  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.201786  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0258  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.96 
 
 
340 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0260  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.96 
 
 
340 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1700  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.69 
 
 
373 aa  73.9  0.000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.119105  normal  0.393122 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4138  hypothetical protein  25.94 
 
 
325 aa  72.4  0.000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21488  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3875  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.93 
 
 
353 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3057  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.62 
 
 
359 aa  70.9  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3207  hypothetical protein  27.76 
 
 
313 aa  69.7  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.204724  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2213  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.96 
 
 
326 aa  69.3  0.00000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1522  hypothetical protein  24.55 
 
 
372 aa  68.6  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.894535  normal  0.0489595 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10258  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.09 
 
 
365 aa  67  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00476343  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2987  YD repeat-containing protein  25.21 
 
 
359 aa  67  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000379614 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3585  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.76 
 
 
353 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1380  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.93 
 
 
355 aa  62.8  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1523  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.28 
 
 
354 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3087  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.4 
 
 
318 aa  61.2  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0757532  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1029  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.54 
 
 
365 aa  61.2  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0708398 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0885  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.54 
 
 
365 aa  61.2  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0197424 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1790  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.68 
 
 
387 aa  60.8  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.194863  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1678  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.59 
 
 
331 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2107  hypothetical protein  25.64 
 
 
367 aa  60.1  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0210  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.27 
 
 
323 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1134  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.46 
 
 
328 aa  57.4  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000366282 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1262  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.69 
 
 
305 aa  56.6  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.338722  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1868  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25 
 
 
335 aa  55.8  0.0000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0536767  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4022  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.75 
 
 
271 aa  55.8  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8349  hypothetical protein  26.59 
 
 
334 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612911  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0945  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.75 
 
 
330 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0928  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.75 
 
 
330 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3537  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.46 
 
 
351 aa  53.1  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.737818 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2500  hypothetical protein  26.69 
 
 
334 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0903661  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4122  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.79 
 
 
326 aa  51.2  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3661  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.67 
 
 
356 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.680606  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.79 
 
 
257 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.45 
 
 
266 aa  49.7  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4164  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.17 
 
 
335 aa  48.5  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427821  normal  0.414907 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2919  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.01 
 
 
312 aa  47  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000384293  hitchhiker  0.000191262 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1514  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.03 
 
 
246 aa  47.4  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.126297 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1034  hypothetical protein  29.27 
 
 
232 aa  46.6  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0699  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.51 
 
 
323 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.803628  normal  0.0194962 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.36 
 
 
808 aa  45.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3086  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.91 
 
 
314 aa  45.8  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0350421  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2679  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.75 
 
 
304 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2893  exodeoxyribonuclease III Xth  28.77 
 
 
269 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4910  exodeoxyribonuclease III Xth  28.18 
 
 
269 aa  45.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0832655  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2407  hypothetical protein  28.57 
 
 
284 aa  45.8  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.286473  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1244  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.38 
 
 
328 aa  45.8  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.54181 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2132  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.63 
 
 
226 aa  45.8  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0281  hypothetical protein  37.17 
 
 
266 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0907  hypothetical protein  34.95 
 
 
257 aa  44.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1072  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.56 
 
 
314 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1092  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2727  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.62 
 
 
246 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.216689  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1139  hypothetical protein  29.03 
 
 
261 aa  45.1  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00207  hypothetical protein  36.19 
 
 
266 aa  44.3  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.149989  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0223  hypothetical protein  36.19 
 
 
266 aa  44.3  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.238641  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.05 
 
 
242 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3399  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.19 
 
 
259 aa  44.3  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0877  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.45 
 
 
255 aa  44.3  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0213  hypothetical protein  36.19 
 
 
259 aa  44.3  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00727672  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0214  hypothetical protein  36.19 
 
 
266 aa  44.3  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.29636  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5450  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.61 
 
 
257 aa  44.3  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3456  hypothetical protein  36.19 
 
 
266 aa  44.3  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.809421  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00202  hypothetical protein  36.19 
 
 
266 aa  44.3  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.154697  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0205  hypothetical protein  36.19 
 
 
259 aa  44.3  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0283  hypothetical protein  37.17 
 
 
266 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0296  hypothetical protein  37.17 
 
 
266 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.979918 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0288  hypothetical protein  37.17 
 
 
266 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0302  hypothetical protein  37.17 
 
 
266 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0221  hypothetical protein  36.19 
 
 
266 aa  44.3  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.040211  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0806  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.45 
 
 
255 aa  44.3  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636912  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0656  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.42 
 
 
348 aa  43.9  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.77 
 
 
245 aa  43.9  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.51669  hitchhiker  0.00270426 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3140  hypothetical protein  28.21 
 
 
262 aa  43.5  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.191577  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2958  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.75 
 
 
331 aa  43.5  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0313395  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2555  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.97 
 
 
257 aa  43.5  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.337597  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24010  metal-dependent hydrolase  27.27 
 
 
286 aa  43.5  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.078651 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>