More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3074 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2731  extracellular solute-binding protein family 5  61.39 
 
 		 622 aa  768    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2277  extracellular solute-binding protein family 5  70.92 
 
 		 615 aa  919    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00527261  decreased coverage  0.000000000210766 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3074  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 621 aa  1269    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000149398  normal  0.300897 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0324  extracellular solute-binding protein  40.07 
 
 		 586 aa  399  1e-109  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.000000261589  hitchhiker  0.0038707 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3501  extracellular solute-binding protein  27.26 
 
 		 639 aa  166  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0093  extracellular solute-binding protein  29.81 
 
 		 604 aa  160  8e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2657  extracellular solute-binding protein  26.29 
 
 		 617 aa  157  6e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000297428  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0197  extracellular solute-binding protein  29.7 
 
 		 605 aa  147  6e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.386701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  27.56 
 
 		 538 aa  145  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.97 
 
 		 538 aa  141  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  26.51 
 
 		 540 aa  137  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  27.47 
 
 		 546 aa  137  7.000000000000001e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0872  extracellular solute-binding protein  26.81 
 
 		 541 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00426332  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5299  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.21 
 
 		 556 aa  134  6e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1563  extracellular solute-binding protein  26.4 
 
 		 588 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176735  normal  0.279007 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  25.83 
 
 		 539 aa  127  9e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0337  extracellular solute-binding protein family 5  24.68 
 
 		 581 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  26.98 
 
 		 533 aa  124  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  25.69 
 
 		 540 aa  124  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2944  extracellular solute-binding protein family 5  25.57 
 
 		 587 aa  124  7e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0305195 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  25.41 
 
 		 534 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  25.34 
 
 		 535 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3496  extracellular solute-binding protein  24.17 
 
 		 590 aa  118  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  27.03 
 
 		 529 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  24.39 
 
 		 528 aa  115  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3133  twin-arginine translocation pathway signal  26.9 
 
 		 529 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4719  extracellular solute-binding protein  25.86 
 
 		 591 aa  114  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42042  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  24.69 
 
 		 509 aa  114  6e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  25.84 
 
 		 562 aa  113  8.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1810  extracellular solute-binding protein  26.02 
 
 		 595 aa  113  9e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1649  extracellular solute-binding protein family 5  26.17 
 
 		 584 aa  112  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1172  family 1 extracellular solute-binding protein  24.69 
 
 		 594 aa  111  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  25.05 
 
 		 559 aa  112  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2321  extracellular solute-binding protein family 5  24.04 
 
 		 580 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.815964 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2270  extracellular solute-binding protein family 5  24.04 
 
 		 580 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0366  extracellular solute-binding protein family 5  25.15 
 
 		 607 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0359  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 		 607 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  25.13 
 
 		 526 aa  109  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  24.03 
 
 		 565 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3490  extracellular solute-binding protein  27.12 
 
 		 529 aa  108  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0936  extracellular solute-binding protein  23.83 
 
 		 526 aa  107  7e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0383  extracellular solute-binding protein  25.53 
 
 		 618 aa  106  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.531894  normal  0.778896 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2857  extracellular solute-binding protein  25.86 
 
 		 593 aa  105  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.358002 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4285  extracellular solute-binding protein  25.09 
 
 		 530 aa  106  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.261799  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1803  extracellular solute-binding protein family 5  24.52 
 
 		 499 aa  104  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0045678  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1663  extracellular solute-binding protein family 5  24.28 
 
 		 578 aa  104  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397427  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1764  extracellular solute-binding protein family 5  24.74 
 
 		 526 aa  103  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2542  extracellular solute-binding protein  26.03 
 
 		 521 aa  102  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0150221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0940  extracellular solute-binding protein family 5  24.84 
 
 		 559 aa  102  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0585  extracellular solute-binding protein family 5  23.53 
 
 		 628 aa  102  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.952367  normal  0.0792841 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2087  extracellular solute-binding protein family 5  24.32 
 
 		 522 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159106  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0982  extracellular solute-binding protein family 5  27.65 
 
 		 567 aa  102  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2814  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.09 
 
 		 521 aa  102  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1277  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1532  extracellular solute-binding protein family 5  26.86 
 
 		 559 aa  101  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0243395 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0947  extracellular solute-binding protein family 5  24.38 
 
 		 622 aa  101  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1169  oligopeptide-binding protein of oligopeptide ABC transporter  24.74 
 
 		 587 aa  101  5e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.317639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0520  extracellular solute-binding protein family 5  25.05 
 
 		 545 aa  100  6e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4386  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.58 
 
 		 529 aa  100  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.775513  hitchhiker  3.14637e-22 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0817  extracellular solute-binding protein  25.26 
 
 		 549 aa  100  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22663  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1000  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.39 
 
 		 529 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  25.32 
 
 		 576 aa  99  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0639  extracellular solute-binding protein family 5  25.97 
 
 		 580 aa  99  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000307469  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4599  extracellular solute-binding protein  24.52 
 
 		 621 aa  99  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.593059  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1886  periplasmic dipeptide transport protein precursor  24.74 
 
 		 525 aa  98.6  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.91526 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1367  extracellular solute-binding protein family 5  25.82 
 
 		 577 aa  98.2  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0090511  hitchhiker  0.000580883 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4764  extracellular solute-binding protein  26.76 
 
 		 539 aa  97.8  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3875  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  24.09 
 
 		 568 aa  97.8  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1913  extracellular solute-binding protein family 5  23.52 
 
 		 535 aa  97.4  7e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.988615  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0822  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.36 
 
 		 528 aa  97.1  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0945  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.95 
 
 		 528 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00751792  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  27.25 
 
 		 516 aa  96.7  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.14 
 
 		 532 aa  96.3  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1789  extracellular solute-binding protein  23.93 
 
 		 572 aa  96.3  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 		 536 aa  95.5  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2564  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.13 
 
 		 542 aa  94.7  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172077  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0273  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  25.56 
 
 		 525 aa  94.4  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2258  solute-binding family 5 protein  25.14 
 
 		 579 aa  94.4  6e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  24.95 
 
 		 544 aa  94.4  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  23.85 
 
 		 508 aa  94  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2555  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, oligopeptide/dipeptide-binding protein  25.14 
 
 		 580 aa  94  7e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0691  extracellular solute-binding protein family 5  24.55 
 
 		 600 aa  92.8  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1837  extracellular solute-binding protein family 5  24.33 
 
 		 532 aa  93.2  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350378  normal  0.136519 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0015  extracellular solute-binding protein family 5  27.42 
 
 		 516 aa  93.2  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0892  extracellular solute-binding protein  22.71 
 
 		 596 aa  93.6  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  23.5 
 
 		 551 aa  93.2  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6297  extracellular solute-binding protein family 5  24.33 
 
 		 537 aa  93.6  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.346111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0391  extracellular solute-binding protein  27.17 
 
 		 522 aa  93.2  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0807  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.54 
 
 		 528 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000107652  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1386  extracellular solute-binding protein  27.72 
 
 		 578 aa  92.4  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.37673  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0996  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.54 
 
 		 528 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.41324e-61 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2161  extracellular solute-binding protein family 5  24.23 
 
 		 532 aa  92.8  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.283164 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0265  oligopeptide-binding protein OppA  21.81 
 
 		 566 aa  92  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1143  extracellular solute-binding protein family 5  27.35 
 
 		 577 aa  92  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0057674  normal  0.283725 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0900  extracellular solute-binding protein family 5  23.21 
 
 		 561 aa  92  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1832  extracellular solute-binding protein family 5  24.31 
 
 		 587 aa  91.3  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2532  extracellular solute-binding protein  24.24 
 
 		 535 aa  91.7  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0567  extracellular solute-binding protein  23.75 
 
 		 608 aa  91.7  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0247  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein, putative  21.81 
 
 		 567 aa  91.3  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.460021  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0803  extracellular solute-binding protein  23.54 
 
 		 529 aa  91.3  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000165149  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1344  extracellular solute-binding protein  25.31 
 
 		 638 aa  91.3  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.439366 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>