More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1789 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0900  extracellular solute-binding protein family 5  73.39 
 
 		 561 aa  858    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1532  extracellular solute-binding protein family 5  64.57 
 
 		 559 aa  796    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0243395 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1420  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  67.2 
 
 		 560 aa  814    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0404  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  64.17 
 
 		 562 aa  784    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.195292  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0940  extracellular solute-binding protein family 5  66.91 
 
 		 559 aa  781    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1789  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 572 aa  1180    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0982  extracellular solute-binding protein family 5  69.18 
 
 		 567 aa  852    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0691  extracellular solute-binding protein family 5  40.59 
 
 		 600 aa  431  1e-119  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0567  extracellular solute-binding protein  38.32 
 
 		 608 aa  412  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0614  extracellular solute-binding protein family 5  39.1 
 
 		 593 aa  410  1e-113  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459899  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0520  extracellular solute-binding protein family 5  37.89 
 
 		 545 aa  403  1e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0585  extracellular solute-binding protein family 5  36.58 
 
 		 628 aa  392  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.952367  normal  0.0792841 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1621  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  36.81 
 
 		 594 aa  385  1e-105  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1765  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  36.19 
 
 		 596 aa  378  1e-103  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.220703  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  30.11 
 
 		 538 aa  206  7e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  29.81 
 
 		 540 aa  198  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  29.02 
 
 		 538 aa  193  7e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  29.27 
 
 		 546 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  28.8 
 
 		 539 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  27.52 
 
 		 534 aa  183  6e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  27.86 
 
 		 533 aa  182  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  28.46 
 
 		 559 aa  177  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  26.27 
 
 		 540 aa  172  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  27.1 
 
 		 576 aa  163  7e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  26.65 
 
 		 565 aa  162  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  25.9 
 
 		 551 aa  154  5e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1538  extracellular solute-binding protein family 5  26.45 
 
 		 563 aa  154  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000498479  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  25.4 
 
 		 557 aa  149  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0359  extracellular solute-binding protein family 5  26.78 
 
 		 607 aa  140  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2657  extracellular solute-binding protein  27.98 
 
 		 617 aa  137  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000297428  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0366  extracellular solute-binding protein family 5  26.12 
 
 		 607 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3501  extracellular solute-binding protein  27.19 
 
 		 639 aa  134  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  25.37 
 
 		 505 aa  134  5e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1649  extracellular solute-binding protein family 5  25.9 
 
 		 584 aa  134  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0639  extracellular solute-binding protein family 5  26.39 
 
 		 580 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000307469  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1651  extracellular solute-binding protein  25.54 
 
 		 516 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1652  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25 
 
 		 511 aa  131  3e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.2387  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1935  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  23.53 
 
 		 511 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0477  extracellular solute-binding protein family 5  23.4 
 
 		 573 aa  128  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0947  extracellular solute-binding protein family 5  26.92 
 
 		 622 aa  128  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0094  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 		 498 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3842  extracellular solute-binding protein family 5  24.08 
 
 		 535 aa  127  6e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.298652  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1450  peptide ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.77 
 
 		 511 aa  125  1e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000430411  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 		 526 aa  124  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4719  extracellular solute-binding protein  24.14 
 
 		 591 aa  124  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7558  putative dipeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  24.59 
 
 		 515 aa  124  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.13 
 
 		 542 aa  123  7e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  24.55 
 
 		 524 aa  123  7e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  25.2 
 
 		 529 aa  123  9e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0910  extracellular solute-binding protein  23.96 
 
 		 555 aa  123  9e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.463169  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1507  extracellular solute-binding protein family 5  23.79 
 
 		 516 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221484  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2906  extracellular solute-binding protein family 5  23.25 
 
 		 574 aa  121  3.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1755  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  22.94 
 
 		 511 aa  120  4.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3843  extracellular solute-binding protein family 5  23.75 
 
 		 530 aa  120  7e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0512301  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1569  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  23.45 
 
 		 511 aa  120  7.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1403  extracellular solute-binding protein family 5  24.86 
 
 		 866 aa  118  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.254941  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  27.14 
 
 		 512 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4056  periplasmic dipeptide transport protein  25 
 
 		 535 aa  118  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0088  4-phytase  25 
 
 		 535 aa  118  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4075  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  25 
 
 		 535 aa  118  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0365  extracellular solute-binding protein family 5  23.63 
 
 		 517 aa  117  5e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  25.44 
 
 		 510 aa  117  5e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 		 544 aa  117  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0426  extracellular solute-binding protein  24.26 
 
 		 522 aa  117  6.9999999999999995e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 		 544 aa  117  6.9999999999999995e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0044  extracellular solute-binding protein family 5  25.49 
 
 		 538 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0219  extracellular solute-binding protein  22.33 
 
 		 575 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2743  extracellular solute-binding protein family 5  23.67 
 
 		 542 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000076574  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.78 
 
 		 532 aa  114  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3133  twin-arginine translocation pathway signal  24.3 
 
 		 529 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  24.25 
 
 		 536 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0671  extracellular solute-binding protein  24.1 
 
 		 534 aa  114  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  23.99 
 
 		 535 aa  114  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  24.91 
 
 		 508 aa  114  7.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2770  extracellular solute-binding protein  26.2 
 
 		 618 aa  113  9e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000172881  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1273  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, peptide-binding protein  22.18 
 
 		 531 aa  113  1.0000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0104885  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0266  extracellular solute-binding protein family 5  22.28 
 
 		 575 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  25.59 
 
 		 528 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  24.13 
 
 		 534 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  22.71 
 
 		 509 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  23.79 
 
 		 505 aa  113  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  25.16 
 
 		 520 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2116  hypothetical protein  22.13 
 
 		 510 aa  112  2.0000000000000002e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  25.56 
 
 		 565 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 		 544 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0044  extracellular solute-binding protein family 5  24.51 
 
 		 535 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4831  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  24.31 
 
 		 527 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153883  normal  0.947205 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1563  extracellular solute-binding protein  24.46 
 
 		 588 aa  111  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176735  normal  0.279007 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0208  extracellular solute-binding protein  20.92 
 
 		 575 aa  112  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7212  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.65 
 
 		 531 aa  111  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0587  extracellular solute-binding protein family 5  26.33 
 
 		 534 aa  110  6e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.05 
 
 		 516 aa  110  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3039  4-phytase  22.01 
 
 		 518 aa  110  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0603  extracellular solute-binding protein family 5  24.01 
 
 		 534 aa  110  7.000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2758  extracellular solute-binding protein family 5  24.95 
 
 		 524 aa  109  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5080  oligopeptide-binding protein OppA  20.48 
 
 		 575 aa  109  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  23.35 
 
 		 535 aa  110  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0245  oligopeptide-binding protein OppA  20.48 
 
 		 575 aa  109  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3845  extracellular solute-binding protein  24.85 
 
 		 564 aa  109  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.267838  normal  0.0712114 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0049  extracellular solute-binding protein family 5  24.46 
 
 		 535 aa  110  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.46848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>