More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1273 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1273  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, peptide-binding protein  100 
 
 
531 aa  1093    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0104885  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0205  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.37 
 
 
575 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0245  oligopeptide-binding protein OppA  24.78 
 
 
575 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  25.28 
 
 
539 aa  162  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 
551 aa  159  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5080  oligopeptide-binding protein OppA  24.85 
 
 
575 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  25.6 
 
 
534 aa  156  8e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  25.96 
 
 
557 aa  154  5.9999999999999996e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.63 
 
 
538 aa  152  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0745  extracellular solute-binding protein  27.44 
 
 
534 aa  150  4e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 
540 aa  151  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0208  extracellular solute-binding protein  24.65 
 
 
575 aa  150  5e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.61 
 
 
510 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  26.34 
 
 
509 aa  148  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  24.34 
 
 
535 aa  148  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  24.29 
 
 
512 aa  147  5e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  25.21 
 
 
540 aa  147  5e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  24.29 
 
 
512 aa  147  5e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  24.29 
 
 
512 aa  147  5e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  25.88 
 
 
520 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  25.25 
 
 
538 aa  145  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0219  extracellular solute-binding protein  23.52 
 
 
575 aa  145  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3103  extracellular solute-binding protein family 5  25.89 
 
 
526 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.529212  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  24.71 
 
 
546 aa  144  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0786  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  27.96 
 
 
537 aa  144  5e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.527095  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5235  extracellular solute-binding protein family 5  27.44 
 
 
522 aa  144  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1507  extracellular solute-binding protein family 5  26.26 
 
 
516 aa  143  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221484  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0477  extracellular solute-binding protein family 5  23.52 
 
 
573 aa  143  8e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  23.75 
 
 
559 aa  142  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0748  extracellular solute-binding protein  26.65 
 
 
535 aa  141  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  22.05 
 
 
517 aa  142  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2758  extracellular solute-binding protein family 5  23.63 
 
 
524 aa  140  4.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0750  extracellular solute-binding protein  26.96 
 
 
535 aa  140  4.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  25.4 
 
 
576 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2834  extracellular solute-binding protein family 5  25.25 
 
 
526 aa  140  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.360597 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6559  extracellular solute-binding protein family 5  27.2 
 
 
536 aa  140  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67626  normal  0.403463 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  26.8 
 
 
509 aa  140  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  25.96 
 
 
510 aa  140  7.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0241  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.01 
 
 
575 aa  140  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  24.23 
 
 
534 aa  139  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  25.58 
 
 
526 aa  139  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0426  extracellular solute-binding protein  26.06 
 
 
522 aa  139  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133353  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1832  extracellular solute-binding protein family 5  25.21 
 
 
587 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315611  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0266  extracellular solute-binding protein family 5  23.08 
 
 
575 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4386  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.76 
 
 
529 aa  137  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.775513  hitchhiker  3.14637e-22 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58360  putative binding protein component of ABC transpor  29.68 
 
 
532 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4250  peptide ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.83 
 
 
528 aa  136  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.146199 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1273  extracellular solute-binding protein family 5  23.82 
 
 
593 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2678  extracellular solute-binding protein  23.68 
 
 
500 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00233729  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  26.45 
 
 
505 aa  136  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1000  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.38 
 
 
529 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7558  putative dipeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  25.25 
 
 
515 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48060  extracellular solute-binding protein  25.66 
 
 
525 aa  135  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  24.03 
 
 
565 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0248  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein, putative  22.91 
 
 
575 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0945  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.29 
 
 
528 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00751792  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3968  extracellular solute-binding protein  26.39 
 
 
537 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.252184  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5037  extracellular solute-binding protein  25.84 
 
 
534 aa  134  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4089  normal  0.963466 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0996  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.9 
 
 
528 aa  134  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.41324e-61 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0807  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.9 
 
 
528 aa  134  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000107652  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0187  extracellular solute-binding protein  27.38 
 
 
529 aa  134  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000120375 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  23.82 
 
 
495 aa  134  5e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  25.15 
 
 
533 aa  134  6e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 
511 aa  133  6.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0671  extracellular solute-binding protein  24.95 
 
 
534 aa  133  7.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0570  extracellular solute-binding protein  25.8 
 
 
591 aa  133  9e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  25.75 
 
 
514 aa  133  9e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0247  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein, putative  24.64 
 
 
567 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.460021  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.47 
 
 
575 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.019765  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0183  extracellular solute-binding protein  28.32 
 
 
532 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  25.38 
 
 
541 aa  133  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0231  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  23.15 
 
 
555 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5416  extracellular solute-binding protein  25.25 
 
 
534 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  23.35 
 
 
515 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1651  extracellular solute-binding protein  25.24 
 
 
516 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  22.84 
 
 
532 aa  132  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3221  extracellular solute-binding protein  26.15 
 
 
517 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102229  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0858  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  24.9 
 
 
528 aa  131  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000478589  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1621  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.81 
 
 
594 aa  131  3e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0908  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  24.9 
 
 
528 aa  131  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000813115  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.65 
 
 
539 aa  131  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6144  extracellular solute-binding protein family 5  26.83 
 
 
533 aa  131  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.5133  hitchhiker  0.00348679 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5193  extracellular solute-binding protein  27.31 
 
 
529 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0587295  normal  0.27415 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1596  extracellular solute-binding protein family 5  22.57 
 
 
572 aa  130  5.0000000000000004e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0368881  unclonable  7.93881e-23 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  25.99 
 
 
524 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  25.88 
 
 
502 aa  130  5.0000000000000004e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  25.93 
 
 
528 aa  130  6e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0207  extracellular solute-binding protein  22.75 
 
 
567 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0218  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  23.55 
 
 
559 aa  130  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0822  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.9 
 
 
528 aa  130  8.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  24.95 
 
 
523 aa  130  8.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 
505 aa  129  9.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0803  extracellular solute-binding protein  24.8 
 
 
529 aa  130  9.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000165149  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4254  extracellular solute-binding protein  26.9 
 
 
527 aa  129  9.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340537  normal  0.123719 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0567  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.79 
 
 
592 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1552  extracellular solute-binding protein  29.84 
 
 
551 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000560356 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  24.9 
 
 
512 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0265  oligopeptide-binding protein OppA  23.54 
 
 
566 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  25.9 
 
 
565 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0566  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.61 
 
 
593 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>