More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1413 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009355  OSTLU_39745  predicted protein  44 
 
 		 1062 aa  810    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1316  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  40.78 
 
 		 1440 aa  718    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0748066 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4105  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  45.65 
 
 		 1035 aa  851    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0996  alpha amylase family protein  39.38 
 
 		 998 aa  640    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  40.44 
 
 		 1891 aa  702    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06650  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  43.4 
 
 		 1248 aa  691    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  46.44 
 
 		 2068 aa  721    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3513  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  42.86 
 
 		 1331 aa  807    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0648874  normal  0.682211 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2488  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  51.53 
 
 		 1176 aa  1018    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.331345 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04828  pullulanase  41.67 
 
 		 1328 aa  746    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01882  putative pullulanase  38.01 
 
 		 1472 aa  643    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0560  putative pullulanase precursor  40.47 
 
 		 1432 aa  711    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.594398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5150  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  43.76 
 
 		 1124 aa  726    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.910447  normal  0.74946 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3074  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  40.78 
 
 		 1440 aa  718    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000101349 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2329  Alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  52.91 
 
 		 991 aa  1025    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0783894  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1941  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  37.69 
 
 		 1450 aa  641    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0096  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  53.73 
 
 		 891 aa  897    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.380747  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  46.84 
 
 		 1855 aa  785    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  46.55 
 
 		 1975 aa  743    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3767  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  52.77 
 
 		 1025 aa  879    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3061  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  49.73 
 
 		 946 aa  844    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57883  normal  0.116697 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1413  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  100 
 
 		 1117 aa  2296    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0287  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  40.54 
 
 		 1441 aa  693    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2712  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  44.49 
 
 		 2156 aa  702    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  51.01 
 
 		 1942 aa  927    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001089  putative pullulanase precursor  41.02 
 
 		 1329 aa  740    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1694  putative pullulanase  37.59 
 
 		 1429 aa  619  1e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2273  pullulanase  44.52 
 
 		 717 aa  563  1.0000000000000001e-159  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19550  pullulanase, type I  30.77 
 
 		 874 aa  386  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0959  pullulanase, type I  30.76 
 
 		 843 aa  377  1e-103  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.557051  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2542  pullulanase  28.81 
 
 		 852 aa  369  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814075  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2498  pullulanase  28.67 
 
 		 852 aa  367  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00309415  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2463  pullulanase  28.57 
 
 		 850 aa  369  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2728  pullulanase  28.81 
 
 		 852 aa  369  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00354349  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2737  putative pullulanase  28.81 
 
 		 852 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.31165e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2786  pullulanase, type I  28.57 
 
 		 848 aa  366  1e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0751626  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0978  pullulanase, type I  30.44 
 
 		 843 aa  365  2e-99  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.912818  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2416  pullulanase, type I  29.38 
 
 		 856 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00697767  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2741  putative pullulanase  28.62 
 
 		 852 aa  355  2e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0379063  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2552  putative pullulanase  29.06 
 
 		 852 aa  353  1e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000407246  decreased coverage  0.0000000000706623 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2331  pullulanase, type I  33.11 
 
 		 647 aa  352  2e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2304  pullulanase, type I  32.99 
 
 		 1043 aa  351  4e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2761  pullulanase, putative  27.9 
 
 		 848 aa  342  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00586404  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  28.71 
 
 		 2638 aa  342  2.9999999999999998e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1522  pullulanase precursor  30.54 
 
 		 655 aa  341  4e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0360874  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1427  pullulanase, type I  27.85 
 
 		 841 aa  338  2.9999999999999997e-91  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.671793  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0609  pullulanase, type I  33.11 
 
 		 1136 aa  337  7e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0459  pullulanase, type I  27.2 
 
 		 842 aa  335  2e-90  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.712908  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1803  pullulanase, type I  30.24 
 
 		 655 aa  335  3e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.248563  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13880  pullulanase, type I  31.86 
 
 		 640 aa  331  4e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0061  pullulanase, type I  28.69 
 
 		 899 aa  322  3e-86  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1558  pullulanase precursor  30.31 
 
 		 1064 aa  308  3e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.430377  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1839  putative pullulanase  30.31 
 
 		 1064 aa  307  6e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0057  pullulanase, type I  31.41 
 
 		 928 aa  298  4e-79  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  29.05 
 
 		 1888 aa  294  6e-78  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0681  pullulanase, type I  31.72 
 
 		 718 aa  291  3e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0448  pullulanase, type I  30.38 
 
 		 825 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4837  putative pullulanase  27.32 
 
 		 713 aa  282  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.837132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4434  pullulanase  27.45 
 
 		 713 aa  282  3e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4844  pullulanase, putative  27.32 
 
 		 713 aa  281  6e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4597  pullulanase  27.45 
 
 		 713 aa  281  7e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4953  pullulanase  27.45 
 
 		 713 aa  281  7e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4819  putative pullulanase  27.45 
 
 		 713 aa  279  2e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4452  pullulanase  27.32 
 
 		 713 aa  278  4e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0422  putative pullulanase  27.24 
 
 		 713 aa  274  6e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4533  pullulanase, type I  27.54 
 
 		 713 aa  273  1e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4814  putative pullulanase  26.98 
 
 		 713 aa  271  4e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0421  pullulanase, type I  32.55 
 
 		 601 aa  266  2e-69  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3365  pullulanase, type I  28 
 
 		 712 aa  264  6e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1298  pullulanase, type I  30.44 
 
 		 669 aa  254  9.000000000000001e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0852  pullulanase, putative  29.17 
 
 		 766 aa  251  6e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.865256  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0872  pullulanase, type I  25.46 
 
 		 640 aa  239  3e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1216  pullulanase, putative  26.63 
 
 		 1252 aa  223  1.9999999999999999e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0305928  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0868  pullulanase, extracellular  27.07 
 
 		 776 aa  200  1.0000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2907  alpha amylase catalytic subunit  61.68 
 
 		 715 aa  136  3e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.245602 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3828  glycoside hydrolase family 13 protein  25.54 
 
 		 817 aa  133  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535052 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6067  glycogen debranching enzyme GlgX  25 
 
 		 701 aa  132  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0573704  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7550  glycogen debranching enzyme GlgX  25.91 
 
 		 702 aa  125  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317676  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  24.64 
 
 		 721 aa  125  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2956  glycogen debranching enzyme GlgX  23.15 
 
 		 697 aa  120  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.490165 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0419  glycogen debranching enzyme GlgX  23.95 
 
 		 696 aa  120  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6129  glycogen debranching enzyme GlgX  24.8 
 
 		 717 aa  118  7.999999999999999e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.872744 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6811  glycogen debranching enzyme GlgX  25.16 
 
 		 702 aa  117  8.999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.37065 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1885  glycogen debranching enzyme GlgX  24.96 
 
 		 727 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1070  glycogen debranching enzyme GlgX  26.3 
 
 		 802 aa  117  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.661135 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0681  glycogen debranching enzyme GlgX  23.72 
 
 		 700 aa  116  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0733  glycogen debranching enzyme GlgX  25.51 
 
 		 704 aa  115  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1695  pullulanase-like glycosidase  25.36 
 
 		 846 aa  114  8.000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.195322  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1401  glycogen debranching protein GlgX  23.4 
 
 		 701 aa  114  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1106  glycogen debranching enzyme GlgX  24.43 
 
 		 711 aa  113  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.546818  normal  0.380802 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1088  glycogen debranching enzyme GlgX  22.26 
 
 		 718 aa  113  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.231339 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1306  glycogen debranching enzyme GlgX  25.68 
 
 		 720 aa  112  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.348446 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2700  glycogen debranching enzyme GlgX  23.47 
 
 		 845 aa  112  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0396  glycogen debranching enzyme GlgX  22.22 
 
 		 726 aa  112  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.153348  normal  0.926984 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1775  glycogen debranching enzyme GlgX  24.68 
 
 		 701 aa  111  7.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.318288  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1740  glycogen debranching protein GlgX  23.94 
 
 		 706 aa  111  8.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152679  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16760  glycogen debranching enzyme GlgX  25.58 
 
 		 709 aa  111  8.000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  24.8 
 
 		 1464 aa  111  9.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3439  glycogen debranching enzyme GlgX  22.4 
 
 		 708 aa  110  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000156565 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1782  glycogen debranching enzyme GlgX  23.18 
 
 		 688 aa  110  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>