More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1354 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1354  peptidase S41  100 
 
 
367 aa  732    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.405316  normal  0.73839 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0351  peptidase S41  61.9 
 
 
336 aa  385  1e-106  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  28.05 
 
 
429 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3650  carboxyl-terminal protease  31.25 
 
 
426 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000241587  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  26.58 
 
 
428 aa  87.8  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0604  carboxyl-terminal protease  26.7 
 
 
440 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4518  C-terminal processing peptidase-2  25.71 
 
 
430 aa  87  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2258  carboxyl-terminal protease  39.19 
 
 
421 aa  86.7  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0647499  unclonable  0.0000000459659 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2615  peptidase S41  30.7 
 
 
427 aa  85.9  9e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1178  peptidase S41A, C-terminal protease  37.13 
 
 
444 aa  85.9  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  35.63 
 
 
427 aa  81.6  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0712  C-terminal processing peptidase-2  34.66 
 
 
425 aa  80.9  0.00000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0280534  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4255  carboxyl-terminal protease  36.05 
 
 
430 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4316  carboxyl-terminal protease  36.05 
 
 
430 aa  80.1  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000068708  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2406  C-terminal processing peptidase-2  34.73 
 
 
434 aa  80.1  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.304858 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0104  peptidase S41  27 
 
 
389 aa  79.7  0.00000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0516  C-terminal processing peptidase-2  34.36 
 
 
440 aa  79.3  0.00000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.484387  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0662  carboxyl-terminal protease  29.37 
 
 
547 aa  78.2  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1589  carboxyl-terminal protease  35.85 
 
 
458 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1614  carboxyl-terminal protease  35.85 
 
 
458 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4901  carboxyl-terminal protease  25.72 
 
 
410 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.972047 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  36.59 
 
 
444 aa  77.8  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1729  carboxyl-terminal protease  33.82 
 
 
396 aa  77  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  35.9 
 
 
447 aa  77  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09070  C-terminal processing peptidase  32.1 
 
 
419 aa  77  0.0000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.10263 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  37.59 
 
 
444 aa  76.6  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2991  carboxyl-terminal protease  34.36 
 
 
446 aa  76.3  0.0000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1994  C-terminal processing peptidase  36.43 
 
 
404 aa  75.9  0.0000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.72907  normal  0.0163388 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0582  carboxyl-terminal protease  33.52 
 
 
423 aa  76.3  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000258351  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4004  carboxyl-terminal protease  38.75 
 
 
399 aa  75.5  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07301  carboxyl-terminal processing protease  25.07 
 
 
444 aa  75.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0058  C-terminal processing peptidase  33.15 
 
 
398 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.871061  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  32.52 
 
 
446 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0299  C-terminal processing peptidase-2  32.53 
 
 
431 aa  75.1  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  33.33 
 
 
429 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  31.86 
 
 
440 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0677  carboxyl-terminal protease  34.38 
 
 
444 aa  74.3  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.994343  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07321  carboxyl-terminal processing protease  33.75 
 
 
444 aa  74.7  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.587372  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2346  carboxyl-terminal protease  25.76 
 
 
409 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  36.96 
 
 
456 aa  73.9  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  30.73 
 
 
471 aa  73.9  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  36.49 
 
 
458 aa  73.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  36.23 
 
 
423 aa  73.6  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  36.23 
 
 
457 aa  73.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  32.97 
 
 
428 aa  73.2  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  28.81 
 
 
453 aa  72.8  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1299  carboxyl-terminal protease  35.15 
 
 
449 aa  72.8  0.000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0877  carboxyl-terminal protease  31.44 
 
 
417 aa  72.8  0.000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  32.95 
 
 
379 aa  72.8  0.000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1251  peptidase S41  37.13 
 
 
483 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2052  carboxyl-terminal protease  36.84 
 
 
416 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.774311 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  36.69 
 
 
451 aa  72.4  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0620  carboxyl-terminal protease  37.42 
 
 
413 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.210968  normal  0.919859 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0605  carboxyl-terminal protease  37.42 
 
 
413 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4069  carboxyl-terminal protease  35.04 
 
 
423 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.686351 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_3061  predicted protein  25.71 
 
 
356 aa  72  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  33.72 
 
 
440 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  33.72 
 
 
440 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  30.77 
 
 
439 aa  71.2  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  33.89 
 
 
440 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  33.72 
 
 
440 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3021  carboxyl-terminal protease  32.39 
 
 
472 aa  71.2  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.846777  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3471  carboxyl-terminal protease  34.64 
 
 
710 aa  71.2  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.723449  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  37.01 
 
 
445 aa  71.2  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3963  carboxyl-terminal protease  34.18 
 
 
383 aa  70.9  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000206146  hitchhiker  0.00000000432275 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14351  carboxyl-terminal processing protease  31.02 
 
 
453 aa  70.9  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1138  C-terminal processing peptidase-2  32.99 
 
 
412 aa  71.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00750441 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  32.14 
 
 
434 aa  71.2  0.00000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  36.3 
 
 
450 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2857  peptidase S41  35.93 
 
 
482 aa  70.5  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0414  carboxyl-terminal protease  38.36 
 
 
416 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  32.47 
 
 
462 aa  70.5  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0043  C-terminal processing peptidase-3  32.43 
 
 
401 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000408883 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0042  C-terminal processing peptidase-3  33.54 
 
 
572 aa  70.5  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  35.25 
 
 
451 aa  70.1  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0041  C-terminal processing peptidase-3  33.33 
 
 
401 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.660161  hitchhiker  0.00325128 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0049  C-terminal processing peptidase-3  33.33 
 
 
401 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000124234 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  32.03 
 
 
443 aa  70.5  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4514  carboxyl-terminal protease  35.33 
 
 
447 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000295237  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  28.77 
 
 
441 aa  70.1  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4472  C-terminal processing peptidase  32.08 
 
 
401 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0890612  hitchhiker  0.000000524725 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0490  carboxyl-terminal protease  33.75 
 
 
400 aa  69.7  0.00000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1705  carboxyl-terminal protease  27.03 
 
 
413 aa  69.7  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.880099  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07501  carboxyl-terminal processing protease  31.87 
 
 
433 aa  69.7  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  34.9 
 
 
433 aa  69.7  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  32.12 
 
 
444 aa  69.3  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0047  carboxyl-terminal protease, putative  33.54 
 
 
402 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  32.21 
 
 
440 aa  68.9  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  32.62 
 
 
440 aa  68.9  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3957  peptidase S41  36.2 
 
 
457 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.604883  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0110  C-terminal processing peptidase-2  32.02 
 
 
434 aa  68.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.196179  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  32.79 
 
 
457 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  35 
 
 
444 aa  68.6  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07361  carboxyl-terminal processing protease  32.02 
 
 
434 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00775451 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05520  C-terminal processing peptidase  32.85 
 
 
424 aa  68.2  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4219  carboxyl-terminal protease  33.57 
 
 
401 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_308  carboxyl-terminal protease  35.03 
 
 
377 aa  68.2  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000103744  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0923  carboxyl-terminal protease  34.91 
 
 
434 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0184  carboxyl-terminal protease  30.49 
 
 
442 aa  67.4  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07911  carboxyl-terminal processing protease  35.67 
 
 
450 aa  67.8  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.424526  normal  0.0109245 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>